New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5706735 = | 44 (1.020) | 3 (0.070) | 3/244 | NT | 6.4% | coding (697/4761 nt) | PP_5009 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 5706777 = | 45 (1.080) | coding (739/4761 nt) | PP_5009 | hypothetical protein |
GTACACGACAGCCTGGCTGTCGAGGCGATACAAGTCACGCTCGGAACGGATGGCGGGGCACACACCGTTACCCTACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCACAGACCGGTGATCGGACAGCCTTTCGCCTTCCAGGCCAGGCAGCTGCTGAACGATATCCTT > NC_002947/5706630‑5706926 | gTACACGACAGCCTGGCTGTCGAGGCGATACAAGTCACGCTCGGAACGGATGGCGGGGCACACACCGTTACCCTACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTtcgt > 2:48911/1‑150 (MQ=255) gTACACGACAGCCTGGCTGTCGAGGCGATACAAGTCACGCTCGGAACGGATGGCGGGGCACACACCGTTACCCTACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTtcgt > 1:593667/1‑150 (MQ=255) aGCCTGGCTGTCGAGGCGATACAAGTCACGCTCGGAACGGATGGCGGGGCACACACCGTTACCCTACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCAACAATTCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTc < 1:366807/150‑1 (MQ=255) aGTCACGCTCGGAACGGATGGCGGGGCACACACCGTTACCCTACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTgc < 2:593667/150‑1 (MQ=255) tCGGAACGGATGGCGGGGCACACACCGTTACCCTACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAAc < 2:287095/150‑1 (MQ=255) gAACGGATGGCGGGGCACACACCGTTACCCTACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGc > 2:248439/1‑150 (MQ=255) gATGGCGGGGCACACACCGTTACCCTACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGa < 2:709561/113‑1 (MQ=255) gATGGCGGGGCACACACCGTTACCCTACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGa > 1:709561/1‑113 (MQ=255) cacacaCCGTTACCCTACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCCAACGATTCTGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCt > 2:317481/1‑150 (MQ=255) acacacCGTTACCCTACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTa > 2:359308/1‑150 (MQ=255) cGTTACCCTACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCtt < 2:655872/150‑1 (MQ=255) ttACCCTACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGc > 2:317114/1‑129 (MQ=255) ttACCCTACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGc < 1:317114/129‑1 (MQ=255) aCCCTACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAg < 2:854054/150‑1 (MQ=255) ccTACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCttt > 2:112302/1‑103 (MQ=255) ccTACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCttt < 1:112302/103‑1 (MQ=255) ccTACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGc < 2:77312/150‑1 (MQ=255) ccTACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGc > 2:339077/1‑150 (MQ=255) tACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTAGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGGGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGt > 2:306946/1‑150 (MQ=255) aCCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGtt < 1:48911/150‑1 (MQ=255) gATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTcc > 1:843123/1‑150 (MQ=255) aTCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCt < 1:1088009/150‑1 (MQ=255) aTTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGgc > 2:212005/1‑150 (MQ=255) ttGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGgcg > 2:231481/1‑150 (MQ=255) cTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGcac > 1:305173/1‑150 (MQ=255) cTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGcac > 1:343371/1‑150 (MQ=255) tcatcaCCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCa > 1:592946/1‑81 (MQ=255) tcatcaCCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCa < 2:592946/81‑1 (MQ=255) tcatcaCCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGcaca > 1:609739/1‑150 (MQ=255) atcaCCACAAGCGGCCACCGCAACCTGGTTCTTCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCACAGa > 2:406428/1‑150 (MQ=255) tcaCCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCACAGAc < 1:231481/150‑1 (MQ=255) caccacAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGt > 2:1119027/1‑131 (MQ=255) caccacAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGt < 1:1119027/131‑1 (MQ=255) accacAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCACAACTTTGCCACTGAGATGCACCAAACGCTTTTTAGATGCTAGCGCTGCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCCCAGACCg > 1:519577/1‑150 (MQ=255) gTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAgg > 2:819770/1‑120 (MQ=255) gTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAgg < 1:819770/120‑1 (MQ=255) caaccgcaaccTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCACAGACCGGTGATCGGACa < 1:211796/150‑1 (MQ=255) AACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCACAGACCGGTGATCGGACAg < 2:388760‑M1/150‑1 (MQ=255) ccgaaccgcagggcttgcattgcagaaccaggttgcggttCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCACAGACCGGTGATCGGACAGcc > 2:437873‑M2/41‑150 (MQ=255) gaaccgcagggcttgcattgcagaaccaggttgcggttCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCACAGACCGGTGAt > 1:666093‑M2/39‑139 (MQ=255) gaaccgcagggcttgcattgcagaaccaggttgcggttCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCACAGACCGGTGAt < 2:666093‑M2/101‑1 (MQ=255) aaccTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCACAGACCGGTGATCGGACAGCCTTTc < 1:212005/150‑1 (MQ=255) ccTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCACAGACCGGTGATCGGACAGCCTTTCGc > 1:760608/1‑150 (MQ=255) cTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCACAGACCGGTGATCGGACAGCCTTTCGcc > 2:165020/1‑150 (MQ=255) ttCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCACAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGGTGTCCTGGGCGGCCAGCGCGGTGATCGGACATCCTTTCCCCCTcc > 1:191552/1‑150 (MQ=255) tgcaatgcaaGCCCTGCGGTTCGGTTTGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCACAGACCGGTGATCGGACAGCCTTTCGc < 1:668084/142‑1 (MQ=255) tgcaatgcaaGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCACAGACCGGTGATCGGACAGCCTTTCGc > 2:668084/1‑142 (MQ=255) ccaatgcaaGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCACAGACCGGTGATCGGACAGCCTTTCGCCTTccaggc < 1:243226/149‑1 (MQ=255) aatgcaaGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCACAGACCGGTGATCGGACAGCCTTTCGCCTTccaggcca < 2:305173/150‑1 (MQ=255) cTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCACAGACCGGTGATCGGACAGCCTTTCGCCTTCCAGGCCAGGCAgctgct > 1:772111/1‑150 (MQ=255) cTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCACAGACCGGTGATCGGACAGCCTTTCGCCTTCCAGGCCAGGCAgctgct < 2:159136/150‑1 (MQ=255) gttcggttcgTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCACAGACCGGTGATCGGACAGCCTTTCGCCTTCCAGGCCAGGCAGCTGCTGAAc > 1:764055/1‑149 (MQ=255) gttcggttcgTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCACAGACCGGTGATCGGACAGCCTTTCGCCTTCCAGGCCAGGCAGCTGCTGAAc < 2:764055/149‑1 (MQ=255) cgtcgCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGAGATGAACAGGCCGACAGGCCATCGCGATCGCTTCGACGCGTTTTCCTGGGCGCACAGACCGGTGATCGGACAGCCTTTCGCCTTCCAGGCCAGGCAGCTGCTGAACGATATCCtt < 1:248439/150‑1 (MQ=255) | GTACACGACAGCCTGGCTGTCGAGGCGATACAAGTCACGCTCGGAACGGATGGCGGGGCACACACCGTTACCCTACCGGATCTATTGCTCATCACCACAAGTGGCAACCGCAACCTGGTTCTGCAATGCAAGCCCTGCGGTTCGGTTCGTCGCCATGTCGACCTGCCCAGCTTTGCCACTGCGCTGCAACGGCAGCTAGCGCAACGCTATCGCTTCGAGGCGTTGTCCTGGGCGCACAGACCGGTGATCGGACAGCCTTTCGCCTTCCAGGCCAGGCAGCTGCTGAACGATATCCTT > NC_002947/5706630‑5706926 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |