New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4586100 | 16 (0.330) | 15 (0.440) | 11/192 | 2.2 | 48.0% | intergenic (+139/+78) | PP_4061/PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
? | NC_002947 | = 4586128 | 21 (0.610) | intergenic (+167/+50) | PP_4061/PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
GAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCC > NC_002947/4585952‑4586246 | gAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGa > 1:9004/1‑150 (MQ=255) ttAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgc > 2:993146‑M1/1‑143 (MQ=255) ttAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgc > 1:244531‑M1/1‑143 (MQ=255) ccACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAAt < 1:514789/150‑1 (MQ=255) cGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATg‑cg < 1:20158/150‑1 (MQ=255) ccGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCt < 2:686912/150‑1 (MQ=255) cGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacgg < 2:216210‑M1/150‑28 (MQ=255) gTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccc > 2:9004‑M2/1‑147 (MQ=255) gAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctg < 1:993146‑M1/150‑34 (MQ=255) aaCAGCTGACCTGCGCTGCGCCGTTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGAATTGCTCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGCCGGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGTGCTGCccctgg > 2:83171‑M2/1‑144 (MQ=255) aGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggta < 2:788987‑M1/149‑37 (MQ=255) aGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggta > 1:788987‑M1/1‑113 (MQ=255) gCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctg > 1:1059695‑M1/1‑112 (MQ=255) gCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctg < 2:1059695‑M1/145‑34 (MQ=255) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGTTGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTCCATT‑CGGAACTGCccctggtaggagcgg > 1:881193‑M2/1‑135 (MQ=255) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgg < 2:244531‑M1/150‑44 (MQ=255) tGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCGAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGacagcgccgcattcaaggccggca < 2:961928‑M1/129‑25 (MQ=255) tGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCGAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGacagacccgcattcaaggccggca > 1:961928‑M1/1‑105 (MQ=255) tGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggta < 2:4215‑M2/141‑9 (MQ=255) tGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggta > 1:4215‑M2/1‑133 (MQ=255) ctCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccg < 1:970411‑M2/150‑25 (MQ=255) ctCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccg < 1:793693‑M2/150‑25 (MQ=255) aTTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCc < 2:460166‑M2/123‑2 (MQ=255) aTTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCc > 1:460166‑M2/1‑122 (MQ=255) ttGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggta > 1:212400‑M1/1‑93 (MQ=255) ttGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggta < 2:212400‑M1/129‑37 (MQ=255) ttGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggag > 2:401232‑M2/1‑121 (MQ=255) ttGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggag < 1:401232‑M2/133‑13 (MQ=255) tGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaaga > 2:793693‑M2/1‑120 (MQ=255) gAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGGTTGGGCCGGTCTCTTCGCGGGGAGACTCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGTCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagag > 2:284510‑M2/1‑119 (MQ=255) gAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagag > 2:970411‑M2/1‑119 (MQ=255) gTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctg < 1:929956‑M1/92‑34 (MQ=255) gTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctg > 2:929956‑M1/1‑59 (MQ=255) aTTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtagga > 1:758662‑M2/1‑74 (MQ=255) aTTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtagga < 2:758662‑M2/85‑12 (MQ=255) ccggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggt < 2:541769‑M1/71‑36 (MQ=255) ccggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggt > 1:541769‑M1/1‑36 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttc > 2:970411‑M1/1‑31 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggacggcacggtccctggtaggagcgagtctccccgcgaagagaccggcccaaccaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttc > 2:284510‑M1/1‑31 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttca > 2:793693‑M1/1‑30 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggta > 2:1075602‑M2/1‑56 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggta < 1:1075602‑M2/64‑9 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACg > 1:935197/1‑150 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggag < 1:970411‑M1/150‑127 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggag < 1:793693‑M1/150‑127 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCAtac > 2:784422/1‑148 (MQ=255) aCCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCcgc > 1:35197/1‑85 (MQ=255) aCCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCcgc < 2:35197/85‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACCAGGGGCAGCGCC‑GCATTCAAGGCCGGCACGGTCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGCTCTCAc < 2:321380/137‑1 (MQ=11) cccGCTCCTACCAGGGGCAGCGCC‑GCATTCAAGGCCGGCACGGTCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCAc > 1:321380/1‑137 (MQ=14) ccGCTCCTACCAGGGgcagttccgaatggaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcaacctcaacctttcaatggagcagcgcaga > 1:881193‑M1/1‑15 (MQ=255) ccGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagc > 2:389513‑M1/1‑15 (MQ=255) ccGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagc < 1:389513‑M1/56‑42 (MQ=255) ccGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgcaga < 2:244531‑M2/150‑108 (MQ=255) ccGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTc > 1:1007679/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggagcgg > 2:389513‑M2/1‑41 (MQ=255) gCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggagcgg < 1:389513‑M2/56‑16 (MQ=255) cTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaa > 2:401232‑M1/1‑12 (MQ=255) cTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaa < 1:401232‑M1/133‑122 (MQ=255) tCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaat > 1:758662‑M1/1‑11 (MQ=255) tCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaat < 2:758662‑M1/85‑75 (MQ=255) cTACCCGGGACCGTGCCGTCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCAcc < 2:935197/150‑1 (MQ=255) tACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgca > 1:4215‑M1/1‑8 (MQ=255) tACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgca < 2:4215‑M1/141‑134 (MQ=255) tACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaa > 2:1075602‑M1/1‑8 (MQ=255) tACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaa < 1:1075602‑M1/64‑57 (MQ=255) tACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgcagatcagct < 2:788987‑M2/149‑114 (MQ=255) tACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgcagatcagct > 1:788987‑M2/1‑36 (MQ=255) tACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaa < 2:212400‑M2/129‑94 (MQ=255) tACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaa > 1:212400‑M2/1‑36 (MQ=255) aCCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgg < 2:541769‑M2/71‑37 (MQ=255) aCCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgg > 1:541769‑M2/1‑35 (MQ=255) ccAGGGgcagcaccgcattcaaggccggcaccggccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgagcaattcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaacggcgcagcgcaggtcagctgtt > 2:83171‑M1/1‑6 (MQ=255) cAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgcagatcagctgttc < 1:993146‑M2/150‑118 (MQ=255) cAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgcagatcagc > 1:1059695‑M2/1‑33 (MQ=255) cAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgcagatcagc < 2:1059695‑M2/145‑113 (MQ=255) cAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcac < 1:929956‑M2/92‑60 (MQ=255) cAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcac > 2:929956‑M2/1‑33 (MQ=255) cAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGAt > 1:965025/1‑121 (MQ=255) cAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGAt < 2:965025/121‑1 (MQ=255) cAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGc > 2:998946/1‑150 (MQ=255) cAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGc > 2:1198485/1‑150 (MQ=255) ggggcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgcagatcagctgttcac > 2:9004‑M1/1‑3 (MQ=255) ggcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaat > 1:460166‑M1/1‑1 (MQ=255) ggcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaat < 2:460166‑M1/123‑123 (MQ=255) | GAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCC > NC_002947/4585952‑4586246 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |