New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 688284 | 50 (0.950) | 4 (0.080) | 4/236 | NT | 7.8% | coding (1146/1182 nt) | ydgK | Bcr/CflA family multidrug resistance transporter |
? | NC_002947 | = 688348 | 46 (0.910) | coding (24/183 nt) | PP_5446 | hypothetical protein |
CCGGCAGCGCCTCGGCACTGATGGGCTGCGTGCAGTTCAGCGTAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACTTGCCAAGGGCAGGC > NC_002947/688136‑688432 | ccGGCAGCGCCTCGGCACTGATGGGCTGCGTGCAGTTCAGCGTAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGGAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGt < 1:326388/150‑1 (MQ=255) cGGCAGCGCCTCGGCACTGATGGGCTGCGTGCAGTTCAGCGTAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGtt > 1:629043/1‑150 (MQ=255) cGGCAGCGCCTCGGCACTGATGGGCTGCGTGCAGTTCAGCGTAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGtt < 1:695455/150‑1 (MQ=255) cTCGGCACTGATGGGCTGCGTGCAGTTCAGCGTAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCg > 2:652012/1‑150 (MQ=255) cTGATGGGCTGCGTGCAGTTCAGCGTAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAg < 2:107401/150‑1 (MQ=255) gggCTGCGTGCAGTTCAGCGTAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCaa < 2:1148540/150‑1 (MQ=255) gCTGCGTGCAGTTCAGCGTAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAgg < 2:729329/150‑1 (MQ=255) gTGCAGTTCAGCGTAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTccc > 2:1209802/1‑150 (MQ=255) tGCAGTTCAGCGTAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCg > 1:645165/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCGTAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGACAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCGAAGGCTCCCGCATa > 1:856845/1‑150 (MQ=255) gCGTAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCgg < 2:1028947/150‑1 (MQ=255) gCGTAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTCTGCAGGCCACGGCTCCCGCATACGctg < 2:733195/150‑3 (MQ=255) cGTAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGAGGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCGGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGgaaacccggctgcaggcacctcacccgcttatgcgggagcc > 1:26773‑M1/1‑109 (MQ=255) gTAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGt < 2:1068409/150‑1 (MQ=255) tAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCgg < 1:1339000/147‑1 (MQ=255) tAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCgg > 2:1339000/1‑147 (MQ=255) gctgaGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCa < 2:176420/150‑1 (MQ=255) ggcgCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGgaaacccggctgcaggcacctcacccgcttatgcgggagccttggcctgcaaacgccgg < 2:1377253‑M1/150‑60 (MQ=255) ggcgCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTATTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCgg < 2:150436/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGc > 2:740061/1‑128 (MQ=255) gcgcTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGc < 1:740061/128‑1 (MQ=255) cgcTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGttgacccggctgcaggcacctcacccgcttatgcgggagccttggcctgcaaacgccgggt < 1:932964‑M1/150‑62 (MQ=255) gTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCca < 1:186812‑M2/150‑3 (MQ=255) tACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCTATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGc < 1:703754/150‑1 (MQ=255) tACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGgaaacccggctgcaggcacctcacccgcttatgcgggagccttggcctgcaaacgccgggtcaacagcgcaac < 2:26773‑M1/150‑74 (MQ=255) cTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAATGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGTGTTTCCAGCGTGGcga > 1:609234/1‑150 (MQ=255) tGCATGATGGCAGTGCGGTTCCCATGTCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGAGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGcgac > 2:164773/1‑150 (MQ=255) tGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGtt < 2:1090844/136‑1 (MQ=255) tGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGtt > 1:1090844/1‑136 (MQ=255) atgGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGgc < 1:1233717/150‑1 (MQ=255) aGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGgcgcgcg > 1:523137/1‑150 (MQ=255) aGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCAAGCCTCCGCGGTTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGgcgcgcg > 2:749426/1‑150 (MQ=255) ccATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTc > 2:137778/1‑150 (MQ=255) ccATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTc > 2:532779/1‑150 (MQ=255) cATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGttt > 2:151325/1‑66 (MQ=255) cATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGttt < 1:151325/66‑1 (MQ=255) ggCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTg > 1:481492/1‑150 (MQ=255) aaTCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGa > 2:775606/1‑150 (MQ=255) tCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCgg < 1:415569/84‑1 (MQ=255) tCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCgg > 2:415569/1‑84 (MQ=255) cGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGaaaa < 1:532779/150‑1 (MQ=255) gATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTg < 1:164773/150‑1 (MQ=255) aTCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCTCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGa < 2:512231/150‑1 (MQ=255) aTCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGCCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGa < 2:629043/150‑1 (MQ=255) tCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGAc < 2:624840/150‑1 (MQ=255) tCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGAc > 2:574493/1‑150 (MQ=255) tgtgCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCttcgtcg < 1:225545/128‑7 (MQ=255) tgtgCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCttcgtcg > 2:225545/1‑122 (MQ=255) gcTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCCGCGTGGCGACGCCGGCGCGGGCCTGAGCCTCGCTCCCAAAACTGCCCACATGCTTATCGAGc < 2:728402/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCt < 1:213092/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCt < 2:523137/150‑1 (MQ=255) ggtggtCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTgg < 1:137778/150‑1 (MQ=255) gtggtCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGa > 2:1368332/1‑150 (MQ=255) gtCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTgg < 2:1205928/87‑1 (MQ=255) gtCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTgg > 1:1205928/1‑87 (MQ=255) tCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACTTg > 2:257529/1‑150 (MQ=255) gtTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCcagcgcaacactgaccaccagcgccccgcacaggctgatcacgattgccatgggcaccgcactgccatcatgcagta < 2:26773‑M2/150‑78 (MQ=255) tGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAATGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACTTGCCAAggg < 2:609234/150‑1 (MQ=255) tGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACTTGCCAAggg < 2:481492/150‑1 (MQ=255) gcTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCca > 2:214883‑M2/1‑68 (MQ=255) gcTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCca < 1:214883‑M2/70‑3 (MQ=255) tGgaaacccggctgcaggcacctcacccgcttatgcgggagccttggcctgcaaacgccgggtcaacagcgcaacactgaccaccagcgccccgcacaggctgatcacgattgccatgggcaccgcactgccatcatgcagtagcccgac < 1:186812‑M1/150‑149 (MQ=255) tGgaaacccggctgcaggcacctcacccgcttatgcgggagccttggcctgcaaacgccgggtcaacagc > 2:214883‑M1/1‑2 (MQ=255) tGgaaacccggctgcaggcacctcacccgcttatgcgggagccttggcctgcaaacgccgggtcaacagc < 1:214883‑M1/70‑69 (MQ=255) | CCGGCAGCGCCTCGGCACTGATGGGCTGCGTGCAGTTCAGCGTAGCTGCGGGTGCTGCGGCGCTGGTCGGGCTACTGCATGATGGCAGTGCGGTGCCCATGGCAATCGTGATCAGCCTGTGCGGGGCGCTGGTGGTCAGTGTTGCGCTGTTGACCCGGCGTTTGCAGGCCAAGGCTCCCGCATAAGCGGGTGAGGTGCCTGCAGCCGGGTTTCCAGCGTGGCGACGAAGGCGCGCGCCTCAGCCTCGCTGCGAAAACTGACCACATGCTGATCGAGCTGGACTTGCCAAGGGCAGGC > NC_002947/688136‑688432 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |