New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 5843224 = | 70 (0.780) | coding (296/486 nt) | PP_5121 | hypothetical protein |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
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tGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTATGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAACTGCTGCAAATGGCCt > 1:243870/1‑150 (MQ=255) gACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAACTGCTGCAAATGGCCTg < 2:1527473/150‑1 (MQ=255) tC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGaa > 1:1487625/1‑96 (MQ=255) tC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAACTGCTGCAAATGGCCTggcc > 1:635636/1‑148 (MQ=255) tC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAACTGCTGCAAATGGCCTGGTa > 2:1632475/1‑150 (MQ=255) tC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAACTGCTGCAAATGGCCTGGTa > 2:1004152/1‑150 (MQ=255) ggCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGTCACTCCTCGTTGCTGCAACTGCTGCAAATGGCCTGGTACGaa < 1:1004152/150‑1 (MQ=255) ggCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAACTGCTGCAAATGGCCTggcacagg < 2:635636/150‑7 (MQ=255) ggCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAACTGCTGCAAATGGCCTGGTACGaa < 1:2406758/150‑1 (MQ=255) ggCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAACTGCTGCAAATGGCCTGGTACGaa < 2:2211661/150‑1 (MQ=255) ggCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAACTGCTGCAAATGGCCTGGTACGaa > 2:543837/1‑150 (MQ=255) gCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATgg < 1:420009/105‑1 (MQ=255) gCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATgg > 2:420009/1‑105 (MQ=255) cccGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAACTGCTGCAAATGGCCTGGTACGAACg > 1:260457/1‑150 (MQ=255) ccGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGc < 1:738318/85‑1 (MQ=255) ccGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGc > 2:738318/1‑85 (MQ=255) gctgaCCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAACTGCTGCAAATGGCCTg < 2:1545388‑M2/133‑1 (MQ=255) gctgaCCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAACTGCTGCAAATGGCCTGGTACGAACGccc < 1:1676011‑M2/145‑1 (MQ=255) gaCCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAACTGCTGCAAATGGCCTGGTACGAACGCCCCGa < 2:420822‑M2/148‑1 (MQ=255) gaCCGGCGTATGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAACTGCTGCAAATGGCCTGGTACGAACGCCCCGa > 2:1856865‑M2/3‑150 (MQ=255) aCCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAACTGCTGCAAATGGCCTGGTACGAACGCCCCGaa < 1:754778‑M2/149‑1 (MQ=255) ccGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAACTGCTGCAAATGGCCTGGTACGAACGCCCCGAAt < 2:219175/150‑1 (MQ=255) | CCGGTGGTCCTGGCCGGTACACAGGCCACCGATGCGCCGGTGTTGCGCAGCCTCGACAACAAGCTGGCGTCGTTGTCGCCGGAAATGCTCAAGCTCACCCGGCAATTGTTCGACGTGCTCAGCCTGCCGCTGACTC‑GCGGCCCGCTGACCGGCGTCTGGGGCAGCTGGGGCCAAGCTGGCGCCACGCAGGTCACGGCGTTCCTGCAACGCTGGCAGGACAGCTCGCTGAACCTGCTACGCATGGGGCACGCCTCGTTGCTGCAACTGCTGCAAATGGCCTGGTACGAACGCCCCGAAT > NC_002947/5843076‑5843373 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |