| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5241748 | 61 (1.410) | 5 (0.120) | 5/244 | NT | 8.4% | coding (172/633 nt) | hmgC | maleylacetoacetate isomerase |
| ? | NC_002947 | = 5241781 | 51 (1.230) | coding (139/633 nt) | hmgC | maleylacetoacetate isomerase | |||||
ATGAATGTCGCAACCAATGATGGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGACGAGGTGG > NC_002947/5241605‑5241894 | aTGAATGTCGCAACCAATGATGGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTgcg > 1:1123023/1‑150 (MQ=255) tCGCAACCAATGATGGCCGCCGCCCCCCGGACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCCCCGCAGCTTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGcc < 1:69233/150‑1 (MQ=255) tCGCAACCAATGATGGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGcc > 2:1118794/1‑150 (MQ=255) tCGCAACCAATGATGGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGcc > 2:1128954/1‑150 (MQ=255) tCGCAACCAATGATGGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGcc > 2:2322/1‑150 (MQ=255) cGCAACCAATGATGGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCg < 1:7094/150‑1 (MQ=255) gCAACCAATGATGGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGTTGCGCAAGGCCgg > 1:379913/1‑150 (MQ=255) aaCCAATGATGGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAAACTCTTACAGGTACTAGATGATCGCCAGCGACCACACAAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTa > 2:345589/1‑150 (MQ=255) aCCAATGATGGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCTTCGGTGCGCAAGGCCGGTAc > 2:1106590/1‑150 (MQ=255) aaTGATGGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTAcgcg > 1:1065716/1‑150 (MQ=255) atgatgGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGTCAGCATCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCTCAAGGCCGGTACGCgg < 1:345589/150‑1 (MQ=255) atgatgGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCgg > 1:462020/1‑150 (MQ=255) atgatgGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCCCCTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCgg > 1:120955/1‑150 (MQ=255) tgGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCt > 1:311924/1‑150 (MQ=255) tgGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCCCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGCCCGCACAAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCCAGGCAGGTACGCGGcccc > 1:3797/1‑149 (MQ=255) gccgccACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTAcgc > 1:435362/1‑142 (MQ=255) gccgccACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTAcgc < 2:435362/142‑1 (MQ=255) gccACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCggtgcgcagggccgcgtaccggccttgcgca < 1:420213‑M1/150‑32 (MQ=255) ccACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCggtgcgcagggccgcgtaccggccttgcgcac < 2:538836‑M1/150‑33 (MQ=255) tcccgAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTCCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTgacg < 2:461259‑M2/149‑5 (MQ=255) cccTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACac < 1:1128954/150‑2 (MQ=255) ccTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATa > 2:176611/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATa < 1:1118794/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATa > 2:732520/1‑150 (MQ=255) cTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCaacccgcagggccgcgtaccggccttgcgcaccgacggtggtnagg < 2:700459‑M1/150‑47 (MQ=255) gCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGccc > 2:921467/1‑150 (MQ=255) ccGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCaacccgcagggccgcgtaccggccttgcgcaccgacggtggtgaggt > 2:540184‑M1/1‑99 (MQ=255) ccGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCaacccgcagggccgcgtaccggccttgcgcaccgacggtggtgaggt < 1:540184‑M1/146‑48 (MQ=255) cTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGcc > 1:122935/1‑106 (MQ=255) cTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGcc < 2:122935/106‑1 (MQ=255) cTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACg > 1:377817/1‑150 (MQ=255) tCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACgc > 2:1065986/1‑150 (MQ=255) cagcaACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTgcag > 1:575619/1‑150 (MQ=255) caACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACCCTGCGCACCCTGcagcag < 2:542538/150‑1 (MQ=255) cGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGtt < 1:176611/150‑1 (MQ=255) cGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGtt < 1:312651/150‑1 (MQ=255) cGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGtt < 1:732520/150‑1 (MQ=255) ggCCGTGGATAAACCCCCTCCAGGTACTCGACGATCGCCGGCGACTACACCATCAGCTCACCGCCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGAcc < 2:799375/150‑1 (MQ=255) cTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCgg < 1:901575/150‑1 (MQ=255) tgGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAg < 2:847651/150‑1 (MQ=255) tgGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAg < 2:462020/150‑1 (MQ=255) tgGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAg < 2:311924/150‑1 (MQ=255) ggATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAgg < 1:1105618/150‑1 (MQ=255) aaaCCTCGTCCAGGTACTCGATGAGCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACt < 2:110106/150‑1 (MQ=255) aaCCTCCTCATGTTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTg < 1:597613/150‑1 (MQ=255) ccTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCACTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCACACACTGCAGCAGGTTTAGCGGCAGGGACTGGt > 1:516157/1‑150 (MQ=255) ctctTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCggg < 2:406066/85‑1 (MQ=255) ctctTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCggg > 1:406066/1‑85 (MQ=255) ctctTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTa < 2:377817/150‑1 (MQ=255) ctctTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTa < 1:921467/150‑1 (MQ=255) tctTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAgg < 1:352403/141‑1 (MQ=255) tctTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAgg > 2:352403/1‑141 (MQ=255) ttCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAagc > 2:151375/1‑150 (MQ=255) ttCCAGGTACTCGAGGAGCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCAGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCGGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAagc < 1:921485/150‑1 (MQ=255) cAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCACTCCAGTCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAagccag > 1:11293/1‑150 (MQ=255) tCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTc > 1:1087470/1‑150 (MQ=255) cGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCACCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCa < 2:575619/150‑1 (MQ=255) aCTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACTGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATgc < 2:1099422/150‑1 (MQ=255) aCTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATgc < 1:461259/150‑1 (MQ=255) tGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATgcgc > 2:387001/1‑150 (MQ=255) tGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATgcgc > 2:645420/1‑150 (MQ=255) tGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATgcgc > 2:215757/1‑150 (MQ=255) aCCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCGGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCAcc > 2:358215/1‑150 (MQ=255) cACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTa < 1:632100/150‑1 (MQ=255) aCCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTgacggtggtgaggtgctggtgcagtcgccggcgatcatcgagtacctggaagaggtttatccacagcctgcgttgctgccggccaccgccgaggcacgg > 2:540184‑M2/1‑47 (MQ=255) aCCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTgacggtggtgaggtgctggtgcagtcgccggcgatcatcgagtacctggaagaggtttatccacagcctgcgttgctgccggccaccgccgaggcacgg < 1:540184‑M2/146‑100 (MQ=255) aCCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAg > 2:504762/1‑150 (MQ=255) ccTNACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTgacggtggtgaggtgctggtgcagtcgccggcgatcatcgagtacctggaagaggtttatccacagcctgcgttgctgccggccaccgccgaggcacgggccag < 2:700459‑M2/150‑105 (MQ=255) cTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGa < 2:433763/150‑1 (MQ=255) tCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGAc > 1:816458/1‑150 (MQ=255) cGTCaacccgcagggccgcgtaccggccttgcgcaccgacggtggtgaggtgctggtgcagtcgccggcgatcatcgagtacctgggagaggtttatccacagcctgcgttgctgccggccaccgccgaggcacgggccagggttcggga < 2:461259‑M1/150‑147 (MQ=255) | ATGAATGTCGCAACCAATGATGGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCGGTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGACGAGGTGG > NC_002947/5241605‑5241894 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |