New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2282026 = | 34 (0.780) | 5 (0.120) | 4/240 | NT | 12.5% | coding (805/894 nt) | PP_2009 | 1‑aminocyclopropane‑1‑carboxylate deaminase |
? | NC_002947 | 2282071 = | 38 (0.930) | coding (850/894 nt) | PP_2009 | 1‑aminocyclopropane‑1‑carboxylate deaminase |
CACGCACGGCTACCAGCTACACGACGCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGT > NC_002947/2281878‑2282175 | cacgcacgGCTACCAGCTACACGACGCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGa < 2:245863/150‑1 (MQ=255) cacgcacgGCTACCAGCTACACGACGCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCATCCTCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGa < 1:74233/150‑1 (MQ=255) gcgtattggcagctggggctactggctgatcggcttgcatgcactggccgggctataccatcactatgtgcagcgcgacaacacgctgttgcgcatgctgccttacaagtaaccgcgtcgcccctgcaggccacccgtgtgtacgaaGAt < 1:338110‑M1/3‑1 (MQ=255) gcgtattggcagctggggctactggctgatcggcttgcatgcactggccgggctataccatcactatgtgcagcgcgacaacacgctgttgcgcatgctgccttacaagtaaccgcgtcgcccctgcaggccacccgtgtgtacgaaGAt > 1:723209‑M1/148‑150 (MQ=255) cgtattggcagctggggctactggctgatcggcttgcatgcactggccgggctataccatcactatgtgcagcgcgacaacacgctgttgcgcatgctgccttacaagtaaccgcgtcgcccctgcaggccacccgtgtgtacgaaGATc > 2:1084397‑M1/147‑150 (MQ=255) gtattggcagctggggctactggctgatcggcttgcatgcactggccgggctataccatcactatgtgcagcgcgacaacacgctgttgcgcatgctgccttacaagtaaccgcgtcgcccctgcaggccacccgtgtgtacgaaGATCa < 1:220877‑M1/5‑1 (MQ=255) gcacgGCTACCAGCTACACGACGCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCa > 1:903406/1‑150 (MQ=255) acgGCTACCAGCTACACGACGCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAgg > 1:198754/1‑150 (MQ=255) ggCTACCAGCTACACGACGCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAGGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGtt > 2:928686/1‑150 (MQ=255) ggCTACCAGCTACACGACGCCGGCCGTGGAGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGtt < 2:86643/150‑1 (MQ=255) cgacgCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGTCTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGtt < 2:201195/150‑1 (MQ=255) gacgCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTc > 1:175645/1‑150 (MQ=255) cgCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCaa < 2:331978/150‑1 (MQ=255) gCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGCTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCg < 2:555835/150‑1 (MQ=255) ttgcatgcactggccgggctataccatcactatgtgcagcgcgacaacacgctgttgcgcatgctgccttacaagtaaccgcgtcgcccctgcaggccacccgtgtgtacgaaGATCAGGCGGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAgcc > 2:72011‑M1/114‑150 (MQ=255) aaaTTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTc < 2:399621/150‑1 (MQ=255) aaTTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCg < 2:903406/150‑1 (MQ=255) tCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTac > 2:220877/1‑150 (MQ=255) aCTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCt < 2:198754/150‑1 (MQ=255) cTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTg > 2:918979/1‑150 (MQ=255) tGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCCCTATACCGCACCGGCTGCGATGACGTTGGGGGATGAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGc > 2:401907/1‑150 (MQ=255) aCCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCa < 1:372273/86‑1 (MQ=255) aCCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCa > 2:372273/1‑86 (MQ=255) cTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAggg > 2:1072429/1‑150 (MQ=255) ttCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAGGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAgggg < 1:928686/150‑1 (MQ=255) aTCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTTCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCgg > 2:953914/1‑149 (MQ=255) gcgacaacacgctgttgcgcatgctgccttacaagtaaccgcgtcgcccctgcgggccacccgtgtgtacgaaGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTc < 1:712805‑M1/48‑1 (MQ=255) gcgacaacacgctgttgcgcatgctgccttacaagtaaccgcgtcgcccctgcgggccacccgtgtgtacgaaGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTc > 2:712805‑M1/74‑121 (MQ=255) ggcgCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAg < 1:835671/150‑1 (MQ=255) gcatgctgccttacaagtaaccgcgtcgcccctgcaggccacccgtgtgtacgaaGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTc > 1:551053‑M1/56‑103 (MQ=255) gcatgctgccttacaagtaaccgcgtcgcccctgcaggccacccgtgtgtacgaaGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTc < 2:551053‑M1/48‑1 (MQ=255) gTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATgcgc > 2:677840/1‑150 (MQ=255) gTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGATTACTTGTAAGGCAGCATgcgc > 2:557871/1‑150 (MQ=255) cGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACa > 1:955117/1‑150 (MQ=255) cTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGc < 1:1072429/150‑1 (MQ=255) cGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCgt < 2:390412/150‑1 (MQ=255) cGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCgt < 2:454331/150‑1 (MQ=255) aGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCg > 2:978174/1‑146 (MQ=255) aGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCg < 1:978174/146‑1 (MQ=255) cccTCTATACCGGGAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGtgttgt > 1:267053/1‑150 (MQ=255) taCCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTc < 1:552613/76‑1 (MQ=255) taCCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTg > 2:686133/1‑150 (MQ=255) taCCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTAGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTc > 2:552613/1‑76 (MQ=255) aCCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTc < 2:225890/51‑1 (MQ=255) aCCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTc > 1:225890/1‑51 (MQ=255) tctGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATg < 1:790618/150‑1 (MQ=255) gCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGGATAGGGGAGGCGGGTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGc > 1:979917/1‑150 (MQ=255) cTTGCGTGATCAGGTTGCTGTCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACCCGGTTACTTGTAAGGCAGCATACGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGccc > 2:35242/1‑150 (MQ=255) gCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGc < 2:955117/150‑1 (MQ=255) GATCAGGTTGCGGCGGGGCTGTTCAAGGCCGGCAGCCGCCTGAGCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGGGGGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGt > 1:169930‑M1/1‑150 (MQ=255) | CACGCACGGCTACCAGCTACACGACGCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGT > NC_002947/2281878‑2282175 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |