| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4876479 | 110 (2.090) | 12 (0.250) | 10/228 | NT | 11.1% | intergenic (+272/+165) | PP_4284/pucM | transporter/5‑hydroxyisourate hydrolase |
| ? | NC_002947 | = 4876537 | 90 (1.850) | intergenic (+330/+107) | PP_4284/pucM | transporter/5‑hydroxyisourate hydrolase | |||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
CCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGAAGA > NC_002947/4876331‑4876627 | ccGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTa > 2:691919/1‑150 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCt > 2:817683/1‑150 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCt > 1:1183317/1‑150 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTc > 2:557360/1‑150 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATGCCTAACCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa > 2:522093/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGTCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACgg > 1:507175/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACgg < 1:486026/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACgg > 2:486026/1‑150 (MQ=255) ccgatcTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACggg < 1:1371405/145‑1 (MQ=255) cGCTCCGACAAGGGGGGTGGACAGTTGGAACCAGACCTGCGTATGAGCGGGTTCCCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACggg < 2:473879/150‑1 (MQ=17) tCCTACCACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTg < 2:130997/150‑1 (MQ=255) cTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTaaacccgctcctacgacgggct > 2:1115817‑M1/1‑125 (MQ=255) cTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGa < 1:1271320/150‑1 (MQ=255) cAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACACGCTCATAACACggggagatcgg > 2:1371405/1‑143 (MQ=18) aaCGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTGGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGt > 1:315114/1‑150 (MQ=255) aCGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGtt < 1:1362518/150‑1 (MQ=255) aCGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGtt < 1:395393/150‑1 (MQ=255) ggtggtGTACGGTCGGCTACAGCCCGCCGTAGACGCGGGTCCCCCCGCGACGAGACCGGCCCTGTTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTgg < 2:344810/150‑1 (MQ=17) 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aGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCcg > 2:138571/1‑150 (MQ=255) gATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTgaacccgctcctacgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtggta < 2:692484‑M1/150‑48 (MQ=255) gATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGt > 2:1011625/1‑125 (MQ=255) gATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGt < 1:1011625/125‑1 (MQ=255) gATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTa < 1:1212533/150‑1 (MQ=255) aTACAGCCCGCCGTAGGAGGGGGCACACAGGCGCAGCTGCTCACGCTCCGGTCCGATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAg < 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cccGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTaaacccgctcctacgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtggtaggagcgg < 1:321353‑M1/150‑55 (MQ=255) ccgccgTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCggg > 2:146580/1‑150 (MQ=255) gCGTGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCacccgcga < 2:1308970‑M2/150‑9 (MQ=255) gTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAagag > 1:401097/1‑150 (MQ=255) gTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACACGNCNTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGCTTGGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCAGCGAagag > 1:448584/1‑150 (MQ=17) 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ccaccaCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCggg > 1:662439/1‑150 (MQ=255) caccGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCcgtcgt > 1:730892/1‑62 (MQ=255) caccGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCcgtcgt < 2:730892/62‑1 (MQ=255) caccGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCaa > 1:190010/1‑150 (MQ=255) accGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCaaa < 1:730151/150‑1 (MQ=255) accGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCaaa < 2:1183317/150‑1 (MQ=255) ccccttcgcgGGTgaccccgctccttcgatgggctgtgtttaactgtccaccccgtggtaggagcgggtttacccgcgaatgcggtggtggcggcaacggtgaacggcgggtagggattggccagcagggccggcctcttcgcgggtgaa < 1:114253‑M1/146‑138 (MQ=255) cGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCaaa < 2:517140/103‑1 (MQ=255) cGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAgg > 1:809599/1‑150 (MQ=255) aTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGAcc < 2:1318486/150‑1 (MQ=255) cgcgGGTAAACCCGCTCCTACCCCGGGGTGGCCAGTCGGACACAGCCCGTCGTAGAAGCTGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTAc < 2:337087/150‑1 (MQ=38) cgcgGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTAc > 1:161600/1‑150 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGaa < 2:161600/150‑1 (MQ=255) ggTgaacccgctcctacgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtggtaggagcgggtttacccgcgaatgcggtggtggcggcaacggtgaacggcgggtagggattggccagcagggccggcctcttcgcgggtgaacccgctccta > 1:251765‑M1/1‑3 (MQ=255) gTgaacccgctcctacgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtggtaggagcgggtttacccgcgaatgcggtggtggcggcaacggtgaacggcgggtagggattggccagcagggccggcctcttcgcgggtgaacccgctcctac > 1:557360‑M1/1‑2 (MQ=255) gTgaacccgctcctacgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtggtaggagcgggtttacccgcgaatgcggtggtggcggcaacggggaacggcgggtagggattgagcagcagggccggcctcttagggggagaacccgctcctac > 2:507175‑M1/1‑2 (MQ=255) | CCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGAAGA > NC_002947/4876331‑4876627 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |