New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 403254 = | 60 (1.140) | 4 (0.090) | 3/216 | NT | 7.3% | intergenic (‑54/+115) | msrA/PP_0337 | peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/sensory box protein |
? | NC_002947 | = 5162628 | 49 (1.060) | intergenic (+103/+98) | PP_4544/PP_4545 | hypothetical protein/beta‑ketodecanoyl‑ACP synthase |
GGGCAGGCTCATTGGCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGC > NC_002947/403108‑403402 | gggCAGGCTCATTGGCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGcc > 2:1000470/1‑150 (MQ=255) tgacgtcgacaccctgcaggtagacctggaagccaagttctaagcaacaccctgctctgcttcacctgaagcgggaaacgccgaccccatccggcgtttcccgcttctttttgtctgtgtgaaatgcgccggccccttcgcgggctTGcc > 2:63880‑M1/147‑150 (MQ=255) aGGCTCATTGGCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCt < 1:1044651/150‑1 (MQ=255) gtcgacaccctgcaggtagacctggaagccaagttctaagcaacaccctgctctgcttcacctgaagcgggaaacgccgaccccatccggcgtttcccgcttctttttgtctgtgtgaaatgcgccggccccttcgcgggctTGCCCGCt < 1:1317028‑M1/8‑1 (MQ=255) caccctgcaggtagacctggaagccaagttctaagcaacaccctgctctgcttcacctgaagcgggaaacgccgaccccatccggcgtttcccgcttctttttgtctgtgtgaaatgcgccggccccttcgcgggctTGCCCGCTCCcac > 1:952791‑M1/138‑150 (MQ=255) ttGGCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGAGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAg < 1:444330/150‑1 (MQ=255) accctgcaggtagacctggaagccaagttctaagcaacaccctgctctgcttcacctgaagcgggaaacgccgaccccatccggcgtttcccgcttctttttgtctgtgtgaaatgcgccggccccttcgcgggctTGCCCGCTCCcaca < 1:921014‑M1/14‑1 (MQ=255) ctgcaggtagacctggaagccaagttctaagcaacaccctgctctgcttcacctgaagcgggaaacgccgaccccatccggcgtttcccgcttctttttgtctgtgtgaaatgcgccggccccttcgcgggctTGCCCGCTCCCACAGGt < 1:625657‑M1/17‑1 (MQ=255) gtgtCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACa > 2:931777/1‑150 (MQ=255) gtagacctggaagccaagttctaagcaacaccctgctctgcttcacctgaagcgggaaacgccgaccccatccggcgtttcccgcttctttttgtctgtgtgaaatgcgccggccccttcgcgggctTGCCCGCtcccacaggataaccc < 1:519209‑M1/23‑8 (MQ=255) gcgGCCAGGCAGGGCCCGTTCAGCGGTGTGCATACCTTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGTCACTAT‑GCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGcaca < 1:1315402/150‑1 (MQ=255) caggcaggGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGttt > 2:713334/1‑150 (MQ=255) aggcaggGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGcgaa < 1:1349935/129‑4 (MQ=255) aggcaggGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGcgaa > 2:1349935/1‑126 (MQ=255) gcaggGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCaa > 2:258301/1‑150 (MQ=255) aggGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAg > 2:1340198/1‑150 (MQ=255) gCCTGTTTCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCTTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGTGGTTTGGGCCTTCGCGCGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGt‑t < 2:271303/150‑1 (MQ=255) gCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAg < 1:1174554/138‑1 (MQ=255) gCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAg > 2:1174554/1‑138 (MQ=255) tGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑tgtg < 2:842635/150‑1 (MQ=255) tGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑tgtg > 1:442331/1‑150 (MQ=255) ttCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATGCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑Tgtggt > 2:781597/1‑150 (MQ=255) tGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCtgt < 1:258301/150‑1 (MQ=255) caccctgctctgcttcacctgaagcgggaaacgccgaccccatccggcgtttcccgcttctttttgtctgtgtgaaatgcgccggccccttcgcgggctTGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGTTCTCAAGGTC‑TGTGGTGATACtgt > 1:902074‑M1/100‑150 (MQ=255) ggCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTgg < 2:868476/150‑1 (MQ=255) ctgctctgcttcacctgaagcgggaaacgccgaccccatccggcgtttcccgcttctttttgtctgtgtgaaatgcgccggccccttcgcgggctTGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGTTCTCAAGGTC‑TGTGGTGATACTGTGGGa > 2:625657‑M1/96‑150 (MQ=255) aCGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGTGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCgg < 1:800001/150‑1 (MQ=255) aCCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGa > 2:1251473/1‑150 (MQ=255) cAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGaaa > 2:1067659/1‑150 (MQ=255) gATTTCCGAACGCAG‑GATCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCACCCCCAGGTACAGCACAGGTTCCAAAGGT‑TTTGGTATTCCTTTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAggg < 2:1085597/150‑1 (MQ=38) gATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAg < 1:935455/89‑1 (MQ=255) gATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAg > 2:935455/1‑89 (MQ=255) ttgccGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGcc < 2:602141/147‑1 (MQ=255) gaaagaaG‑GACCATGGCCGTTGCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAAt > 2:668062/7‑150 (MQ=255) gAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAAt > 1:638660/1‑150 (MQ=255) gAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAAt > 2:1211479/1‑150 (MQ=255) gAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAAt > 1:242634/1‑150 (MQ=255) aaCGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑tgtg > 2:890370/1‑107 (MQ=255) aaCGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑tgtg < 1:890370/107‑1 (MQ=255) aCGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGCGAGGGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATgg < 2:1303899/150‑1 (MQ=255) cGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCAGAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGc < 2:343545/150‑1 (MQ=255) cGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGc < 2:638660/150‑1 (MQ=255) ccatccggcgtttcccgcttctttttgtctgtgtgaaatgcgccggcctcttcgcgggctTGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGTTCTCAA‑GGTCTGTGGTGATACTGTGGGa < 2:722172‑M1/55‑1 (MQ=255) ccatccggcgtttcccgcttctttttgtctgtgtgaaatgcgccggcctcttcgcgggctTGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGTTCTCAA‑GGTCTGTGGTGATACTGTGGGa > 1:722172‑M1/61‑115 (MQ=255) ccATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGGATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCtata < 2:884310/150‑1 (MQ=255) ccATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCtata < 1:1211479/150‑1 (MQ=255) ccGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGccc > 2:1023785/1‑150 (MQ=255) gTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGa < 2:442331/150‑1 (MQ=255) tCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAgg < 1:713334/150‑1 (MQ=255) ccTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGa < 1:917691/150‑1 (MQ=255) ctGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGAGTa > 1:892045/1‑150 (MQ=255) tgtgCTTATTGAGCGGCGTAAGGGTGCGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTAc > 2:525026/1‑150 (MQ=37) gtgtTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACg < 1:931777/150‑1 (MQ=255) gtTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGt < 2:1225710/102‑1 (MQ=255) gtTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGt > 1:1225710/1‑102 (MQ=255) ttATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGTCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGACCAACAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGc < 1:684819/150‑1 (MQ=39) ttCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGt > 1:432276/1‑150 (MQ=255) ttCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGt < 2:432276/150‑1 (MQ=255) cAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCa < 1:1172068/150‑1 (MQ=255) aGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAg > 1:1214430/1‑150 (MQ=255) gTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTAAGCAGCTGTCAgg > 2:576067/1‑150 (MQ=255) gggTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCa > 2:1264923/1‑150 (MQ=255) gTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑tgtg < 2:1388254/66‑1 (MQ=255) gTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑tgtg > 1:1388254/1‑66 (MQ=255) gTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGcc > 1:989274/1‑103 (MQ=255) gTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGcc < 2:989274/103‑1 (MQ=255) ggTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGcc > 2:724985/1‑150 (MQ=255) ggTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGc > 2:1399954/1‑149 (MQ=255) ggTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGc < 1:1399954/149‑1 (MQ=255) tGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAGAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGGGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCAcgc < 1:781597/150‑1 (MQ=255) cTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATa > 1:953216/1‑150 (MQ=255) aTGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGc > 1:141180/1‑150 (MQ=255) | GGGCAGGCTCATTGGCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAG‑GACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGT‑TGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGC > NC_002947/403108‑403402 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |