| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1128317 | 63 (1.200) | 4 (0.080) | 4/234 | NT | 6.2% | coding (1240/2856 nt) | gcvP‑I | glycine dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | = 1128332 | 61 (1.220) | coding (1225/2856 nt) | gcvP‑I | glycine dehydrogenase | |||||
GGGCGGCAGGCAGCAGGGAACCGGTGCTGGCGGCCAGTGCGGTGAAATCAGGCTGTGCCTGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGT > NC_002947/1128173‑1128464 | gggCGGCAGGCAGCAGGGAACCGGTGCTGGCGGCCAGTGCGGTGAAATCAGGCTGTGCCCGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTGCAGAGACAGGCACACATGGCAGGCATGGATCt > 2:596925/1‑150 (MQ=255) gcggcAGGCAGCAGGGAACCGGTGCTGGCGGCCAGTGCGGTGAAATCAGGCTGTGCCTGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTgg < 2:113350/150‑1 (MQ=255) caggcagCAGGGAACCGGTGCTGGCGGCCAGTGCGGTGAAATCAGGCTGTGCCTGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCa > 1:832444/1‑150 (MQ=255) cagGGAACCGGTGCTGGCGGCCAGTGCGGTGAAATCAGGCTGTGCCTGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTgat > 1:563689‑M2/1‑147 (MQ=255) gggAACCGGTGCTGGCGGCCAGTGCGGTGAAATCAGGCTGTGCCTGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTgatgc < 2:711922‑M2/150‑6 (MQ=255) ggAACCGGTGCTGGCGGCCAGTGCGGTGAAATCAGGCTGTGCCTGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGa > 1:86035/1‑131 (MQ=255) ggAACCGGTGCTGGCGGCCAGTGCGGTGAAATCAGGCTGTGCCTGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGa < 2:86035/131‑1 (MQ=255) ggAACCGGTGCTGGCGGCCAGTGCGGTGAAATCAGGCTGTGCCTGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTgatgcc < 1:1149878‑M2/150‑7 (MQ=255) cGGTGCTGGCGGCCAGTGCGGTGAAATCAGGCTGTGCCTGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCt > 1:1111792/1‑129 (MQ=255) cGGTGCTGGCGGCCAGTGCGGTGAAATCAGGCTGTGCCTGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCt < 2:1111792/129‑1 (MQ=255) cGGTGCTGGCGGCCAGTGCGGTGAAATCAGGCTGTGCCTGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTggg > 1:623001/1‑150 (MQ=255) cGGTGCTGGCGGCCAGTGCGGTGAAATCAGGCTGTGCCTGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTggg > 1:364966/1‑150 (MQ=255) cggcCAGTGCGGTGAAATCAGGCTGTGCCTGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCt < 1:1072573/150‑1 (MQ=255) gTGCGGTGAAATCAGGCTGTGCCTGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGt < 2:657582/140‑1 (MQ=255) gTGCGGTGAAATCAGGCTGTGCCTGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGt > 1:657582/1‑140 (MQ=255) gTGAAATCAGGCTGTGCCTGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAgg < 2:223552/150‑1 (MQ=255) aTCAGGCTGTGCCTGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCNACTCGANGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGc > 1:1275509/1‑150 (MQ=255) aTCAGGCTGTGCCTGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGc > 2:1132786/1‑150 (MQ=255) aGGCTGTGCCTGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGCCGGTAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGt > 1:329772/1‑150 (MQ=255) 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tGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCg > 1:633703/1‑150 (MQ=255) ccACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGcc > 1:901190/1‑150 (MQ=255) ccAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTgatgcc < 2:703733‑M2/97‑7 (MQ=255) ccAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTgatgcc > 1:703733‑M2/1‑91 (MQ=255) ccAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCcaggg > 2:962804/1‑150 (MQ=255) ccAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCcaggg > 1:427420/1‑150 (MQ=255) cAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCaacctgcgccagatcgatgcctc > 2:1229014‑M1/1‑75 (MQ=255) cAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCaacctgcgccagatcgatgccgc < 1:1229014‑M1/98‑24 (MQ=255) aGCTGCCACAGCGCCTCGACGTCAGACTTAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCcagggtcagg < 1:931112/150‑1 (MQ=255) aGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCGAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCcagggtcagg < 1:335814/150‑1 (MQ=255) aGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCcagggtcagg < 2:633703/150‑1 (MQ=255) gCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAgg < 2:721477/116‑1 (MQ=255) gCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAgg > 1:721477/1‑116 (MQ=255) ccACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATc > 1:239328/1‑150 (MQ=255) acaGCGACTCGACGTCAGGCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGa > 2:1236178/1‑150 (MQ=255) acaGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGa > 1:406087/1‑150 (MQ=255) acaGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGa > 2:656972/1‑150 (MQ=255) aGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGcc > 1:775327/1‑96 (MQ=255) aGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGcc < 2:775327/96‑1 (MQ=255) aGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAg < 2:680439/150‑1 (MQ=255) gCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCaacctgcgccagatcgat > 1:1161899‑M1/1‑61 (MQ=255) gCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCaacctgcgccagatcgat < 2:1161899‑M1/79‑19 (MQ=255) gCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAgg < 1:962804/150‑1 (MQ=255) tCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCcagggtcag < 2:1275050/134‑1 (MQ=255) tCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCcagggtcag > 1:1275050/1‑134 (MQ=255) tCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCcagg < 1:422788/129‑1 (MQ=255) tCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCcagg > 2:422788/1‑129 (MQ=255) tCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTg > 1:63291/1‑150 (MQ=255) gTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGcc > 1:955834/1‑150 (MQ=255) tGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACt < 1:751454/150‑1 (MQ=255) gAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACtt > 2:73303/1‑150 (MQ=255) gAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACtt < 2:43533/150‑1 (MQ=255) gAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACtt < 1:1236178/150‑1 (MQ=255) gAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACtt < 2:239328/150‑1 (MQ=255) tGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTa < 1:711922/150‑1 (MQ=255) 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gcATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATcgcg < 2:832444/150‑1 (MQ=255) aTCaacctgcgccagatcgatgccgcccatgtgggcctgtctctggacgaaaccagcactcaggctgacgtcgagtcgctgtggcagctgttgggtggcgagcaggcacagcctgatttcaccgcactggccgccagcaccggttccctg > 1:563689‑M1/1‑3 (MQ=255) aTCGATCTGGCGCAGGTTgatgccgcccatgtgggcctgtctctggacgaaaccagcactcaggctgacgtcgagtcgc > 1:1161899‑M2/1‑18 (MQ=255) aTCGATCTGGCGCAGGTTgatgccgcccatgtgggcctgtctctggacgaaaccagcactcaggctgacgtcgagtcgc < 2:1161899‑M2/79‑62 (MQ=255) | GGGCGGCAGGCAGCAGGGAACCGGTGCTGGCGGCCAGTGCGGTGAAATCAGGCTGTGCCTGCTCGCCACCCAACAGCTGCCACAGCGACTCGACGTCAGCCTGAGTGCTGGTTTCGTCCAGAGACAGGCCCACATGGGCGGCATCGATCTGGCGCAGGTTGATGCCCTGGGCGCGTGCCTTGTCATGCAGGCTGGCGGTGGCAGTGCCGGTGGCCAGGGTCAGGGTATCGAAGGCGCTGGCGCCCACCACTTGTACGCCCAGCGCCTTCAGGCCGGCGGCGAGGATCGCGGT > NC_002947/1128173‑1128464 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |