New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1146416 = | 45 (0.860) | 3 (0.060) | 3/236 | NT | 7.1% | coding (1653/2589 nt) | PP_1006 | heme receptor |
? | NC_002947 | 1146533 = | 35 (0.690) | coding (1536/2589 nt) | PP_1006 | heme receptor |
TCGTTGAAGGCGTAGGTCAGGCCGAACTTGGGCGAGACGCGGTGCCACTTCTTGTCCGAATCGTCCTGGGCGGTAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAG > NC_002947/1146267‑1146557 | aattggacaaggccttcagcatttgccaaaccgaccacctgtttacctacggcaccacactcacacaggagaaagtcacgggttcacgtagcggcaccgggccttgcctgcacatcggcggtacctgtaccgccatcggacaggacggcg < 1:911787‑M1/1‑1 (MQ=255) cGTTGAAGGCGTAGGTCAGGCCGAACTTGGGCGAGACGCGGTGCCACTTCTTGTCCGAATCGTCCTGGGCGGTAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAgc < 1:71706/150‑1 (MQ=255) ttggacaaggccttcagcattggccaaaccgaccacctgtttacctacggcaccacactcaaacaggagaaagtcacgggttcacgtagcggcaccggcacttgcctgaacatcggtggtacctgtacagccatcggacaggacagcgcg < 1:204190‑M1/3‑1 (MQ=255) tggacaaggccttcagcattggccaaaccgaccacctgtttacctacggcaccacactcaaacaggagaaagtcacgggttcacgtagcggcaccggcacttgcctgaacatcggtggtacctgtacagccatcggacaggacagcgcgc > 2:463815‑M1/147‑150 (MQ=255) aaggccttcagcattggccaaaccgaccacctgtttacctacggcaccacactcaaacaggagacagtcacgggttcacgtagcggcacaggcaattgcctgaacatcggtggtacctgtacagccatcggacaggacagcGCGCGCGcc < 2:690652‑M1/9‑1 (MQ=255) gTAGGTCAGGCCGAACTTGGGCGAGACGCGGTGCCACTTCTTGTCCGAATCGTCCTGGGCGGTAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCggg > 1:618253/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCGAACTTGGGCGAGACGCGGTGCCACTTCTTGTCCGAATCGTCCTGGGCGGTAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGa < 2:1180504/150‑1 (MQ=255) gAACTTGGGCGAGACGCGGTGCCACTTCTTGTCCGAATCGTCCTGGGCGGTAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCa < 1:1153468/150‑1 (MQ=255) gAACTTGGGCGAGACGCGGTGCCACTTCTTGTCCGAATCGTCCTGGGCGGTAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCa > 2:142501/1‑150 (MQ=255) ttGGGCGAGACGCGGTGCCACTTCTTGTCCGAATCGTCCTGGGCGGTAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAgttg > 1:1125296/1‑150 (MQ=255) ttGGGCGAGACGCGGTGCCACTTCTTGTCCGAATCGTCCTGGGCGGTAGGCGCCGTACCGCTGAACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGAGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAgttg > 1:660882/1‑150 (MQ=255) gCGAGACGCGGTGCCACTTCTTGTCCGAATCGTCCTGGGCGGTAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTcc > 2:1175348/1‑150 (MQ=255) cgcgGTGCCACTTCTTGTCCGAATCGTCCTGGGCGGTAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGa < 2:1126241/150‑1 (MQ=255) ttcttGTCCGAATCGTCCTGGGCGGTAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTgc < 2:1125296/150‑1 (MQ=255) tCCGAATCGTCCTGGGCGGTAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAAc > 1:131322/1‑150 (MQ=255) ccGAATCGTCCTGGGCGGTAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACa < 2:131322/150‑1 (MQ=255) gAATCGTCCTGGGCGGTAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAgg > 1:97187/1‑150 (MQ=255) gAATCGTCCTGGGCGGTAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAgg > 1:662035/1‑150 (MQ=255) aaTCGTCCTGGGCGGTAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGc < 2:682486/150‑1 (MQ=255) aTCGTCCTGGGCGGTAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCt > 2:738122/1‑150 (MQ=255) aTCGTCCTGGGCGGTAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCt < 1:1121051/150‑1 (MQ=255) tCCTGGGCGGTAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAg > 1:399428/1‑150 (MQ=255) ggTAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CAc < 1:142501/150‑1 (MQ=255) tAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCCGACCGCGCAGGAATTGCTCCGTGAATTTGTGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑TACgg > 2:911787/1‑150 (MQ=255) cgcCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCgg < 2:618253/150‑1 (MQ=255) cgcCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCgg < 1:1175348/150‑1 (MQ=255) acgtagcggcaccggcacttgcctgaacatcggtggtacctgtacagccatcggacaggacagcGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGa < 1:89534‑M1/86‑1 (MQ=255) gCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTgcgc < 1:836524/114‑1 (MQ=255) gCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTgcgc > 2:836524/1‑114 (MQ=255) gCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGaa < 2:97187/150‑1 (MQ=255) tGGACTCACGACAGCGCAGGAATTCCGCCGTTAATTTGGTCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGt < 2:662035/150‑1 (MQ=255) gACTCCAGACCGCGCAGGAATTCATACGTGAATTTGCGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCg > 2:521357/1‑150 (MQ=255) tCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTg > 1:1104432/1‑150 (MQ=255) cAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAg < 1:799620/79‑1 (MQ=255) cAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAg > 2:799620/1‑79 (MQ=255) cgcgCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAg > 2:536593/1‑68 (MQ=255) cgcgCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAg < 1:536593/68‑1 (MQ=255) gcgcAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGc < 2:399428/150‑1 (MQ=255) aGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAg > 2:954755/1‑108 (MQ=255) aGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAg < 1:954755/108‑1 (MQ=255) aGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGc < 1:443615/150‑1 (MQ=255) catcggtggtacctgtacagccatcggacaggacagcGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCAc > 2:89534‑M1/38‑150 (MQ=255) tcggtggtacctgtacagccatcggacaggacagcGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCAcgc > 1:690652‑M1/36‑150 (MQ=255) cGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCt > 1:472256/1‑126 (MQ=255) cGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCt < 2:472256/126‑1 (MQ=255) gTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACCGGTGGTGAGTAGT‑‑GACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCAcgcgcg > 2:1261963/1‑150 (MQ=255) gTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTc > 2:894472/1‑122 (MQ=255) gTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTc < 1:894472/122‑1 (MQ=255) tGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACGCTGAAGTGCCCGTCACGCGCGctgtcct < 1:1261963/150‑1 (MQ=255) cATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACA‑‑CCGTTGCCATTACCACTGTTGGGTCCGGGAAGTCGCTGAAAAAGGCCTACCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGAt > 1:738821/1‑150 (MQ=255) cGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCt > 2:1207480/1‑150 (MQ=255) tgtAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTAc < 2:68351/150‑1 (MQ=255) tAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAg < 2:1104432/150‑1 (MQ=255) | TCGTTGAAGGCGTAGGTCAGGCCGAACTTGGGCGAGACGCGGTGCCACTTCTTGTCCGAATCGTCCTGGGCGGTAGGCGCCGTACCGCTGGACTCCAGACCGCGCAGGAATTCCTCCGTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAG > NC_002947/1146267‑1146557 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |