New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 5817927 = | 105 (1.130) | 5 (0.060) | 5/236 | NT | 5.1% | coding (83/1011 nt) | pilT | twitching motility protein |
? | NC_002947 | 5817979 = | 88 (1.000) | coding (31/1011 nt) | pilT | twitching motility protein |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
TCCAGCACGCTGGCCATGCCCTCGATCAAGGCACCCTGGCTCAACGGCGGCAAGCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCATGTCCACCCTAGCAGACAACCTTTCCGCGATTTCCGCCCGTATCGCCAGTGCTGCCCAGGCAGT > NC_002947/5817831‑5818127 | tCCAGCACGCTGGCCATGCCCTCGATCAAGGCACCCTGGCTCAACGGCGGCAAGCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAAc > 2:102417/1‑150 (MQ=255) cAGCACGCTGGCCATGCCCTCGATCAAGGCACCCTGGCTCAACGGCGGCAAGCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAg > 1:2234078/1‑150 (MQ=255) gtggacatggatcgatgccggcagctgtggggtctgcggcattctacctgcttgaaggcctttggggagtcttatggatgtgaccgacctgtTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAggt > 2:1272338‑M1/93‑150 (MQ=255) gCACGCTGGCCATGCCCTCGATCAAGGCACCCTGGCTCAACGGCGGCAAGCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAggt > 1:867401/1‑150 (MQ=255) gCACGCTGGCCATGCCCTCGATCAAGGCACCCTGGCTCAACGGCGGCAAGCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAggt > 2:318541/1‑150 (MQ=255) cACGCTGGCCATGCCCTCGATCAAGGCACCCTGGCTCAACGGCGGCAAGCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAggtc < 1:102417/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCATGCCCTCGATCAAGGCACCCTGGCTCAACGGCGGCAAGCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTTCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAggtcggt > 2:1530705/1‑150 (MQ=255) tGGCCATGCCCTCGATCAAGGCACCCTGGCTCAACGGCGGCAAGCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTca > 1:2164522/1‑150 (MQ=255) tGGCCATGCCCTCGATCAAGGCACCCTGGCCCAACGGCGGCAAGCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTca > 2:927388/1‑150 (MQ=255) gCCATGCCCTCGATCAAGGCACCCTGGCTCAACGGCGGCAAGCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCTCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTcaca < 2:1277450/150‑1 (MQ=255) ccATGCCCTCGATCAAGGCACCCTGGCTCAACGGCGGCAAGCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACAt < 2:1324088/150‑1 (MQ=255) ccTCGATCAAGGCACCCTGGCTCAACGGCGGCAAGCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATaa > 1:2013614/1‑150 (MQ=255) cTCGATCAAGGCACCCTGGCTCAACGGCGGCAAGCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAg > 2:1541787/1‑150 (MQ=255) cTCGATCAAGGCACCCTGGCTCAACGGCGGCAAGCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAg > 2:1890027/1‑150 (MQ=255) cTCGATCAAGGCACCCTGGCTCAACGGCGGCAAGCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAg > 2:4632/1‑150 (MQ=255) cTCGATCAAGGCACCCTGGCTCAACGGCGGCAAGCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAg > 2:1005302/1‑150 (MQ=255) tCGATCAAGGCACCCTGGCTCAACGGCGGCAAGCCCATACGCTGCAACTCGCAAACTAGGTTCTGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGa > 2:684110/1‑150 (MQ=255) gATCAAGGCACCCTGGCTCAACGGCGGCAAGCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAggtcggt > 2:1036420/1‑135 (MQ=255) 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cggcggCAAGCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAgg < 1:1152573/150‑1 (MQ=255) cggcAAGCCCATCCGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTTATGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCaactaa < 2:223762/150‑6 (MQ=255) aaGCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATg < 2:2173425/150‑1 (MQ=255) gCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCCCATCCATCAGACACCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGcc < 1:2263124/150‑1 (MQ=255) gCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGcc < 1:815520/150‑1 (MQ=255) 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cTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCATGTCCACCCTAGCAGACAACCTTTCCGCGATTTcc > 1:1372526/1‑150 (MQ=255) tGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCATGTCCACCCTAGCAGACaa < 1:1323746/133‑1 (MQ=255) tGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAAACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCATGTCCACCCTAGCAGACaa > 2:1323746/1‑133 (MQ=255) gAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCa > 2:756484/1‑113 (MQ=255) gAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCa < 1:756484/113‑1 (MQ=255) cttcagacctgcacctggcgacgggccaACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCATGTCCACCCTAGCAGACAACCTTTCCGCGATTTCCGc < 2:2284279‑M2/122‑1 (MQ=255) aaGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCATGTCCACCCTAGCAGACAACCTTTCCGCGATTTCCGcc < 2:1531789/150‑1 (MQ=255) gCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGGCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCAGGTCCACCCTAGCAGACAACCTTTCCGCGATTTCCGCCCg > 2:1406142/1‑150 (MQ=255) ccGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCATGTCCACCCTAGCAGACAAc > 2:2446831/1‑126 (MQ=255) ccGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCATGTCCACCCTAGCAGACAAc < 1:2446831/126‑1 (MQ=255) ccGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCATGTCCACCCTAGCAGACAACCTTTCCGCGATTTCCGCCCGTATc > 1:607202/1‑150 (MQ=255) ccGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCATGTCCACCCTAGCAGACAACCTTTCCGCGATTTCCGCCCGTATc > 1:1996781/1‑150 (MQ=255) aTCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCATGTCCACCCTAGCAGACAACCTTTCCGCGATTTCCGCCCGTATCGCCa < 2:2380554/150‑1 (MQ=255) cacaGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCTCATAGGGCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCATGTCCACCCTAGCAGACAACCTTTCCGCGATTTCCGCCCGTATCGCCAGtg > 1:416068/1‑150 (MQ=255) acaGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCgg < 2:1628501/88‑1 (MQ=255) acaGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCgg > 1:1628501/1‑88 (MQ=255) acaGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCATGTCCACCCTAGCAGACAACCTTTCCGCGATTTCCGCCCGTATCGCCAGtgc > 1:818966/1‑150 (MQ=255) acaGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCATGTCCACCCTAGCAGACAACCTTTCCGCGATTTCCGCCCGTATCGCCAGtgc > 2:4550/1‑150 (MQ=255) gCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCATGTCCACCCTAGCAGACAACCTTTCCGCGATTTCCGCCCGTATCGCCAGtgctgc < 1:1097269/150‑1 (MQ=255) cTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCCTGGTGCTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCATGTCCACCCTAGCAGACAACCTTTCCGCGATTTCCGCCCGTATCGCCAGTGCTGcc > 1:62221/1‑150 (MQ=255) cTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCATGTCCACCCTAGCAGACAACCTTTCCGCGATTTCCGCCCGTATCGCCAGTGCTGcc < 2:2427481/150‑1 (MQ=255) gccaACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCATGTCCACCCTAGCAGACAACCTTTCCGCGATTTCCGCCCGTATCGCCAGTGCTGCCCAGGc < 2:1414788‑M2/146‑1 (MQ=255) aACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCATGTCCACCCTAGCAGACAACCTTTCCGCGATTTCCGCCCGTATCGCCAGTGCTGCCCAGGCAGt > 1:391650‑M2/2‑150 (MQ=255) | TCCAGCACGCTGGCCATGCCCTCGATCAAGGCACCCTGGCTCAACGGCGGCAAGCCCATACGCTGCAACTCGCCATCCAGGCGCAGCATCGGAATCTGGCCCGTCGCCAGGTGCAGGTCTGAAGCCCCCGCATCCACAGCTCGGGCCAACAGGTCGGTCACATCCATAAGACTCCCCAAAGGCCTTCAAGCAGGTAGAATGCCGCAGACCCCACAGCTGCCGGCATCGATCCATGTCCACCCTAGCAGACAACCTTTCCGCGATTTCCGCCCGTATCGCCAGTGCTGCCCAGGCAGT > NC_002947/5817831‑5818127 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |