| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | NC_002947 | 1,844,516 | Δ70 bp | coding (251‑320/2754 nt) | gacS ← | sensor protein GacS |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_002947 | 1844516 | 1844585 | 70 | 291 [0] | [0] 293 | gacS | sensor protein GacS |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 1844515 | 0 (0.000) | 286 (1.280) | 134/284 | 0.1 | 100% | coding (321/2754 nt) | gacS | sensor protein GacS |
| ? | NC_002947 | 1844586 = | 0 (0.000) | coding (250/2754 nt) | gacS | sensor protein GacS | |||||
Only 100 of 291 total aligned reads displayed.
AGCTCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1844366‑1844515‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGGGTGCGCAGGTCGTTCTGT > NC_002947/1844586‑1844734 AGCTCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTG > 2:3012890/1‑150 CTCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCG > 2:4110927/1‑150 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2:3840472/1‑150 TACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCG > 2:2929973/1‑150 CCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCC > 2:3093805/1‑150 CCAGCACAGCAGGCGATCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGTCCGAAAACTGGAATCAGGTAGCGGGTGGAGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCC > 2:3747409/1‑150 GCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGC > 2:4513170/1‑150 AGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCA < 2:1556356/150‑1 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1:3158100/150‑1 GCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGG < 2:522293/150‑1 TTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCA > 2:3858888/1‑150 TCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAA < 1:5051043/150‑1 CGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGACAAT > 2:2309571/1‑150 GCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTTGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTG > 2:688034/1‑141 GCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGCGCGGCAATTC > 1:4237989/1‑150 GGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCT < 1:2775071/150‑1 GCACGGCGTCGGTGGTCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTC < 2:1527372/150‑1 GGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCA < 2:4969146/150‑1 CAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCG > 1:4822710/1‑150 AGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGA < 1:4110927/150‑1 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1:1995243/1‑150 GCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTG < 2:333853/150‑1 CAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGC > 1:1054017/1‑150 AGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCATATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCA < 1:1737148/150‑1 GAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGC > 2:649803/1‑150 GAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGC < 1:1968639/150‑1 GAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGC > 1:1868985/1‑150 TTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCACTTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGC < 2:241915/150‑1 GGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCTATTCTCTCGAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCTGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTtg < 1:3840472/150‑3 GGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGG < 2:2042637/150‑1 GGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGG < 1:3020634/150‑1 GGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGG < 2:4348986/150‑1 GGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGG < 2:3484331/150‑1 GGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGCGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGG < 2:4237989/150‑1 GTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGGG > 2:3869813/1‑150 CCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGGGTGC < 1:1317258/150‑1 CGGTACCGCCGCTGCGCGCACCTCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGGGTGCG < 2:1260822/150‑1 GTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGGGTGCGCA < 1:3743083/150‑1 ACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGGGTGCGCAGG < 1:4513170/150‑1 CCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGGGTGCGCAGGT < 2:4705689/150‑1 CGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGGGTGCGCAGGTC > 1:4688374/1‑150 CGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGGGTGCGCAGGTC > 1:2956792/1‑150 GCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGGGTGCGCAGGTCG > 2:2672065/1‑150 CGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGGGTGCGCAGGTCGTT > 1:1260310/1‑150 GCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCTGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCACTGCTGCAGCTGGGTGCGCAGGTCGTTC < 2:1606745/150‑1 AGCTCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1844366‑1844515‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGGGTGCGCAGGTCGTTCTGT > NC_002947/1844586‑1844734 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |