New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 277249 | 87 (1.660) | 5 (0.100) | 5/232 | NT | 7.1% | intergenic (‑82/+15) | PP_0223/PP_0224 | DszC family monooxygenase/DszC family monooxygenase |
? | NC_002947 | = 5538647 | 48 (0.970) | intergenic (+89/+32) | PP_4871/PP_4872 | lysine decarboxylase family protein/hypothetical protein |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
ATCGCTGGTGATGATATTTGTAGTCATGTTGTTCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCATTTCGCCAGTGGCGGTCGAGGTTGAACTCG > NC_002947/277102‑277396 | aTCGCTGGTGATGATATTTGTAGTCATGTTGTTCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGccccc > 2:684552/1‑150 (MQ=255) tCGCTGGTGATGATATTTGTAGTCATGTTGTTCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCTTTGCAGCCCatc < 1:481519‑M1/150‑4 (MQ=255) tCGCTGGTGATGATATTTGTAGTCATGTTGTTCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCCGGCTTGTGTCGCGATGGGCTGCTTTGCAGCCCatc < 1:1182654‑M1/150‑4 (MQ=255) cGCTGGTGATGATATTTGTAGTCATGTTGTTCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAg < 2:93821/150‑1 (MQ=255) gCTGGTGATGATATTTGTAGTCATGTTGTTCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAgg < 1:1319321/150‑1 (MQ=255) cTGGTGATGATATTTGTAGTCATGTTGTTCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAggg > 1:419166/1‑150 (MQ=255) gatgatATTTGTAGTCATGTTGTTCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCTCTCCCAAAGAAAAACGAGCGCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGc > 1:461382/1‑150 (MQ=38) gatGTTTGTAGTCATGTTGTTCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAgg < 1:735227/141‑1 (MQ=255) gatGTTTGTAGTCATGTTGTTCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAgg > 2:735227/1‑141 (MQ=255) atTTGTAGTCATGTTGTTCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCa < 1:1090570/150‑1 (MQ=255) tttGTATTCATGTTGTTCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAg > 2:1400344/1‑150 (MQ=255) tttGTAGTCATGTTGTTCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCTACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAg > 2:18074/1‑150 (MQ=255) tttGTAGTCATGTTGTTCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCa < 2:482827/135‑1 (MQ=255) tttGTAGTCATGTTGTTCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCa > 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ggttgttCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAAt < 2:577178/149‑1 (MQ=255) gttgttCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATg > 1:355560/1‑150 (MQ=255) gttgttCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATg > 2:529382/1‑150 (MQ=255) gttgttCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATg > 1:505646/1‑150 (MQ=255) gttgttCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATg > 2:460289/1‑150 (MQ=255) 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ggCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCgcaggcag < 1:328816/150‑1 (MQ=255) gCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGcaggcagg < 2:1067633/150‑1 (MQ=255) ccATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAggg < 1:238530/150‑1 (MQ=255) ttGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGc > 2:644081/1‑150 (MQ=255) gCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTTCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAGATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTa > 2:44951/1‑150 (MQ=255) 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< 2:202413/115‑1 (MQ=255) acaTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATg > 1:202413/1‑115 (MQ=255) tCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGcc > 1:443966/1‑114 (MQ=255) tCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGcc < 2:443966/114‑1 (MQ=255) gcgACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAAGGAGTCAGCGCCCAcc < 2:96122/150‑1 (MQ=255) gACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACcgc < 1:1273726/150‑1 (MQ=255) acaAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTg > 1:924596/1‑150 (MQ=255) 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aCCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGACGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCAt > 1:601481/1‑150 (MQ=255) aCCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGAAATGCCGCTCAGGCAGTGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCACCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCAt < 2:623814/150‑1 (MQ=255) ccTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCatcgcgacacaaggccgctcccccattgcctttgtgggagcg > 2:1266217‑M1/1‑31 (MQ=255) ccTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCatcgcgacacaaggccgctcccccattgcctttgtgggagcg < 1:1266217‑M1/73‑43 (MQ=255) gtCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTACGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCATTTCGCCa < 1:460289/150‑1 (MQ=255) gATGGGCTGCAAAGCAGCCCatcgcgacacaaggccgctcccccattgcctttgtgggagcggccttgtgtcgcgaaaggaccgcgaagcggtcccaaaagtctcagcttcagtcaggctgcttgtcgacccacttaggcgcgaccggcg > 1:651328‑M1/1‑20 (MQ=255) gATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCATTTCGCCAGTGGc < 1:978633/150‑1 (MQ=255) aTGGGCTGCAAAGCAGCCCatcgcgacacaaggccgctcccccattgcctttgtgggag < 2:1353140‑M1/59‑41 (MQ=255) aTGGGCTGCAAAGCAGCCCatcgcgacacaaggccgctcccccattgcctttgtgggag > 1:1353140‑M1/1‑19 (MQ=255) ggCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCATTTCGCCAGTGGCGGTc < 1:495415/150‑1 (MQ=255) cAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCATTTCGCCAGTGGCGGTCGAGGt < 2:924596/150‑1 (MQ=255) aaaGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCATTTCGCCAGTGGCGGTCGAGGtt < 1:644081/150‑1 (MQ=255) gcagcCCatcgcaacacaaggccgctcccccattgcctttgtgggagcggccttgtgtcgcgaaaggaccgcgaagcggtcccaaaagtctcagcttcagtcaggctgcttgtcgacccacttaggcgcgaccggcgccacaaagctgtc < 1:294991‑M1/150‑144 (MQ=255) gcagcCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCATTTCGCCAGTGGCGGTCGa < 1:1035872/143‑1 (MQ=255) gcagcCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCATTTCGCCAGTGGCGGTCGa > 2:1035872/1‑143 (MQ=255) cagcCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCATTTCGCCAGTGGCGGTCGAGGtt > 1:1355750/1‑146 (MQ=255) cagcCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCATTTCGCCAGTGGCGGTCGAGGtt < 2:1355750/146‑1 (MQ=255) agcCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCATTTCGCCAGTGGCGGTCGAGGTTGAACt > 2:1331539/1‑150 (MQ=255) cccccAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCATTTCGCCAGTGGCGGTCGAGGTTGAACTCg < 1:1373831/150‑1 (MQ=255) | ATCGCTGGTGATGATATTTGTAGTCATGTTGTTCTCCGGGGCCATTGGGGCCGCTTTGCGGCACATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAAACTGCGCTCTACTTGTGGGAGCGACCTTGTGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCCAGGGCCCGCAAATCAGATCCAGGAATGCCGCGCAGGCAGGGTGCCGTTAAGGTGGTAAGCGCCCACCGCGTGGTACTTCCAGCGCACCGGGTCGTGCAGGGTGTGCACCCGGGCATTTCGCCAGTGGCGGTCGAGGTTGAACTCG > NC_002947/277102‑277396 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |