New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 970022 | 70 (1.330) | 6 (0.120) | 5/236 | NT | 8.0% | coding (932/1050 nt) | queA | S‑adenosylmethionine:tRNA ribosyltransferase‑isomerase |
? | NC_002947 | = 970059 | 71 (1.410) | coding (969/1050 nt) | queA | S‑adenosylmethionine:tRNA ribosyltransferase‑isomerase |
GACATCTTCATCTACCCGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGTGATGCCATGTTCATCACCCGCAATCCGGCGCCACGCGGGCCCG‑AGGATCAAGCATGAGTCGCACCTGTCGAATGTCCTTCGAACTGCTGGCCACCGACGGCAAGGCCCGTCGGGGTCGCATC > NC_002947/969910‑970205 | gACATCTTCATCTACCCGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCAc > 1:910760/1‑150 (MQ=255) cTTCATCTACCCGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACgggta > 1:869228‑M2/1‑145 (MQ=255) tCATCTACCCGGGCCGGCCGTTCCCTGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTAAGCGGCTACCCCGAGACCATAGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTAcc > 1:790535/1‑150 (MQ=255) aTCTACCCGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACgggtacagc < 1:1308670‑M2/150‑10 (MQ=255) aTCTACCCGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGc > 1:623896/1‑150 (MQ=255) aTCTACCCCGGCCGGCCGTTCCAAGTGATCGACTGCCTGGTCACCACCTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGc < 2:653157/150‑1 (MQ=255) tCTACCCGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGct > 2:1236619/1‑150 (MQ=255) tACCCGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGcttc > 1:158366/1‑150 (MQ=255) aCCCGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGcttct > 1:1338108/1‑150 (MQ=255) ccGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCTTGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCttcttc > 2:852986/1‑150 (MQ=255) cGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCa < 1:4069/150‑1 (MQ=255) cGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCa < 2:623896/150‑1 (MQ=255) cGGGCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCa < 2:798447/150‑1 (MQ=255) gggCCGGCCGTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAg < 1:1251151/150‑1 (MQ=255) ggacggccgTTCCATGTGGTCGACTGTCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGt < 2:442444/147‑1 (MQ=255) gccgTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACgg > 1:866528/1‑150 (MQ=255) ccgTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCCTGCCTGGCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGt < 2:200190/150‑1 (MQ=255) ccgTTCCATGTGGTCGACTGCCTGGTCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACggg > 1:704174/1‑149 (MQ=255) 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2:1422278/128‑1 (MQ=255) tCACCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTCCTCTAGCCCTTCGCCGGCTACCCCGAGACCAGGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGTGATGCCATGTTCATCACCCGCAATc > 1:1097351/1‑150 (MQ=255) ccACCAACTCCCATCTGCCGGAGTCCACTCTGCTGATGCTGGTCTCGGCGTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGTGATGCCATGTTCATCACCCGCAATc < 2:278178/149‑1 (MQ=255) aCCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGTGAt > 2:512083/1‑126 (MQ=255) aCCAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCGGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGTGAt < 1:512083/126‑1 (MQ=255) cAACTTCCATCTGCCGGAGTCCACGCTGCTGATGCTGGTCTCGGCTTTCGCCTGCTACCCCGAGACCATGGCTGCCTACGCAGC‑GGCGGTCGAGCACGGGTACCGCTTCTTCAGTTACGGTGATGCCATGTTCATCACCCGCAATCCGgc < 1:437836/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |