| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ? | NC_002947 | = 970059 | 71 (1.410) | coding (969/1050 nt) | queA | S‑adenosylmethionine:tRNA ribosyltransferase‑isomerase | |||||
TGATGGCGTGCTCAAGGCCTTCAGTGGCGACACCGACATCTTCATCTACCCGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGTGATGCCATGTTCATCACCCGCAATCCGGCGCCACGCGGGCCCG‑AGGATCAAGCATGAGTCGCACCTGTCGAATGTCCTTCGAACTGCT > NC_002947/969876‑970171 | tGATGGCGTGCTCAAGGCCTTAAGTGGCGCCACCCGCGTGGGCGTCTGCCCGTGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCga < 1:672575/150‑1 (MQ=255) tCACGGCCTTCAGTGGCGACACCGACATCTTCATCTACCCGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCAACTGCCTGGTCACCAACTCCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTg > 2:340910/1‑150 (MQ=255) gCCTTCAGTGGCGACACCGACATCTTCATCTACCCGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTAc > 2:1251151/1‑150 (MQ=255) gCCTTCAGTGGCGACACCGACATCTTCATCTACCCGGGCCGACCGTTCCATGTGCTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTAc < 1:790268/150‑1 (MQ=255) ttCAGTGGCGACACCGACATCTTCATCTACCCGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCgtgctcgaccgccgctgcgtag > 1:579848‑M1/1‑128 (MQ=255) aGTGGCGACACCGACATCTTCATCTACCGGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTACACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGACACCTTGGCTGCCTACGCAgc‑g > 1:278178/1‑150 (MQ=255) cacCGACATCTTCATCTACCCGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGa < 1:877155/150‑1 (MQ=255) cGACATCTTCATCTACCCGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAgc‑gg < 2:953987/140‑1 (MQ=255) cGACATCTTCATCTACCCGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAgc‑gg > 1:953987/1‑140 (MQ=255) gACATCTTCATCTACCCGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCAc > 1:910760/1‑150 (MQ=255) aCATCTTCATCTACCCGGGCCGGCCGTTCCCTGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCgtgctcgaccgccgctgcgtaggcagccatggtctcgg < 2:579848‑M1/150‑39 (MQ=255) cTTCATCTACCCGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACgggta > 1:869228‑M2/1‑145 (MQ=255) tCATCTACCCGGGCCGGCCGTTCCCTGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTAAGCGGCTACCCCGAGACCATAGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTAcc > 1:790535/1‑150 (MQ=255) 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cTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGTGATGCCATGTTCATCACCCGCAATCCGGCGCCACGCGGGCCCG‑AGGATCAAGCATGAGTCGCACCTGTCGAAt < 2:345039/150‑1 (MQ=255) tttCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGTGATGCCATGTTCATCACCCGCAATCCGGCGCCACGCGGGCCCG‑AGGATCAAGCATGAGTCGCACCTGTCGAATg > 1:1209653/1‑150 (MQ=255) cGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGTGATGCCATGTTCATCACCCGCAATCCGGCGCCACGCGGGCCCG‑AGGATCAAGCATGAGTCGCACCTGTCGAATGTcc < 2:846950/150‑1 (MQ=255) ccGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGTGATGCCATGTTCATCACCCGCAATCCGGCGCCACGCGGGCCCG‑AGGATCAAGCATGAGTCGCACCTGTCGAATGTCCtt < 2:704174/150‑1 (MQ=255) gctgtacccgtgctcgaccgccgctgcgtaggcagccatggtctcggggtagccggcgaaagccgagaccagcatcagcagcgtggactccggcagatggaagttggtgaccaggcagtcgaccacatggaacggccggcccgggtagat < 1:1308670‑M1/146‑142 (MQ=255) tACCCgtgctcgaccgccgctgcgtaggcagccatggtctcggggtagccggcgaaagccgagaccagcatcagcagcgtggactccggcagatggaagttggtgaccaggcagtcgaccacatggaacggccggcccgggtagatgaag > 1:869228‑M1/1‑5 (MQ=255) tACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACgggtagccggcgaaagccgagaccagcatcagcagcgtggactc < 2:1301069‑M2/86‑45 (MQ=255) tACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACgggtagccggcgaaagccgagaccagcatcagcagcgtggactc > 1:1301069‑M2/1‑42 (MQ=255) tACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGTGATGCCATGTTCATCACCCGCAATCCGGCGCCACGCGGGCCCGAACCATC‑TTCATGAGTCGCACCTGTCGAATGTCCTTCGAAc < 1:337600/150‑1 (MQ=255) cccGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGTGATGCCATGt < 1:726115/73‑1 (MQ=255) cccGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGTGATGCCATGt > 2:726115/1‑73 (MQ=255) cccGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGTGATGCCATGTTCATCACCCGCAATCCGGCGCCACGCGGGCCCG‑AGGATCAAGCATGAGTCGCACCTGTCGACTGTCCTTCGAActgc > 2:72795/1‑150 (MQ=255) cccGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGTGATGCCATGTTCATCACCCGCAATCCGGCGCCACGCGGGCCCG‑AGGATCAAGCATGAGTCGCACCTGTCGAATGTCCTTCGAActgc > 2:1077538/1‑150 (MQ=255) cccGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGTGATGCCATGTTCATCACCCGCAATCCGGCGCCACGCGGGCCCG‑AGGATC‑AGCAAGAATCGCTCCTGTTTGATTTCCTTCCAActtct > 2:619219/1‑150 (MQ=255) ccGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCTCG‑‑ggtagccggcgaaagccgagaccagcatcagcagcgtggactccggcagatggaagttggtgaccaggcagtcgaccacatggaa < 1:235168‑M2/121‑86 (MQ=255) ccGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCTCG‑‑ggtagccggcgaaagccgagaccagcatcagcagcgtggactccggcagatggaagttggtgaccaggcagtcgaccacatggaa > 2:235168‑M2/1‑36 (MQ=255) ccGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACgggtagccggcgaaagccgagaccagcatcagcagcgtggactccggcagatggaagttggtgaccaggcagtcgaccacagggaacggccggcccgggtagatgaagatgt < 2:579848‑M2/150‑113 (MQ=255) ccGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGTGATGCCATGTTCATCACCCGCAATCCGGCGCCACGCGGGCCCG‑AGGATCAAGCa < 1:1369359/116‑1 (MQ=255) ccGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGTGATGCCATGTTCATCACCCGCAATCCGGCGCCACGCGGGCCCG‑AGGATCAAGCa > 2:1369359/1‑116 (MQ=255) | TGATGGCGTGCTCAAGGCCTTCAGTGGCGACACCGACATCTTCATCTACCCGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGTGATGCCATGTTCATCACCCGCAATCCGGCGCCACGCGGGCCCG‑AGGATCAAGCATGAGTCGCACCTGTCGAATGTCCTTCGAACTGCT > NC_002947/969876‑970171 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |