New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1216187 = | 47 (1.080) | 4 (0.100) | 4/238 | NT | 8.2% | coding (778/4305 nt) | PP_1061 | ATP‑dependent DNA helicase |
? | NC_002947 | 1216232 = | 45 (1.110) | coding (733/4305 nt) | PP_1061 | ATP‑dependent DNA helicase |
GTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCGCCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACCCACCAGAAACTGTGCCACCCGTTCGACCGGGCGTTGGGTAGCGGACAG > NC_002947/1216038‑1216334 | ggaacgcctgcaagccttgtgcaaaaagccactgcggcgtatcggcctgtccgctacccaacgcccggtcgaacgggtggcacagtttctggtgggtagcgggcgtccctgcgccattgtcgatatcggccatgcccgcaagcgtgacct < 2:292053‑M1/1‑1 (MQ=255) ggtgCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCGCCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATg < 2:808138/149‑1 (MQ=255) aacgcctgcaagccttgtgcaaaaagccactgcggcgtatcggcctgtccgctacccaacgcccggtcgaacgggtggcacagtttctggtgggtagcgggcgtccctgcgccattgtcgatatcggccatgcccgcaagcgtgaccTgg > 1:871714‑M1/148‑150 (MQ=255) acgcctgcaagccttgtgcaaaaagccactgcggcgtatcggcctgtccgctacccaacgcccggtcgaacgggtggcacagtttctggtgggtagcgggcgtccctgcgccattgtcgatatcggccatgcccgcaagcgtgaccTGGc < 2:110962‑M1/4‑1 (MQ=255) ggCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCGCCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCAt < 1:260192/150‑1 (MQ=255) gCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCGCCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATc > 2:928818/1‑150 (MQ=255) ctgcaagccttgtgcaaaaagccactgcggcgtatcggcctgtccgctacccaacgcccggtcgaacgggtggcacagtttctggtgggtagcgggcgtccctgcgccattgtcgatatcggccatgcccgcaagcgtgaccTGGCCATc < 1:154552‑M1/8‑1 (MQ=255) cAACCGCCTCCTCGCCCAGCCGGTCGCGGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCGCCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCTCAGACATCAATGGCCATCa < 2:458115/150‑1 (MQ=255) ccGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCGCCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCg > 2:154552/1‑150 (MQ=255) cGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCGCCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGc < 1:147022/150‑1 (MQ=255) cGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCGCCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGc > 1:27974/1‑150 (MQ=255) tCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCGCCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCggcggc < 2:816181/150‑1 (MQ=255) tcggcctgtccgctacccaacgcccggtcgaacgggtggcacagtttctggtgggtagcgggcgtccctgcgccattgtcgatatcggccatgcccgcaagcgtgaccTGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATgg < 2:92064‑M1/42‑1 (MQ=255) ggcctgtccgctacccaacgcccggtcgaacgggtggcacagtttctggtgggtagcgggcgtccctgcgccattgtcgatatcggccatgcccgcaagcgtgaccTGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGcc > 1:92064‑M1/107‑150 (MQ=255) tACGTTCGGCCAGGCGCCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCAc < 2:1120545/150‑1 (MQ=255) gTTCGGCCAGGCGCCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCt > 2:1000120/1‑150 (MQ=255) gTTCGGCCAGGCGCCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTATTATACCAGGCCCAAGCCACCACTGCAAAATACGGCCCGCATCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCt > 1:248277/1‑150 (MQ=255) gTTCGGCCAGGCGCCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTCCCCGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGGCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACAGCCCCCAGCGAAACCGGCTGCACTGCGATGGGCATGTCACGCt > 2:239395/1‑150 (MQ=255) ggCCAGGCGCCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACAACAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCAACGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCg < 2:12492/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCCTACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGCACCCGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCCCCCTTGCgg > 2:379948/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCGCCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCgg < 1:928818/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGCCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCggg < 1:340386/150‑1 (MQ=255) gggTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCAGACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGa < 1:12616/150‑1 (MQ=255) ttGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCg > 1:185830/1‑150 (MQ=255) cGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACaa < 2:185830/150‑1 (MQ=255) gAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAAt < 1:222980/150‑1 (MQ=255) aaTACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATg < 2:863060/150‑1 (MQ=255) cAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCa > 1:451179/1‑150 (MQ=255) gCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAgg < 2:1094272/150‑1 (MQ=255) cGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCg > 1:87033/1‑150 (MQ=255) tgtTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTa > 1:144693/1‑150 (MQ=255) ttCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTAcc < 2:602136/150‑1 (MQ=255) cACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACcca < 2:446962/150‑1 (MQ=255) gggCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACccacca > 1:9916/1‑150 (MQ=255) aGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACCCACCAGAAAc < 1:1000120/150‑1 (MQ=255) gggTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACCCACCAGAAACt < 2:27974/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCGTCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACCCACCAGAAACtg > 2:718350/1‑150 (MQ=255) gCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACCCACCAGAAACTGTGcc > 1:918459/1‑150 (MQ=255) ccAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCCGGGACGCCCGCTACCCACCAGAAACTGTGCCa > 1:273721/1‑150 (MQ=255) cAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACCCACCAGAAACTGTGCCAc > 2:344223/1‑150 (MQ=255) cAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTAACGGCGGCACTTCGATGGCAAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACCCACCAGAAACTGTGCCAc < 1:243054/150‑1 (MQ=255) gCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACcggcgg > 2:832864/1‑60 (MQ=255) gCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACcggcgg < 1:832864/60‑1 (MQ=255) atatcggccatgcccgcaagcgtgaccTGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACg > 1:284255‑M1/28‑79 (MQ=255) atatcggccatgcccgcaagcgtgaccTGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACg < 2:284255‑M1/52‑1 (MQ=255) aTACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACCCACCAGAAACTGTGCCACCCGTTCGAc > 1:293599/1‑150 (MQ=255) tACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACCCACCAGAAACTGTGCCACCCGTTCGAcc > 1:412019/1‑150 (MQ=255) cacCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACCCACCAGAAACTGTGCCACCCGTTCGACCgg < 1:125416/150‑1 (MQ=255) acCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACCCACCAGAAACTGTGCCACCCGTTCGACCggg > 2:750455/1‑150 (MQ=255) cAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACCCACCAGAAACTGTGCCACCCGTTCGACCGGGCg > 1:292053/1‑150 (MQ=255) cccAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACccacca < 2:1074357/117‑1 (MQ=255) cccAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACccacca > 1:1074357/1‑117 (MQ=255) cccAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACCCACCAGAAACTGTGCCACCCGTTCGACCGGGCGTTggg < 2:144693/150‑1 (MQ=255) ccAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACCCACCAGAAACTGTGCCACCCGTTCGACCGGGCGTTGGGt > 2:345940/1‑150 (MQ=255) ccAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACCCACCAGAAACTGTGCCACCCGTTCGACCGGGCGCTGGGt > 2:56494/1‑150 (MQ=255) gACATCAATGGCCATCAGCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACCCACCAGAAACTGTGCCACCCGTTCGACCGGGCGTTGGGTAGc < 1:379948/150‑1 (MQ=255) aaTGGACATCAAAGCACCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCCCTACCAACCAGAAACTATGCCACCCGGTCGACCGGGCGCTGGGTAGCGGACaa > 2:449348/1‑149 (MQ=255) | GTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCGCCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAGGTCACGCTTGCGGGCATGGCCGATATCGACAATGGCGCAGGGACGCCCGCTACCCACCAGAAACTGTGCCACCCGTTCGACCGGGCGTTGGGTAGCGGACAG > NC_002947/1216038‑1216334 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |