New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5731921 = | 49 (1.130) | 6 (0.150) | 5/240 | NT | 11.7% | coding (691/1206 nt) | hutI | imidazolonepropionase |
? | NC_002947 | 5731965 = | 44 (1.080) | coding (647/1206 nt) | hutI | imidazolonepropionase |
AGCACGGCGACCGTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTGCGCGATGTAGTC > NC_002947/5731773‑5732065 | agcaCGGCGACCGTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAgg < 2:498620/150‑1 (MQ=255) ccGTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGCTGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTcgc < 2:623241/150‑1 (MQ=255) cGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCt > 1:977788/1‑150 (MQ=255) cgcTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTtga < 2:880242/150‑1 (MQ=255) gcTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTtgat < 2:775293/150‑1 (MQ=255) gcTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTtgat < 1:340633/150‑1 (MQ=255) cATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAg > 1:585516/1‑150 (MQ=255) cATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCCGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAg > 2:463040/1‑150 (MQ=255) ggtcgggccgacgactacatcgcgcacatctgtgacgagatgttgccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgccGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGAc > 1:963065‑M1/114‑150 (MQ=255) tcgggccgacgactacatcgcgcacatctgtgacgagatgttgccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgccGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCt > 1:874347‑M1/112‑150 (MQ=255) tcgggccgacgactacatcgcgcacatctgtgacgagatgttgccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgccGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCt > 1:874101‑M1/112‑150 (MQ=255) ggTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCt < 2:346837/149‑1 (MQ=255) gTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTg > 2:924234/1‑150 (MQ=255) cgggccgacgactacatcgcgcacatctgtgacgagatgttgccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgccGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTg > 1:251892‑M1/111‑150 (MQ=255) tCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTgg < 1:302574/150‑1 (MQ=255) tCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTgg < 2:387858/150‑1 (MQ=255) ttCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGc > 2:147081/1‑150 (MQ=255) ctctGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCgg < 2:907393/150‑1 (MQ=255) ctctGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCgg > 1:907393/1‑150 (MQ=255) tctGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGc > 1:114178/1‑150 (MQ=255) tctGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCCTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGc < 2:585516/150‑1 (MQ=255) tGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGACAGGCAGCTCGACCTGGGCCGGCga > 1:335199/1‑150 (MQ=255) tGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTAGATCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGATCTGGGACGGCga > 1:69899/1‑150 (MQ=255) gactacatcgcgcacatctgtgacgagatgttgccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgccGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCga > 2:873733‑M1/102‑150 (MQ=255) tGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTCTGACACGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAAcg > 1:1112665/1‑150 (MQ=255) gcgcacatctgtgacgagatgttgccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgccGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAg > 1:978233‑M1/93‑150 (MQ=255) cAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGa > 1:358407/1‑146 (MQ=255) cAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGa < 2:358407/146‑1 (MQ=255) gtGGTCAGCCGACAGTGCGTGGTGACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGCCAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCCGCTCCAGTTCGCGGGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTc < 2:375387/149‑1 (MQ=255) aGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGATTGAGCAGTTCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGaa < 2:1112665/150‑1 (MQ=255) gCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTAGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAg > 2:400900/1‑150 (MQ=255) ccGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAg > 1:19541/1‑149 (MQ=255) ccGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAg < 2:19541/149‑1 (MQ=255) tGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGgcatccaccgca < 2:977788/150‑1 (MQ=255) gTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGgcatccaccgcatc > 2:516771/1‑150 (MQ=255) tAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGa < 2:1040122/121‑1 (MQ=255) tAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCATTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGa > 1:1040122/1‑121 (MQ=255) cgcgGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATCAAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAg < 1:674687/150‑1 (MQ=255) ccAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCGCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCtc < 2:187307/150‑2 (MQ=255) aGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCg > 2:134997/1‑150 (MQ=255) ggCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGc < 2:311760/150‑1 (MQ=255) ttGAGCCGTGCAACGATGACATTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAAGCCTTCGCCgg > 2:100220/1‑150 (MQ=255) gCAACGATGACATGTGTTCGGCATGCAGCGTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCTCGCCTTCATGAACCGGCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGTCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCg < 1:463040/150‑1 (MQ=255) cAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTTGCCGGCCTTGGCCgg > 2:294933/1‑150 (MQ=255) aTGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTTGCCGGCCTTGGCCGGcgaag < 1:294933/150‑5 (MQ=255) aCAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACAtct < 1:126683/150‑1 (MQ=255) aGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCaa > 1:612291/1‑134 (MQ=255) aGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCaa < 2:612291/134‑1 (MQ=255) ttCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTcaca > 2:546349/1‑150 (MQ=255) ggCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCAGGCGCGCACATTATGTTTTCGCATAATTCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGAt < 1:134997/150‑1 (MQ=255) gCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGaa < 2:483362/89‑1 (MQ=255) gCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGaa > 1:483362/1‑89 (MQ=255) gCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTgcg > 2:999346/1‑150 (MQ=255) gCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTGCGCGa < 1:1007210/150‑1 (MQ=255) aCCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTGCGCGAt > 1:564507/1‑146 (MQ=255) aCCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTGCGCGAt < 2:564507/146‑1 (MQ=255) cGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTGCGCGATGTAgtc < 1:147081/150‑1 (MQ=255) | AGCACGGCGACCGTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTGCGCGATGTAGTC > NC_002947/5731773‑5732065 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |