New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3783067 = | 50 (1.150) | 3 (0.080) | 3/234 | NT | 7.1% | coding (115/771 nt) | nikD | nickel ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 3783174 = | 33 (0.830) | coding (222/771 nt) | nikD | nickel ABC transporter ATP‑binding protein |
GACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAGCGCGGTAGCACGGGCGCGCAT > NC_002947/3783025‑3783317 | gACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTAGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCgctggct < 2:187301/150‑1 (MQ=255) tGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCaa < 2:1037007/150‑1 (MQ=255) aGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCa < 1:440194/150‑1 (MQ=255) aggctggtcaggcgacctctgacactgcttgcaGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAgt > 2:961041‑M1/34‑150 (MQ=255) gcggcgAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCagag < 2:113005/150‑1 (MQ=255) gAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGc < 2:1038882/150‑1 (MQ=255) gAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGc < 2:119241/150‑1 (MQ=255) cTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGAc < 1:1100359/150‑1 (MQ=255) cTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGAc < 1:582039/150‑1 (MQ=255) gCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCa > 1:995337/1‑150 (MQ=255) gCACGTTGGTCGGCGCCAGCGGCTCTGGCACATCCCTCAGCTGCCTTGGCCTGCTCGACCTGCTACCCCCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCa < 2:900880/150‑1 (MQ=255) actgcttgcagccagcggctggccgtcgagcagcagttgtccttgggtgcgggcgaggccaggtggtagcaggtcgagcaagccaaggcagctgagggatttgccagagccgctggcTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCt > 2:961041‑M2/118‑150 (MQ=255) gccagcggctggccgtcgagcagcagttgtccttgggtgcgggcgaggccaggtggtagcaggtcgagcaagccaaggcagctgagggatttgccagagccgctggcTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCaa > 2:64877‑M2/108‑150 (MQ=255) CCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCaaa < 2:547205‑M1/150‑1 (MQ=255) CTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCcgcg < 1:94832‑M1/150‑1 (MQ=255) TCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCgcgc < 2:787665‑M1/150‑1 (MQ=255) gtcgagcagcagttgtccttgggtgcgggcgaggccaggtggtagcaggtcgagcaagccaaggcagctgagggatttgccagagccgctggcTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAgcgc < 1:961041‑M2/57‑1 (MQ=255) aaTCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCt < 1:845629/150‑1 (MQ=255) aTCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCtt > 1:195832/1‑150 (MQ=255) tCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTc < 2:995337/150‑1 (MQ=255) ccTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCaa < 2:753006/150‑1 (MQ=255) aGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTCCCCCCGGGCCTCGCCCGCACTCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCatgccg < 2:545240/150‑6 (MQ=255) ccTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCACCCTGTTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTgcc > 2:400929/1‑149 (MQ=255) cTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGa > 1:854505/1‑103 (MQ=255) cTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGa < 2:854505/103‑1 (MQ=255) tGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATgg < 1:474907/150‑1 (MQ=255) tCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGgcca > 2:385988/1‑150 (MQ=255) accaccTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAgccatgccat < 2:452638/150‑1 (MQ=255) gCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTCGCCG‑TCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGc > 1:1050909/1‑150 (MQ=255) gCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCaaa < 1:743368/93‑1 (MQ=255) gCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCaaa > 2:743368/1‑93 (MQ=255) tCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCa < 1:787665/150‑1 (MQ=255) cccGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGc > 1:708248/1‑150 (MQ=255) ccGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCa > 1:103610/1‑150 (MQ=255) cGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCaa < 2:848534/150‑1 (MQ=255) ccAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCGGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAACACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAgg > 2:497209/1‑150 (MQ=255) aGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCAt < 2:94832/150‑1 (MQ=255) gACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCa > 2:218965/1‑150 (MQ=255) gACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCGGCAAAAAACCCGCAACAACTCCAACCCGGGGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTAAGGCAACGAGGCATCa > 1:356733/1‑150 (MQ=255) ct‑gctgCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAgc < 2:349422/150‑1 (MQ=255) t‑gctgcTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAgcg > 2:1037907/1‑150 (MQ=255) ctgctCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAGcgcg < 1:433108/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAGCGCGGTAGCACggg > 1:602607/1‑150 (MQ=255) ccAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCt < 1:766635/45‑1 (MQ=255) ccAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCt > 2:766635/1‑45 (MQ=255) ccAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAGCGCGGTAGCACGGgc > 1:1044584/1‑150 (MQ=255) agccgctggcTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAGCGCGGTAGCACGGgcgc > 1:284479‑M2/11‑150 (MQ=255) gctggcTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAGCGCGGTAGCACGGGCGCGCAt > 1:975635‑M2/7‑150 (MQ=255) | GACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACT‑GCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAGCGCGGTAGCACGGGCGCGCAT > NC_002947/3783025‑3783317 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |