| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 832322 | 53 (1.010) | 6 (0.120) | 6/232 | NT | 10.8% | coding (82/1098 nt) | PP_0716 | HlyD family secretion protein |
| ? | NC_002947 | = 832338 | 49 (0.990) | coding (98/1098 nt) | PP_0716 | HlyD family secretion protein | |||||
CAACGCACCGACTGGGGCGAGTTGCTCGACGAGCCAGCCCCCACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTGGCCGGGCAGATCAAGCGTGTGGCCGTAGGCAACAACCAGGAGGTGCGCCAGGGCGAT > NC_002947/832173‑832468 | caACGCACCGACTGGGGCGAGTTGCTCGACGAGCCAGCCCCCACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCC > 1:998183‑M1/1‑150 (MQ=255) ggaCCGACTGGGGCGAGTTGCTCGACGAGCCAGCCCCCACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGct > 1:1342358/3‑150 (MQ=255) gCACCGACTGGGGCGAGTTGCTCGACGAGCCAGCCCCCACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGct > 2:58238/1‑150 (MQ=255) cACCGACTGGGGCGAGTTGCTCGACGAGCCAGCCCCCACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGctc < 2:1342358/150‑1 (MQ=255) aCCGACTGGGGCGAGTTGCTCGACGAGCCAGCCCCCACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGctct > 2:462976/1‑150 (MQ=255) ccGACTGGGGCGAGTTGCTCGACGAGCCAGCCCCCACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTg < 2:1165609/150‑1 (MQ=255) cGACTGGGGCGAGTTGCTCGACGAGCCAGCCCCCACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGATTGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTgg > 2:372402/1‑150 (MQ=255) tGGGGCGAGTTGCTCGACGAGCCAGCCCCCACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACt < 1:414464/150‑1 (MQ=255) ggggCGAGTTGCTCGACGAGCCAGCCCCCACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACtt < 2:521459/150‑1 (MQ=255) gggCGAGTTGCTCGACGAGCCAGCCCCCACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTg < 1:128476/150‑1 (MQ=255) gCGAGTTGCTCGACGAGCCAGCCCCCACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTgct < 1:58238/150‑1 (MQ=255) gTTGCTCGACGAGCCAGCCCCCACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCagcaagtaccagagcaggct > 2:1381377‑M1/1‑130 (MQ=255) tGCTCGACGAGCCAGCCCCCACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCagcaagtaccagagcaggctga < 1:1381377‑M1/150‑23 (MQ=255) gCTCGACGAGCCAGCCCCCACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTggctgac < 1:1231217‑M2/150‑8 (MQ=255) gaGCCAGCCCCCACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCtata < 2:896458/150‑1 (MQ=255) gaGCCAGCCCCCACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCtata > 1:721026/1‑150 (MQ=255) ccagccCCCACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGTATAACGCCATCAGGCGCGCCCACCTGGGGATGGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACGGCTATACGc > 1:525650/1‑150 (MQ=255) cagccCCCACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGcc < 1:135664/150‑1 (MQ=255) cccccACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTa > 2:175912/1‑150 (MQ=255) gcATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCaa < 1:355982/150‑1 (MQ=255) cacaAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCg > 1:814083/1‑150 (MQ=255) acaAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCACCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGc < 2:952761/150‑1 (MQ=255) gTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCa < 2:879122/150‑1 (MQ=255) aaCCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTc > 2:48366/1‑139 (MQ=255) aaCCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTc < 1:48366/139‑1 (MQ=255) aCCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGc < 2:648976/90‑1 (MQ=255) aCCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGc > 1:648976/1‑90 (MQ=255) aCCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGCCAGCCagcaagtaccagagcaggctgac < 2:684707‑M1/110‑24 (MQ=255) aCCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGCCAGCCagcaagtaccagagcaggctgac > 1:684707‑M1/1‑87 (MQ=255) ccGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTacac > 2:149957/1‑126 (MQ=255) ccGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTacac < 1:149957/126‑1 (MQ=255) ccGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTa > 2:92123/1‑150 (MQ=255) gCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGGCCTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTcc > 1:434833/1‑150 (MQ=255) cGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCtt < 2:1392921/140‑1 (MQ=255) cGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCtt > 1:1392921/1‑140 (MQ=255) cgccacgccaACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGt < 2:998183/150‑1 (MQ=255) cacgccaACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAg > 1:1144965/1‑130 (MQ=255) cacgccaACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAg < 2:1144965/130‑1 (MQ=255) cacgccaACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGgc > 2:517901/1‑150 (MQ=255) acgccaACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTgg < 1:810765/78‑1 (MQ=255) acgccaACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTgg > 2:810765/1‑78 (MQ=255) ccgccCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTg < 1:517901/150‑1 (MQ=255) cccccATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCagcaagtaccagagcaggctgacggcaatcagc > 1:348285‑M1/1‑58 (MQ=255) cccccATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCagcaagtaccagagcaggctgacggcaatcagc < 2:348285‑M1/91‑34 (MQ=255) ccATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTGGCCggg < 2:1029439/150‑1 (MQ=255) cATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTGGCCGGGc > 1:136965/1‑150 (MQ=255) cAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGCCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCGGACCGGTATACGCCGTCCCCGCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTGGCCGGGCAGa < 2:672234/150‑1 (MQ=255) ccccGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTGCTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGGCGAAGTGGCCGGGCAGATCa > 1:1258304/1‑150 (MQ=255) ccccGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTGGCCGGGCAGATCa > 2:256960/1‑150 (MQ=255) cccGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTg > 2:174339‑M2/1‑63 (MQ=255) cccGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTg < 1:174339‑M2/64‑2 (MQ=255) gcgGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTGGCCGGGCAGATCAAGCGTGTgg < 2:814083/150‑1 (MQ=255) cgGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTgg > 1:921058/1‑128 (MQ=255) cgGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTgg < 2:921058/128‑1 (MQ=255) aTACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTGGCCGGGCAGATCAAGCGTGTGGCCGTa > 2:510796/1‑150 (MQ=255) gTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTGGCCGGGCAGATCAAGCGTGTGGCCGTAGGCaacaac < 1:175912/150‑1 (MQ=255) gctgctgctGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGaa > 2:251500/1‑109 (MQ=255) gctgctgctGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGaa < 1:251500/109‑1 (MQ=255) ctgctgctgATCGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTGGCCGGGCAGATCAAGCGTGTGGCCGTAGGCAACAACCag < 1:462976/150‑1 (MQ=255) cctgcggATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATAAGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTGGCCGGGCAGATCAAGCGTGTGGCCGTAGGCAACAACCagga < 2:654566/149‑1 (MQ=255) ctgctgATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCGTGCCGGCGGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTGGCCGGGCAGATCAAGCGTGTGGCCGTAGGCAACAACCaggag < 1:1032359/150‑1 (MQ=255) ctgctgATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACGTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTGGCCGGGCAGATCAAGCGTGTGGCCGTAGGCAACAACCaggag < 1:372402/150‑1 (MQ=255) gctgATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTggctgacggcaatcagcagcagcacccagcgtatgccgcgatccggggctgatggggg < 2:348285‑M2/91‑59 (MQ=255) gctgATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTggctgacggcaatcagcagcagcacccagcgtatgccgcgatccggggctgatggggg > 1:348285‑M2/1‑33 (MQ=255) tgATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTGGCCGGGCAGATCAAGCGTGTGGCCGTAGGCAACAACCAGGAGGTgc < 1:153270/150‑1 (MQ=255) tgATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTGGCCGGGCAGATCAAGCGTGTGGCCGTAGGCAACAACCAGGAGGTgc < 1:510796/150‑1 (MQ=255) tGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTGGCCGGGCAGATCAAGCGTGTGGCCGTAGGCAACAACCAGGAGGTGCGCCa < 1:92123/150‑1 (MQ=255) ccGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGgccgcc < 2:903541/92‑1 (MQ=255) ccGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCGGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGgccgcc > 1:903541/1‑92 (MQ=255) gTCAGCCagcaagtaccagagcaggctgacggcaatcagcagcagcacccagcgtatgccgcgatccggggctgatgggggcggcgttggcgtggcgtcgctcattcggtttcaccttgtgcatgcgcggtgggggctggctcgtcgagc < 1:1231217‑M1/150‑144 (MQ=255) gTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTggctggcggcaatcagcagcagcacccagcgtatgccgcgatccggggctgatgggggcggcgttggcgtggcgtcgctcattcggt < 2:684707‑M2/110‑88 (MQ=255) gTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTggctggcggcaatcagcagcagcacccagcgtatgccgcgatccggggctgatgggggcggcgttggcgtggcgtcgctcattcggt > 1:684707‑M2/1‑23 (MQ=255) gTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCTCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTGGCCGGGCAGATCAAGCGTGTGGCCGTAGGCAACAACCAGGAGGTGCGCCAGGGc > 2:347644/1‑150 (MQ=255) tCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTggctgacggcaatcagcagcagcacccagcgtatgccgcgatccggggctgatgggggcggcgttggcgtggcgtcgctcattcggtttcaccttgtgcatgcgcggtgggggctggctcgtcgagca < 1:1381377‑M2/150‑129 (MQ=255) aGCCTGCTCTGGTACTTGCTggctgacggcaatcagcagcagcacccagcgtatgccgcgatccggggctgatgggggcggcgttggcgtggcgtcgctcattcggtttcaccttgtgcatgcgcggtgggggctggctcgtcgagcaac > 2:1381377‑M2/1‑20 (MQ=255) aGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCGTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTGGCCGGGCAGATCAAGCGTGTGGCCGTAGGCAACAACCAGGAGGTGCGCCAGGGCGAt < 2:43433/150‑1 (MQ=255) cagcaagtaccagagcaggctgacggcaatcagcagcagcacccagcgtatgccgcgatccggg > 2:174339‑M1/1‑1 (MQ=255) cagcaagtaccagagcaggctgacggcaatcagcagcagcacccagcgtatgccgcgatccggg < 1:174339‑M1/64‑64 (MQ=255) | CAACGCACCGACTGGGGCGAGTTGCTCGACGAGCCAGCCCCCACCGCGCATGCACAAGGTGAAACCGAATGAGCGACGCCACGCCAACGCCGCCCCCATCAGCCCCGGATCGCGGCATACGCTGGGTGCTGCTGCTGATTGCCGTCAGCCTGCTCTGGTACTTGCTGGCTGACCGCTATACGCCGTACACCCAGCAAGCTCGCCTGCAGGCTTACGTAGTCCCGGTGGCCGCCGAAGTGGCCGGGCAGATCAAGCGTGTGGCCGTAGGCAACAACCAGGAGGTGCGCCAGGGCGAT > NC_002947/832173‑832468 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |