New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1483154 | 35 (0.810) | 4 (0.100) | 4/246 | NT | 11.0% | coding (321/1029 nt) | yhdW | amino acid ABC transporter‑binding protein YhdW |
? | NC_002947 | = 1483186 | 31 (0.740) | coding (353/1029 nt) | yhdW | amino acid ABC transporter‑binding protein YhdW |
TCGTCGGCATCGATGCCGATGTCTGCCGCGCCGTGGCCGCCGCCGTGTTCGGCGATGCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTATGACGGCGTCGGCTTCCTGGTCAACAAGAAGCTCGGCGTTTCCAGCGCCAAGGAGCTCGATGGCGCGACCATCTGCATCCAGGCCGGCACCA > NC_002947/1483006‑1483302 | tcgtcgGCATCGATGCCGATGTCTGCCGCGCCGTGGCCGCCGCCGTGTTCGGCGATGCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCt < 2:85513/150‑1 (MQ=255) cgGCATCGATGCCGATGTCTGCCGCGCCGTGGCCGCCGCCGTGTTCGGCGATGCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGATGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGAc < 1:820394/150‑1 (MQ=255) aTCGATGCCGATGTCTGCCGCGCCGTGGCCGCCGCCGTGTTCGGCGATGCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGc > 2:822850/1‑150 (MQ=255) gATGCCGATGTCTGCCGCGCCGTGGCCGCCGCCGTGGGCGGCGATGCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTcg > 1:88150/1‑150 (MQ=255) cGATGTCTGCCGCGCCGTGGCCGCCGCCGTGTTCGGCGATGCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGATCGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCTCCTGGACCAGCTCGCGCGa < 2:16688/150‑1 (MQ=255) tCTGCCGCGCCGTGGCCGCCGCCGTGTTCGGCGATGCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCg < 2:247782/150‑1 (MQ=255) tGCCGCGCCGTGGCCGCCGCCGTGTTCGGCGATGCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGc > 1:880743/1‑150 (MQ=255) gcgcCGTGGCCGCCGCCGTGTTCGTCGATGCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCACGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATgg < 2:562705/150‑1 (MQ=255) ccGTGGCCGCCGCCGTGTTCGGCGATGCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGcc < 1:558876/150‑1 (MQ=255) cGTGGCCGCCGCCGTGTTCGGCGATGCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCt > 1:154201/1‑150 (MQ=255) tGGCCGCCGCCGTGTTCGGCGATGCCACCAAGGTCAAGTCCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTgg > 1:1024008‑M2/1‑148 (MQ=255) ggCCGCCGCCGTGTTCGGCGATGCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTggt > 1:427685‑M2/1‑147 (MQ=255) ggCCGCCGCCGTGTTCGGCGATGCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTggt > 1:822850‑M2/1‑147 (MQ=255) cgccgccgTGTTCGGCGATGCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGACGTGAGACGGGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGtt > 1:134297/1‑150 (MQ=255) gccgTGTTCGGCGATGCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTcgcg > 2:325005/1‑150 (MQ=255) gtTCGGCGATGCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGCACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCGCCTGTACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGgtgt < 1:757840/150‑1 (MQ=255) ttCGGCGATGCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACACCAAGGAACGCTTAACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTc > 1:413202/1‑150 (MQ=255) gATGCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACctac < 1:178476/150‑1 (MQ=255) tGCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACctacta < 2:880743/150‑1 (MQ=255) gCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCCCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTAt < 2:460283/150‑1 (MQ=255) caccaAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCaggcccatgccggcatcgcgcgagctggtccagg > 2:628657‑M1/1‑91 (MQ=255) caccaAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCaggcccatgccggcatcgcgcgagctggtccagg < 1:628657‑M1/125‑35 (MQ=255) accaAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTATGAc > 1:195995/1‑150 (MQ=255) gTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTATGACGGCGTc > 2:299834/1‑150 (MQ=255) agccagcTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTATGACGGCGTCGGCTTCCTg < 2:154201/150‑1 (MQ=255) cagcTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACC < 2:975653‑M1/72‑1 (MQ=255) cagcTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACC > 1:975653‑M1/1‑72 (MQ=255) aCGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCGCCaggcccatgccggcatcgcgcgagctggtccaggtg < 2:1130836‑M1/91‑37 (MQ=255) aCGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCGCCaggcccatgccggcatcgcgcgagctggtccaggtg > 1:1130836‑M1/1‑55 (MQ=255) gCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTATGACGGCGTCGGCTTCCTGGTCAACAAGAAGCTCGGCGttt < 2:88150/150‑1 (MQ=255) cTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTATGACGGCGTCGGCTTCCTGGTCAACAAGAAGCTCGGCGTTTCCAGCGCCAAg < 1:325005/150‑1 (MQ=255) gactgcagggCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTATGGAGGCGTCGGCTTCCTGGTCAACAAGAAGCTCGGCGTTTCCAGCGCCAAgg < 1:758581/143‑1 (MQ=255) gCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTATGACGGCGTCGGCTTCCTGGTc < 2:1033367/118‑1 (MQ=255) gCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTATGACGGCGTCGGCTTCCTGGTc > 1:1033367/1‑118 (MQ=255) aGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTATGACGGCGTCGGCTTCCTGGTCAACAAGAAGCTCGGCGTTTCCAGCGCCAAGGAGc > 2:848493/1‑150 (MQ=255) gCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCCCCTGGACCAGCTCGCGCGATGCTGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTATGACGGCGTCGGCTTCCTGGTCAACAAGAAGCTCGGCGTTTCCAGCGCCAAGGAGCTCGATg < 2:180454/150‑1 (MQ=255) cGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTATGACGGCGTCGGCTTCCTGGTCAACAAGAAGCTCGGCGTTTCCAGCGCCAAGGAGCTCGATgg < 2:195995/150‑1 (MQ=255) aCGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTATGACGGCGTCGGCTTCCTGGTCAACAAGAAGCTCGGCGTTTCCAGCGCCAAGGAGCTCGATGgcgc > 1:886828/1‑145 (MQ=255) aCGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTATGACGGCGTCGGCTTCCTGGTCAACAAGAAGCTCGGCGTTTCCAGCGCCAAGGAGCTCGATGgcgc < 2:886828/145‑1 (MQ=255) gTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTATGACGGCGTCGGCTTCCTGGTCAACAAGAAGCTCGGCGTTTCCAgc > 1:705358/1‑123 (MQ=255) gTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTATGACGGCGTCGGCTTCCTGGTCAACAAGAAGCTCGGCGTTTCCAgc > 1:705635/1‑123 (MQ=255) gTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGGGTCACCTACTATGACGGCGTCGGCTTCCTGGTCAACAAGAAGCTCGGCGTTTCCAgc < 2:705635/123‑1 (MQ=255) gTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGCGTGTCACCTACTATGACGGCGTCGGCTTCCTGGTCAACAAGAAGCTCGGCGTTTCCAgc < 2:705358/123‑1 (MQ=255) tACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCCTGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTATGACGGCGTCGGCTTCCTGGACCTGTGGAAGCTCGGCGTTTCCAGCGCCAAGGAGCTCGATGGCGCGACCATCt < 1:577494/150‑1 (MQ=255) tACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTATGACGGCGTCGGCTTCCTGGTCAACAAGAAGCTCGGCGTTTCCAGCGCCAAGGAGCTCGATGGCGCGACCATCt < 1:398312/150‑1 (MQ=255) gTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTATGACGGCGTCGGCTTCCTGGTCAACAAGAAGATCCTCGTATCCAGCGCCAAGGAGCTCGATGGCGCGACCATCTGCATCCAgg > 2:30291/1‑150 (MQ=255) caccTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTggcggtgttacgcgacagtacgtcgacctcgcccgactgcagggcagtgaagcgt > 1:1130836‑M2/1‑36 (MQ=255) caccTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTggcggtgttacgcgacagtacgtcgacctcgcccgactgcagggcagtgaagcgt < 2:1130836‑M2/91‑56 (MQ=255) accaggcccatgccggcatcgcgcgagctggtccaggtggtgttacgcgacagtacgtcgacctcgcccgactgcagggcagtgaagcgttccttggcgttgagctggctgaacttgaccttggtggcatcgccgaacacggcggcggcc > 1:427685‑M1/1‑3 (MQ=255) accaggcccatgccggcatcgcgcgagctggtccaggtggtgttacgcgacagtacgtcgacctcgcccgactgcagggcagtgaagcgttccttggcgttgagctggctgaacttgaccttggtggcatcgccgaacacggcggcggcc > 1:822850‑M1/1‑3 (MQ=255) ccaggcccatgccggcatcgcgcgagctggtccaggtggtgttacgcgacagtacgtcgacctcgcccgactgcagggcagtgaagcgttccttggcgttgagctggctggacttgaccttggtggcatcgccgaacacggcggcggcca > 1:1024008‑M1/1‑2 (MQ=255) ccTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTggtggtgttacgcgacagtacgtcgacctcgcccgactgcagggcagtgaagcgttccttggcgttgagctggctgaacttgaccttggtg > 2:628657‑M2/1‑34 (MQ=255) ccTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTggtggtgttacgcgacagtacgtcgacctcgcccgactgcagggcagtgaagcgttccttggcgttgagctggctgaacttgaccttggtg < 1:628657‑M2/125‑92 (MQ=255) | TCGTCGGCATCGATGCCGATGTCTGCCGCGCCGTGGCCGCCGCCGTGTTCGGCGATGCCACCAAGGTCAAGTTCAGCCAGCTCAACGCCAAGGAACGCTTCACTGCCCTGCAGTCGGGCGAGGTCGACGTACTGTCGCGTAACACCACCTGGACCAGCTCGCGCGATGCCGGCATGGGCCTGGTGTTCGCGGGTGTCACCTACTATGACGGCGTCGGCTTCCTGGTCAACAAGAAGCTCGGCGTTTCCAGCGCCAAGGAGCTCGATGGCGCGACCATCTGCATCCAGGCCGGCACCA > NC_002947/1483006‑1483302 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |