New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4848823 | 52 (1.200) | 6 (0.140) | 6/244 | NT | 10.7% | coding (78/1383 nt) | hemN | oxygen‑independent coproporphyrinogen III dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 4848848 | 50 (1.200) | coding (103/1383 nt) | hemN | oxygen‑independent coproporphyrinogen III dehydrogenase |
GCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAAAGACCGCGCCCGCGCTGC > NC_002947/4848701‑4848996 | gCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtg < 1:85943‑M2/150‑3 (MQ=255) ccATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTGCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGACCTCTCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgg > 1:198440‑M2/1‑147 (MQ=255) cATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtggg < 2:276946‑M2/150‑5 (MQ=255) cATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtggg < 2:706225‑M2/150‑5 (MQ=255) tCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGgttcgttc < 2:418358/150‑1 (MQ=255) ggTGCACTTCTGCTCTTTCCGTTTACTACCCTCATGCTCTACGACCTCCTTTGGGATACCTACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCTGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCTCCGTGCAACTGCACAGCGAGTTGGTTTCGTTCGAc < 2:785212/150‑1 (MQ=255) cACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGc < 2:611175/150‑1 (MQ=255) tgctgcTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCa > 1:313670/1‑150 (MQ=255) tttCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTg > 1:451226/1‑150 (MQ=255) ggggACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCga < 2:818233/150‑1 (MQ=255) ggACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCgaga < 1:320802/150‑1 (MQ=255) aCCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGa < 2:482470/150‑1 (MQ=255) ccTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACg < 1:706225/150‑1 (MQ=255) ccTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACg < 2:172178/150‑1 (MQ=255) cTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACgg > 1:327573/1‑150 (MQ=255) tCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCTACggg > 2:205738/1‑150 (MQ=255) aTGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGcc > 2:287828/1‑150 (MQ=255) gCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGt < 1:276946/150‑1 (MQ=255) gCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGt > 1:665616/1‑150 (MQ=255) gacgacCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTCCCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTgcgc < 1:802327/150‑1 (MQ=255) ccTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCTACGGGCCGTGCGCCcgct < 1:205738/150‑1 (MQ=255) cTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCcgctg > 2:550235/1‑150 (MQ=255) gTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCcgctgtcgc > 1:863693/1‑150 (MQ=255) ggATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTa > 2:481770/1‑150 (MQ=255) aTACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCGACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGc < 1:376368/99‑1 (MQ=255) aTACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACg > 1:722779/1‑150 (MQ=255) aTACCGACCTGATCAGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGc > 2:376368/1‑99 (MQ=255) tACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGt < 2:247759/150‑1 (MQ=255) tCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGt > 2:742086/1‑150 (MQ=255) ccgccgCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGtt > 1:1098531/1‑150 (MQ=255) ccgcTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTg < 2:85943/150‑1 (MQ=255) ctactaTCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTgcgc > 2:469379/1‑150 (MQ=255) cTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCATTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCACTGTACGTGCATGTGCCGTTCTgcgc > 2:1119396/1‑150 (MQ=255) tACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCcgctgtcgctg < 1:744118/126‑1 (MQ=255) tACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCcgctgtcgctg > 2:744118/1‑126 (MQ=255) tcGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCt > 1:612984/1‑150 (MQ=255) gCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGc < 2:327573/150‑1 (MQ=255) gCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGc < 1:550235/150‑1 (MQ=255) gggCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGGCCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGctac < 2:313670/150‑1 (MQ=255) gggCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGctac < 2:715124/150‑1 (MQ=255) ccACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCtactac < 2:612984/150‑1 (MQ=255) cACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTactact > 2:1975/1‑150 (MQ=255) aCGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTg > 2:682414/1‑150 (MQ=255) gCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTgcg > 1:702658/1‑150 (MQ=255) gCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTgcg > 1:905503/1‑150 (MQ=255) cTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGcc > 2:443605/1‑67 (MQ=255) cTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGcc < 1:443605/67‑1 (MQ=255) ctctTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgggtaagaggtgtagcgtggcccggcgagatcgtagcggcggatcaggtcggtatcccaacggaggtcgtcgagcatgagggtagtccccggaaagagcagcagtgcaccggag < 1:136881‑M2/150‑116 (MQ=255) ctctTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGcaa > 1:882183/1‑150 (MQ=255) tctTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgggtaagaggtgtagcgtggcccggcgagatcgtagcggcggatcaggtcggtatcccaacggaggtcgtcgagcatgagggtagtccccggaaagagcagcagtgcaccggagt > 2:136881‑M2/1‑34 (MQ=255) tctTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTgc > 2:547883/1‑120 (MQ=255) tctTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTgc < 1:547883/120‑1 (MQ=255) tACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAg < 1:742086/150‑1 (MQ=255) aCCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtggggtaagaggtgtagcgtggcccggcgagatcgtagcggcggatcaggtcggtatcccaacggaggtcgtcgagcatgagggtagtccccggaaagagcagcagtgcaccggagtcta < 2:994634‑M2/150‑121 (MQ=255) aCCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAgg > 2:467540/1‑150 (MQ=255) ccAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgggtaagaggtgtagcgtggcccggcgagatcgtagcggcggatcaggtcggtatcccaacggaggtcgtcgagcatgagggtagtccccggaaa < 2:490981‑M2/124‑97 (MQ=255) ccAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgggtaagaggtgtagcgtggcccggcgagatcgtagcggcggatcaggtcggtatcccaacggaggtcgtcgagcatgagggtagtccccggaaa > 1:490981‑M2/1‑28 (MQ=255) aaCCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGtcat > 1:745323/1‑150 (MQ=255) gTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACNaaa < 2:702658/150‑1 (MQ=255) cTGCACAGCGAGGtggggtaagaggtgtagcgtggcccggcgagatcgtagcggcggatcaggtcggtatcccaacggaggtcgtcgagcatgagggtagtccccggaaagagcagcagtgcaccggagtctatggccgtctgtaggaaa > 1:994634‑M2/1‑13 (MQ=255) ggTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAAAGACCGCGCCCGCGCTgc < 1:196261/150‑1 (MQ=255) | GCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAAAGACCGCGCCCGCGCTGC > NC_002947/4848701‑4848996 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |