| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4876479 | 110 (2.090) | 12 (0.250) | 10/228 | NT | 11.1% | intergenic (+272/+165) | PP_4284/pucM | transporter/5‑hydroxyisourate hydrolase |
| ? | NC_002947 | = 4876537 | 90 (1.850) | intergenic (+330/+107) | PP_4284/pucM | transporter/5‑hydroxyisourate hydrolase | |||||
CTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4876322‑4876479‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggtGAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTAC < NC_002947/4876537‑4876390 CTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCAT > 1:280566/1‑150 GCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTC > 2:754652/1‑150 GCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTC > 2:1276949/1‑150 CCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCCATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCG > 1:1302205/1‑150 CCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCG > 1:692484/1‑150 CCACCGTATTCGCGGTTAAACCCGCTCCTACAACCGTGGTCGACAGTTGTATCAAGCCCTCCGTTCTAGTCGCTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGG < 1:526736/150‑1 CCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGG < 1:36024/150‑1 CTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCT < 1:1115817/147‑1 CTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCT > 2:1115817/1‑147 CAGCTGGATACAGCCTGCCGTAGGGGCGGGTTCCCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGAGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCC < 2:987462/150‑1 GATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTA < 2:692484/150‑1 ATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAG < 1:754652/150‑1 CAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAG > 1:1347876/1‑147 CAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAG < 2:1347876/147‑1 CCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGG < 1:321353/150‑1 cgatctCGCGAAGAGTCCGGCCCTGCTGGCCAACCCCTACCCGCCGTTCACCGTCGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGATGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCG < 2:988220/144‑1 GCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGCTTACCCGCGAATGCGGggatcg > 1:988220/1‑144 CCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAG > 2:499758/1‑88 CCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAG < 1:499758/88‑1 ccccTTCGCGGGTGACCCCGCTCCTTCGATGGGCTGTGTTTAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAA < 1:114253/146‑1 TCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACACGC < 2:1308970/150‑1 GGTGAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTA > 1:251765/1‑150 GTGAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTAC > 1:557360/1‑150 GTGAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGGGAACGGCGGGTAGGGATTGAGCAGCAGGGCCGGCCTCTTAGGGGGAGAACCCGCTCCTAC > 2:507175/1‑150 CTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4876322‑4876479‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggtGAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTAC < NC_002947/4876537‑4876390 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |