New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3793872 | 50 (1.150) | 4 (0.100) | 3/244 | NT | 7.9% | coding (694/1191 nt) | PP_3355 | beta‑ketothiolase |
? | NC_002947 | = 3793905 | 45 (1.080) | coding (661/1191 nt) | PP_3355 | beta‑ketothiolase |
GATGAGTGCAATCGGAGTAGCGCGTGACCAAGGCTGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGG > NC_002947/3793758‑3794053 | ggtgaGTGCAACCGGAGTCGCGAGTGACCCAGGCTGCCGCCGCGACATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCct > 2:789784‑M2/3‑148 (MQ=255) aGTGCAATCGGAGTAGCGCGTGACCAAGGCTGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCt < 2:232862/150‑1 (MQ=255) tGCAATCGGAGTAGCGCGTGACCAAGGCTGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGGTGTCATGGCTgg > 2:733010/1‑149 (MQ=255) tCGGAGTAGCGCGTGACCAAGGCTGCCGCCGCACCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACctca < 2:599730/150‑1 (MQ=255) ggAGTAGCGCGTGACCTAGGCTGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACctcact < 2:567805/150‑1 (MQ=255) tAGCGCGTGACCAAGGCTGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTcacg > 1:425326/1‑150 (MQ=255) cgTGACCAAGGCTGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTcacgccacc > 1:389918/1‑149 (MQ=255) ccAAGGCTGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGgca > 1:159920/1‑150 (MQ=255) aaGGCTGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGgcaat > 2:342737/1‑150 (MQ=255) aaGGCGGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGTGgcaat < 1:167222/150‑1 (MQ=255) gCTGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAACCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGgcattgca < 1:1086337/150‑1 (MQ=255) ccgcGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCcgc > 1:1074756/1‑150 (MQ=255) gcgcCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCTGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGt < 1:717918/150‑1 (MQ=255) cgcCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGtg < 1:206930/150‑1 (MQ=255) tCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGtggctgg > 1:207048/1‑150 (MQ=255) ccaccGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGc > 1:499381/1‑150 (MQ=255) cgcgCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGAACGGCAAGTAATA‑GTGCCAGTTCGGCCGGGTCGTGAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTc > 1:861621/1‑150 (MQ=255) aaCTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCGCTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTATCt > 2:379866/1‑150 (MQ=255) aaCTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCt > 2:596879/1‑150 (MQ=255) tGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGGGCAAT‑CGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCa < 1:68351/150‑1 (MQ=255) tGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCa < 1:645887/150‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGt > 2:148353/1‑150 (MQ=255) gCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGc > 1:484804/1‑150 (MQ=255) gCCGTCTGCACGTCATCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTgt < 2:615873/150‑2 (MQ=255) cACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTCCCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGa < 1:254918/150‑1 (MQ=255) cGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGcc > 2:244200/1‑115 (MQ=255) cGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGcc < 1:244200/115‑1 (MQ=255) cACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCtc < 1:733010/150‑1 (MQ=255) gcgcAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTc > 2:475611/1‑105 (MQ=255) gcgcAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTc < 1:475611/105‑1 (MQ=255) gcgcAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGaa < 2:484804/150‑1 (MQ=255) cgcAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAAc < 2:1016288/150‑1 (MQ=255) ccAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGACTGTCctggcccgactgcgcccggtgcacgccggtggcgtgcagacggctggcaacagttgcgcggtggtcgatggcgcggcggcagccttggtcacgcgctactccgattgcactca < 2:788322‑M2/150‑114 (MQ=255) ccAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGAATGTCctggcccgactgcgcccggtgcacgccggtggcgtgcagacggctggcaacagttgcgcggtggtcgatggcgcggcggcagccttggacacgcgctactacgattgcactca < 2:785402‑M2/150‑114 (MQ=255) cAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCctggcccgactgcgcccggtgcacgccggtggcgtgcagacggctggcaacagttgcgcggtggtcgatggcgcggcggcagccttggtcacgc > 2:375859‑M2/1‑36 (MQ=255) cAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCctggcccgactgcgcccggtgcacgccggtggcgtgcagacggctggcaacagttgcgcggtggtcgatggcgcggcggcagccttggtcacgc < 1:375859‑M2/130‑95 (MQ=255) cAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTCTTTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCAc < 1:789787/150‑1 (MQ=255) gCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCCCCTgg < 2:159920/150‑1 (MQ=255) tCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAgg < 1:596879/150‑1 (MQ=255) ggTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTAc > 1:1096845/1‑81 (MQ=255) ggTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTAc < 2:1096845/81‑1 (MQ=255) ggTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGc < 2:207048/150‑1 (MQ=255) gTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTgc < 2:378804/93‑1 (MQ=255) gTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTgc > 1:378804/1‑93 (MQ=255) gTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGcc > 1:429892/1‑150 (MQ=255) aGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCg < 1:274604/150‑1 (MQ=255) ggCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGGCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCCGGGCCCGc < 2:593081/150‑1 (MQ=255) ccGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGACCCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTg > 1:167993/1‑150 (MQ=255) cGTGGGTGGCTGTACTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCACGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGa < 2:603131/150‑1 (MQ=255) gtgggtggCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGAt < 2:861621/150‑1 (MQ=255) tgggtggCTGTCCTGGCTGACCCCACGCACGCCACGCGGGAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATg < 2:511565/150‑1 (MQ=255) gggtggCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATgg < 1:148353/150‑1 (MQ=255) tGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCt < 2:394155/59‑1 (MQ=255) tGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCt > 1:394155/1‑59 (MQ=255) tCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGGCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAgg > 2:710884/1‑150 (MQ=255) | GATGAGTGCAATCGGAGTAGCGCGTGACCAAGGCTGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTC‑GGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGG > NC_002947/3793758‑3794053 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |