New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3783067 = | 50 (1.150) | 3 (0.080) | 3/234 | NT | 7.1% | coding (115/771 nt) | nikD | nickel ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 3783174 = | 33 (0.830) | coding (222/771 nt) | nikD | nickel ABC transporter ATP‑binding protein |
CGCCTGGACCCTGCACAGGAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCA > NC_002947/3782923‑3783202 | atgcgcgcccgtgctaccgcgctggtgatgcctcgttgcctgagcgtttcgatggcatggctggccatgttgcgcaccgggttgaaggcgctgcgcgggttttgcagcaccaggctggtcaggcgacctctgacactgcttgcagccagc > 1:975635‑M1/145‑150 (MQ=255) ccTGGACCCTGCACAGGAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCgg > 1:492963/1‑150 (MQ=255) gcgcccgtgctaccgcgctggtgatgcctcgttgcctgagcgtttcgatggcatggctggccatgttgcgcaccgggttgaaggcgctgcgcgggttttgcagcaccaggctggtcaggcgacctctgacactgcttgcaGCCAGCGGct > 1:284479‑M1/141‑150 (MQ=255) gACCCTGCACAGGAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGctct < 1:164064/150‑1 (MQ=255) aCCCTGCACAGGAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTg < 1:384821/150‑1 (MQ=255) ccTGCACAGGAGCGCCATTGAATGAGTCTGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGAAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGc > 2:582039/1‑150 (MQ=255) ccTGCACAGGAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCTGTGCTTGAAATCCGTGTCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCTGTGCCAGCGGCTCTGGc < 2:910644/150‑1 (MQ=255) ccTGCACAGGAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGc > 2:146571/1‑150 (MQ=255) cTGCACAGGAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCa > 1:349422/1‑150 (MQ=255) caGGAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATcc < 1:1028013/150‑1 (MQ=255) aGGAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATcca > 1:119241/1‑149 (MQ=255) ggAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCt < 2:1074089/150‑1 (MQ=255) ggAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCt < 1:394647/150‑1 (MQ=255) aGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCa < 1:849272/150‑1 (MQ=255) aTTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCaaa > 2:915343/1‑137 (MQ=255) aTTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCaaa < 1:915343/137‑1 (MQ=255) tGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCt < 1:1021803/150‑1 (MQ=255) ccGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTc < 1:146571/150‑1 (MQ=255) gTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTACTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGa > 2:440194/1‑150 (MQ=255) cTTGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAAACCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTa > 1:113005/1‑150 (MQ=255) ttGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCCGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTac > 1:545240/1‑150 (MQ=255) ttGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTac > 1:1038882/1‑150 (MQ=255) ttGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTac > 1:1037007/1‑150 (MQ=255) aaTCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGGGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTaccacc > 1:753006/1‑150 (MQ=255) gCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCg > 1:316956/1‑150 (MQ=255) ccTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGc < 1:1065478/150‑1 (MQ=255) ttCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGccc > 2:474907/1‑150 (MQ=255) ttCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTGGCATCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGccc > 2:433108/1‑150 (MQ=255) aTAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCAcc > 1:651476/1‑150 (MQ=255) aTAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTAGCCCGCAcc > 1:187301/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACa > 1:1066116/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACa > 1:848534/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACa > 2:547931/1‑150 (MQ=255) cGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGc < 1:210790/113‑1 (MQ=255) cGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGc > 2:210790/1‑113 (MQ=255) ggcctGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGACTCGCCCGCACCCAAGGACAActgctg < 2:651476/146‑1 (MQ=255) gTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTc > 1:452638/1‑150 (MQ=255) gcgctgcgcgggttttgcagcaccaggctggtcaggcgacctctgacactgcttgcaGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGAc < 1:961041‑M1/93‑1 (MQ=255) gTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCTACCGTCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGc < 1:290852/150‑1 (MQ=255) aCGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCgc < 1:547931/150‑1 (MQ=255) gTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCgctg > 2:845629/1‑150 (MQ=255) ttgcagcaccaggctggtcaggcgacctctgacactgcttgcaGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCgctggc > 2:64877‑M1/44‑150 (MQ=255) gACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTAGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCgctggct < 2:187301/150‑1 (MQ=255) tGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCaa < 2:1037007/150‑1 (MQ=255) aGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCa < 1:440194/150‑1 (MQ=255) aggctggtcaggcgacctctgacactgcttgcaGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAgt > 2:961041‑M1/34‑150 (MQ=255) gccgcGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTac > 2:693224/1‑81 (MQ=255) gccgcGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTac < 1:693224/81‑1 (MQ=255) gcggcgAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCagag < 2:113005/150‑1 (MQ=255) gAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGc < 2:119241/150‑1 (MQ=255) gAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGc < 2:1038882/150‑1 (MQ=255) cTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGAc < 1:582039/150‑1 (MQ=255) cTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGAc < 1:1100359/150‑1 (MQ=255) gCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCa > 1:995337/1‑150 (MQ=255) gCACGTTGGTCGGCGCCAGCGGCTCTGGCACATCCCTCAGCTGCCTTGGCCTGCTCGACCTGCTACCCCCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCa < 2:900880/150‑1 (MQ=255) | CGCCTGGACCCTGCACAGGAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCATAGAAACCCAGGCCGGCGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCA > NC_002947/3782923‑3783202 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |