New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2898241 = | 38 (0.880) | 4 (0.090) | 4/250 | NT | 9.4% | coding (423/1413 nt) | PP_2552 | DOPA decarboxylase |
? | NC_002947 | 2898266 = | 40 (0.940) | coding (448/1413 nt) | PP_2552 | DOPA decarboxylase |
TGTCCTGGCAATCCAGCCCGGCCCTGAGCGAACTGGAAGAAACCACCCTCGACTGGCTGCGCCAGTTGCTTGGCCTGTCTGG‑CCAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGCGCCCACGCCCACAGCTCGGTGGACAAGGCTGCACTGCTGGCAGGTTTTGGCC > NC_002947/2898126‑2898401 | tGTCCTGGCAATCCACAACGGCCATGACCGCACCGGAAGCACCCACCCCCGACCGGCGTCGCCAGGTGCTGGGCCTGGCTGG‑CCAGCGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCACGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTg > 2:561809/1‑150 (MQ=255) cctggtccaccgagctgtgggcgggggcgttgacagacacgatcaaaggcttgggctcggcctgcaggccaccacgtaccagggcgtagtcagtggcgcgttcacgggcactGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAAc > 2:497556‑M1/113‑150 (MQ=255) tGGCAATCCAGCCCGGCCCTGAGCGAACTGGAAGAAACCACCCTCGACTGGCTGCGCCAGTTGCTTGGCCTGTCTGG‑CCAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAAcgc > 1:38166/1‑150 (MQ=255) aaTCCAGCCCGGCCCTGAGCGAACTGGAAGAAACCACCCTCGACTGGCTGCGCCAGTTGCTTGGCCTGTCTGG‑CCAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCa > 2:1083814/1‑150 (MQ=255) cTGAGCGAACTGGAAGAAACCACCCTCGACTGGCTGCGCCAGTTGCTTGGCCTGTCTGG‑CCAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTg < 2:1029224/150‑1 (MQ=255) cGAACTGGAAGAAACCACCCTCGACTGGCTGCGCCAGTTGCTTGGCCTGTCTGG‑CCAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACg < 1:403610/150‑1 (MQ=255) aCTGGAAGAAACCACCCTCGACTGGCTGCGCCAGTTGCTTGGCCTGTCTGG‑CCAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACgtgg < 1:525133/150‑1 (MQ=255) aCTGGAAGAAACCACCCTCGACTGGCTGCGCCAGTTGAATAG‑ATGGCGGGACCGCTGGGGGTGGGTGATCAAGGCCACTGCCTCGACCAGCACCCTGGGGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACgtgg < 1:805705/150‑1 (MQ=255) tGGAAGAAACCACCCTCGACTGGCTGCGCCAGTTGCTTGGCCTGTCTGG‑CCAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACgtggtg < 2:392015/150‑1 (MQ=255) gaaACCACCCTCGACTGGCTGCGCCAGTTGCTTGGCCTGTCTGG‑CCAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTg > 1:406516/1‑150 (MQ=255) aaCCACCCTCGACTGGCTGCGCCAGTTGCTTGGCCTGTCTGG‑CCAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCa < 1:1083814/150‑1 (MQ=255) ccTCGACTGGCTGCGCCAGTTGCTTGGCCTGTCTGG‑CCAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGa < 1:26768/150‑1 (MQ=255) cTGGCTGCGCCAGTTGCTTGGCCTGTCTGG‑CCAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCaa < 2:897728/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGTTGCTTGGCCTGTCTGG‑CCAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCttt < 2:244025/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGTTGCTTGGCCTGTCTGG‑CCAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCttt < 1:487764/150‑1 (MQ=255) gcctgcaggccaccacgtaccagggcgtagtcagtggcgcgttcacgggcactGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCa > 2:1126160‑M1/54‑79 (MQ=255) gcctgcaggccaccacgtaccagggcgtagtcagtggcgcgttcacgggcactGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCa < 1:1126160‑M1/26‑1 (MQ=255) aGTTGCTTGGCCTGTCTGG‑CCAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCg > 1:506532/1‑150 (MQ=255) tGCTTGGCCTGTCTGG‑CCAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTCTAGCgtgt < 2:274555/150‑1 (MQ=255) tCTGG‑CCAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGcgcc > 2:1084453/1‑150 (MQ=255) g‑CCAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACTAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGcgcccacg > 1:819991/1‑150 (MQ=255) g‑CCAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTAt < 2:904503/137‑1 (MQ=255) g‑CCAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTAt > 1:904503/1‑137 (MQ=255) cAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGcgcccacgcc > 2:832907/1‑150 (MQ=255) cAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGcgcccacgcc > 1:610450/1‑150 (MQ=255) agtggagtggGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGcgcccacgccc > 1:311473/1‑150 (MQ=255) agtggagtggGGTGATCCAGGACAATGGACCTACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGcgcccacgccc > 1:309138/1‑150 (MQ=255) ggagtggGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGAAATTTACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGCGCCCACGCCcaca < 2:38166/150‑1 (MQ=255) ggTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGCGCCCACGCCCACAGCTCGGt < 1:832907/150‑1 (MQ=255) tGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGCGCCCACGCCCACAGCTCGGTgg > 2:304537/1‑150 (MQ=255) tCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGCGCCCACGCCCACAGCTCGGTGGACa > 2:788953/1‑150 (MQ=255) gttcacgggcactgatcagcgccaccagggtgctggtcAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTCTGTCAACGCCCCCGCCCACAGCTCGGTGGACCAgg > 2:497556‑M2/39‑150 (MQ=255) aGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGCGCCCACGCCCACAGCTCGGTGGACAAgg < 2:207140/150‑1 (MQ=255) gACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGCGCCCACGCCCACAGCTCGGTGGACAAGGCt < 2:311473/150‑1 (MQ=255) gACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCACGACGCTCTTCCGCTGTCTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGCGCCCACGCCCACAGCTCGGTGGACAAGGCt < 2:309138/150‑1 (MQ=255) acacTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGCGCCCACGCCCACAGCTCGGTGGACAAGGCTg < 1:304537/150‑1 (MQ=255) tGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGCGCCCACGCCCACAGCTCGGTGGACAAGGCTGCAct > 1:463934/1‑150 (MQ=255) tCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGCgcccacgcccac < 1:1106116/123‑1 (MQ=255) tCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGCgcccacgcccac > 2:1106116/1‑123 (MQ=255) tgatcagcgccaccagggtgctggtcAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGc > 2:1126160‑M2/27‑79 (MQ=255) tgatcagcgccaccagggtgctggtcAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGc < 1:1126160‑M2/53‑1 (MQ=255) tcagcgccaccagggtgctgatcAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGCGCCCACGCCCACAGCTCGGTGGACAAGGCTGCACTGCTGGCAg > 1:772860‑M2/24‑150 (MQ=255) cTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGCGCCCACGCCCACAGCTCGGTGGACAAGGCTGCACTGCTGGCAGGTTTTGGc > 2:156179/1‑150 (MQ=255) cTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGCGCCCACGCCCACAGCTCGGTGGACAAGGCTGCACTGCTGGCAGGTTTTGGc < 1:156179/150‑1 (MQ=255) tggtggCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGCGCCCACGCCCACAGCTCGGTGGACAAGGCTGCACTGCTGGCAGGTTTTGGcc < 1:1110073/150‑1 (MQ=255) ggtggCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGc < 2:832798/58‑1 (MQ=255) ggtggCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGc > 1:832798/1‑58 (MQ=255) gcTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCaa < 2:709564/69‑1 (MQ=255) gcTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCaa > 1:709564/1‑69 (MQ=255) | TGTCCTGGCAATCCAGCCCGGCCCTGAGCGAACTGGAAGAAACCACCCTCGACTGGCTGCGCCAGTTGCTTGGCCTGTCTGG‑CCAGTGGAGTGGGGTGATCCAGGACACTGCCTCGACCAGCACCCTGGTGGCGCTGATCAGTGCCCGTGAACGCGCCACTGACTACGCCCTGGTACGTGGTGGCCTGCAGGCCGAGCCCAAGCCTTTGATCGTGTATGTCAGCGCCCACGCCCACAGCTCGGTGGACAAGGCTGCACTGCTGGCAGGTTTTGGCC > NC_002947/2898126‑2898401 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |