New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 929163 | 73 (1.390) | 5 (0.100) | 5/240 | NT | 6.6% | coding (16462/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
? | NC_002947 | = 929197 | 70 (1.370) | coding (16428/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
GGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCGGGGCGGCTGGCGGGGTGGTGTCCGGCGCGGTCAGGCTGGTGCTGGCGGACAGGTT > NC_002947/929015‑929310 | ggggTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGt > 2:757843/1‑150 (MQ=255) gggTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGGGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGCGCGCCTGGTTGTCGCTCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTa > 2:395354/1‑150 (MQ=255) ggTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGATGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCGTGGTTATCGAACTGCGCCGCAGTCAGGCTTACCCCGAACAGGCCGTTGCTGACCACCGTTTCGCTACCCAGcaa > 1:598130‑M1/1‑147 (MQ=255) aGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCCGTTGGGGAAACCACGAACAGGCCGTGGCTGGCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTa > 2:398356/1‑150 (MQ=255) aGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTa > 1:315398/1‑150 (MQ=255) aGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACACAGcacggtc > 2:368192‑M1/1‑143 (MQ=255) gTCCTGTGCGGTCAGCGCAGTGCCCGTGGACAACTTTCCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTAcc < 2:1302584/150‑1 (MQ=255) gCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTg > 1:1202281/1‑150 (MQ=255) cGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGt > 1:63352/1‑150 (MQ=255) ggTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGTCGCTGtt < 2:1417803/150‑1 (MQ=255) cAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGACGAAGTCAGGCTGTACAAGACCAGGAAGTTGCTGCACATCCTTGCAGTTCCCAGTACGGTAGCGGCGCTGGTGCGC‑ACgg < 2:375230/150‑1 (MQ=255) gACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGcacggtcaccgtgcgcaacagcgccggtaccgtactg < 1:368192‑M1/150‑38 (MQ=255) gACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑GCGGTGACCGTGctg < 2:436581‑M2/150‑4 (MQ=255) gACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGctg < 2:325828‑M2/150‑4 (MQ=255) acacATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGtgctgc > 1:885923/1‑150 (MQ=255) cacaTTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGcacggtcaccgtgcgcaacagcgccggtaccgtactggg < 1:1214450‑M1/150‑40 (MQ=255) acaTTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACg < 2:969475/114‑1 (MQ=255) acaTTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACg > 1:969475/1‑114 (MQ=255) aTTACCGCCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGAc > 1:614921/1‑150 (MQ=255) 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gTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTg > 2:1391559/1‑150 (MQ=255) gTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAg < 2:315398/150‑1 (MQ=255) gTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAg < 1:148728/150‑1 (MQ=255) tGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAgg < 1:643651/150‑1 (MQ=255) tGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAgg > 2:406054/1‑150 (MQ=255) gACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGt < 1:381152/150‑1 (MQ=255) tGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGt > 1:290188/1‑150 (MQ=255) gAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGcacggtcaccgtgcgcaacagcgccggtacc > 2:1076002‑M1/1‑78 (MQ=255) gAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGcacggtcaccgtgcgcaacagcgccggtacc < 1:1076002‑M1/109‑32 (MQ=255) gcCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCg > 1:758471/1‑150 (MQ=255) tGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTg > 2:860916/1‑150 (MQ=255) ttGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGAtg < 2:815715/150‑1 (MQ=255) gTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGt > 2:103347/1‑137 (MQ=255) gTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGt < 1:103347/137‑1 (MQ=255) tCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGAtggtg < 2:1202281/150‑1 (MQ=255) tCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGAtggtg > 1:333022/1‑150 (MQ=255) 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cccACCGCGGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCCTGCTGCCGACCTCGCCAGAACCGACGCTCGAGGCGCCGTTGGCGTTGATGCTGGCCACCGGGGCCGCTGGCGGGGTCATGTCCGGCGCGGTCAGGCTg < 2:548010/150‑1 (MQ=255) cACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCGGGGCGGCTGGCgg > 1:1427079/1‑123 (MQ=255) cACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCGGGGCGGCTGGCgg < 2:1427079/123‑1 (MQ=255) aCCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCGGGGCGGCTGGCGGGGTGGTGTCCGGCGCGGTCAGGCTGGTg > 2:1221007/1‑150 (MQ=255) ttGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCGGGGCGGCTGGCGGGGTGGTGTCCGGCGCGGTCAGGCTGGTGCTgg < 2:758471/150‑1 (MQ=255) tGCGGTACCCAGTAAGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCGGGGCGGCTGGCGGGGTGGTGTCCGGCGCGGTCAGGCTGGTGCTGGc < 2:628499/150‑1 (MQ=255) gCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCGGGGCGGCTGGCGGGGTGGTGTCCGGCGCGGTCAGGCTGGTGCTGGCg < 2:381006/150‑1 (MQ=255) aCCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCGGGGCGGCTGGCGGGGTGGTGTCCGGCGCGGTCAGGCTGGTGCTGGCGGACAg < 1:308565/150‑1 (MQ=255) cccAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGctgggtaccgcaacggtgggcagcaacggcctgttcgtggtcagcctgactgcggcgcagatcgacaaccaggcgctcagcgtcaccctcaccgacagcgccggtaatgtg < 1:1214450‑M2/150‑112 (MQ=255) cAGcacggtcaccgtgcgcaacagcgccggtaccgtactgggtaccgcaacggtgggcagcaacggcctgttcgtggtcagcctgactgcggcgcagatcgacaaccaggcgctcagcgtcaccctcaccgacagcgccggtaatgtgtc < 2:325828‑M1/150‑148 (MQ=255) cAGcacggtcaccgcgcgcaacagcgccggtaccgtactgggtaccgcaacggtgggcagcaacggcctgttcgtggtcagcctgactgcggcgcagatcgacaaccaggcgctcagcgtcaccctcaccgacagcgccggtaatgtgtc < 2:436581‑M1/150‑148 (MQ=255) cAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGctgggtaccgcaacggtgggcagcaacggcctgttcgtggtcagcctgactgcggcgcagatcgacaaccaggcgctcagcgtcaccctcaccgacagcgccggtaatgtgtc < 1:368192‑M2/150‑114 (MQ=255) | GGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGC‑ACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCGGGGCGGCTGGCGGGGTGGTGTCCGGCGCGGTCAGGCTGGTGCTGGCGGACAGGTT > NC_002947/929015‑929310 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |