| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 507040 | 81 (1.540) | 5 (0.110) | 4/220 | NT | 5.9% | intergenic (+49/+84) | trpE/estP | anthranilate synthase component 1/esterase EstP |
| ? | NC_002947 | = 507074 | 86 (1.830) | intergenic (+83/+50) | trpE/estP | anthranilate synthase component 1/esterase EstP | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
GACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTT > NC_002947/506896‑507189 | gACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGt > 2:1315067/1‑150 (MQ=255) tCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTgc > 1:1369629/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCaa < 2:1425244/150‑1 (MQ=255) gCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAg < 1:628048/150‑1 (MQ=255) tGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGc > 2:1111080/1‑150 (MQ=255) ntGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGNGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAGCCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATAc > 1:228772/2‑150 (MQ=255) tGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCAGCTCCCAGAAGGTTGCACACGCCTCTTGCATaag > 2:791901/1‑148 (MQ=255) ggAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAg > 2:425578/1‑150 (MQ=255) gaagaaACCATCAACAAGCGCCGGACGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAgg > 1:692207/1‑150 (MQ=255) aagaaACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAg < 1:252971/148‑1 (MQ=255) aCCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCg > 2:1087733‑M2/1‑149 (MQ=255) cATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTTATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgta < 2:694446‑M2/150‑4 (MQ=255) tCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtagg < 1:96923‑M2/150‑6 (MQ=255) aaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgg < 1:541303‑M1/150‑45 (MQ=255) aaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGcc < 1:1082350/137‑1 (MQ=255) aaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGcc > 2:1082350/1‑137 (MQ=255) aGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcggg > 1:425578‑M2/1‑139 (MQ=255) aGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcggg > 2:96923‑M2/1‑139 (MQ=255) gggCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCAcc > 2:800062/1‑150 (MQ=255) ggCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCAccc < 1:566152/150‑1 (MQ=255) gCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCcg > 2:1213364/1‑150 (MQ=255) cGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcgg > 1:1336086‑M2/1‑130 (MQ=255) cGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCcgc < 1:815471/150‑1 (MQ=255) ttCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTCATTGGGGCTGCTGCGCAT‑CAGCCAAATAGTTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATg < 1:1315067/150‑1 (MQ=255) cGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTTATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGc < 1:694446/150‑1 (MQ=255) tGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAg > 1:621112/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCaaa > 1:715818/1‑148 (MQ=255) ggCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCaaa < 2:715818/148‑1 (MQ=255) gCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCg < 2:76149/150‑1 (MQ=255) gTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGc < 1:1111080/150‑1 (MQ=255) ttGGCCCAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGAGTGGGGCTGCTGAGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGTTCCTAGAAGGTTGCGCCAGCCTCAGGCATGCGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCTTTGCGGcc < 2:290407/150‑1 (MQ=38) tGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGccc < 2:110671/150‑1 (MQ=255) ggCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGcccc > 1:334963/1‑150 (MQ=255) gCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGa < 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attgattgGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAAc > 2:562636/1‑150 (MQ=255) attgGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAGCCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCaaa < 1:815028/113‑1 (MQ=255) attgGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAAccccc > 1:1256420/1‑150 (MQ=255) ttgGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggag > 2:1252543‑M2/1‑78 (MQ=255) ttgGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggag < 1:1252543‑M2/85‑8 (MQ=255) gctgcGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATa > 2:415632/1‑150 (MQ=255) 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cccGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTaa > 2:149869/1‑111 (MQ=255) cccGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTaa < 1:149869/111‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCActct > 1:1051027/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaacatcg > 1:1336086‑M1/1‑10 (MQ=255) ccGCTCCTACgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaacatcg < 2:1336086‑M1/140‑131 (MQ=255) ccGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaacatcgcccggcgctt < 1:541303‑M2/150‑107 (MQ=255) ccGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctc > 1:507715‑M2/1‑44 (MQ=255) ccGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGcc > 2:893826/1‑73 (MQ=255) cGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTg < 2:621112/150‑1 (MQ=255) gCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcg > 1:543901‑M2/1‑42 (MQ=255) gCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcg < 2:543901‑M2/113‑72 (MQ=255) cTCCTACgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaa < 1:1252543‑M1/85‑79 (MQ=255) cTCCTACgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaa > 2:1252543‑M1/1‑7 (MQ=255) tCCTACgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctgg > 1:58620‑M1/1‑6 (MQ=255) tCCTACgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctgg < 2:58620‑M1/97‑92 (MQ=255) tCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTgcgc < 2:1256420/150‑1 (MQ=255) ccTACgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaacatcgcccggcgcttgttga < 1:96923‑M1/150‑146 (MQ=255) ccTACgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaacatcgcccggcgcttgttga < 2:1382779‑M1/150‑146 (MQ=255) cTACgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgc > 2:224195‑M1/1‑4 (MQ=255) tACgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaataaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaacatcgcccggcgcttgttgatg < 2:694446‑M1/150‑148 (MQ=255) tACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCaa > 2:100476/1‑149 (MQ=255) cgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaacatcgcccggcgcttgttgatggt > 2:1087733‑M1/1‑1 (MQ=255) cAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCt > 2:715177/1‑119 (MQ=255) cAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCt < 1:715177/119‑1 (MQ=255) cAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGtt < 2:1351287/150‑1 (MQ=255) cAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGtt > 1:959184/1‑150 (MQ=255) | GACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTT > NC_002947/506896‑507189 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |