New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 507074 | 86 (1.830) | intergenic (+83/+50) | trpE/estP | anthranilate synthase component 1/esterase EstP |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
ACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGCCAC > NC_002947/506926‑507219 | aCCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCg > 2:1087733‑M2/1‑149 (MQ=255) cATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTTATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgta < 2:694446‑M2/150‑4 (MQ=255) tCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtagg < 2:1382779‑M2/150‑6 (MQ=255) aGCTCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATCAGCGTCTGGTTCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcggg > 2:194536‑M2/1‑139 (MQ=255) aGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcggg > 2:96923‑M2/1‑139 (MQ=255) aGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcggg > 1:1382779‑M2/1‑139 (MQ=255) gggCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCAcc > 2:800062/1‑150 (MQ=255) gCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCcg > 2:1213364/1‑150 (MQ=255) cGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcgg < 2:1336086‑M2/140‑11 (MQ=255) cGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtaggagcgg > 1:1336086‑M2/1‑130 (MQ=255) cGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCcgc < 1:815471/150‑1 (MQ=255) ttCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTCATTGGGGCTGCTGCGCAT‑CAGCCAAATAGTTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATg < 1:1315067/150‑1 (MQ=255) cGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTTATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGc < 1:694446/150‑1 (MQ=255) cGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGc > 1:1351287/1‑150 (MQ=255) tGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAg > 1:621112/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCaaa > 1:715818/1‑148 (MQ=255) ggCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCaaa < 2:715818/148‑1 (MQ=255) gCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCg < 2:76149/150‑1 (MQ=255) 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tCCGTCACATAAATTGATTCTCGTTACTGCTCCG‑CCCATTCTCGGGGAAACCCGCTCCTACACGATTGCGCGAGCCGCAGGCATGCGAGGCGGTG‑GTAGGAGCTGGTTCACCCGCATATGGGCCGCATAGCGGCCCCCAGCAATTCAGaa < 2:228772/150‑1 (MQ=255) tCCGCCAGATAAATTGATGGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGaa < 2:259367/150‑1 (MQ=255) cGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCaaa < 1:166968/127‑1 (MQ=255) gCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGcc < 2:690128/121‑1 (MQ=255) ccAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtagga > 1:58620‑M2/1‑91 (MQ=255) ccAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCgtagga < 2:58620‑M2/97‑7 (MQ=255) aGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGCTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTGCAc > 1:1043238/1‑150 (MQ=255) aGATAAATTGATTGGGGCTGCTG‑ACAGTCTGATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCAc > 1:1107280/1‑150 (MQ=38) aaTTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTaa < 1:1030916/150‑1 (MQ=255) attgattgGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAAc > 2:562636/1‑150 (MQ=255) attgGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAGCCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCaaa > 2:815028/1‑113 (MQ=255) attgGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAGCCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCaaa < 1:815028/113‑1 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gcAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTccc > 2:237012/1‑150 (MQ=255) cTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCaa > 2:625999/1‑150 (MQ=255) cTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGGTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCaa > 1:1114354/1‑150 (MQ=255) aGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCTACGCTAACCACCACCCAACTCCTCTGAGGGGTCAAGTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATg > 1:674261/1‑150 (MQ=37) aGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATg > 1:874260/1‑150 (MQ=255) cATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCAc < 1:562636/150‑1 (MQ=255) aTACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCtt < 2:446926/119‑1 (MQ=255) aTACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCtt > 1:446926/1‑119 (MQ=255) ggCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGcc < 1:791901/150‑1 (MQ=255) ggCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGcc > 2:1220591/1‑150 (MQ=255) ccGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTCGACGTGCCCGCGCAAATGCACCCCTGccac < 1:691763/150‑1 (MQ=255) gtc‑gtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACtcat < 2:308630/102‑1 (MQ=255) gtc‑gtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACtcat > 1:308630/1‑102 (MQ=255) tc‑gtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCa > 2:605009/1‑131 (MQ=255) tc‑gtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCa < 1:604825/131‑1 (MQ=255) tc‑gtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCa > 2:604825/1‑131 (MQ=255) tc‑gtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCa < 1:605009/131‑1 (MQ=255) | ACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAG‑CCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTC‑GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCACTCTTGCGCCAGTTGTAGTTCCCGCGCAAATGCACCCCTGCCAC > NC_002947/506926‑507219 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |