New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1146416 = | 45 (0.860) | 3 (0.060) | 3/236 | NT | 7.1% | coding (1653/2589 nt) | PP_1006 | heme receptor |
? | NC_002947 | 1146533 = | 35 (0.690) | coding (1536/2589 nt) | PP_1006 | heme receptor |
GTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGTTTGAGTGTGGTGCCGTAGGTAAACAGGTGGTCGGTTTGGCCAATGCTGAAGGCCTTGTCCAATT > NC_002947/1146384‑1146681 | gTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACCGGTGGTGAGTAGT‑‑GACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCAcgcgcg > 2:1261963/1‑150 (MQ=255) tGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACGCTGAAGTGCCCGTCACGCGCGctgtcct < 1:1261963/150‑1 (MQ=255) cATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACA‑‑CCGTTGCCATTACCACTGTTGGGTCCGGGAAGTCGCTGAAAAAGGCCTACCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGAt > 1:738821/1‑150 (MQ=255) cGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCt > 2:1207480/1‑150 (MQ=255) tgtAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTAc < 2:68351/150‑1 (MQ=255) tAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAg < 2:1104432/150‑1 (MQ=255) gcgtgacgggcaggccttggtcagcgacttcccggacccgaccgtgaatacctacagcctgttcgcgcaggatgaaatccgctggaacaactggaccttcatgcccggcgcgcgcGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGa > 1:690652‑M2/116‑150 (MQ=255) gtgacgggcaggccttggtcagcgacttcccggacccgaccgtgaatacctacagcctgttcgcgcaggatgaaatccgctggaacaactggaccttcatgcccggcgcgcgcGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATg > 2:89534‑M2/114‑150 (MQ=255) cATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGAt < 2:378050/120‑1 (MQ=255) cATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGAt > 1:378050/1‑120 (MQ=255) aTGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTATGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCaa > 1:115818/1‑150 (MQ=255) aTGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCaa < 1:1207480/150‑1 (MQ=255) gTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAgtgccg > 2:771865/1‑150 (MQ=255) tCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGTGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAgtgccgg > 2:134584/1‑150 (MQ=255) aGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAgtgccggtgc < 1:521357/150‑1 (MQ=255) gttgttCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTaccac < 1:235386/125‑1 (MQ=255) gttgttCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTaccac > 2:235386/1‑125 (MQ=255) gttgttCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAgtgccggtgcc > 2:1397476/1‑150 (MQ=255) aGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTaccac < 2:796027/117‑1 (MQ=255) aGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTaccac > 1:796027/1‑117 (MQ=255) tcccggacccgaccgtgaatacctacagcctgttcgcgcaggatgaaatccgctggaacaactggaccttcatgcccggcgcgcgcGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGt < 1:89534‑M2/64‑1 (MQ=255) gCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGa > 1:1099499/1‑150 (MQ=255) tGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTtc < 2:1099499/150‑1 (MQ=255) gAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTg > 2:621246/1‑150 (MQ=255) gAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTg > 2:1217869/1‑150 (MQ=255) aaCAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGt < 1:1397476/150‑1 (MQ=255) aCAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGTGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGtt < 1:134584/150‑1 (MQ=255) aTT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGTTTGAGTGTGGTGcc > 2:204190/1‑150 (MQ=255) tCCGGGAAGCCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGCACCATGGCCGTACGGTTTTTTTGTAGGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGTTTGAGTGTGGTGCCGTAGGTAAACAgg < 1:738122/150‑1 (MQ=255) ccGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGTTTGAGTGTGGTGCCGTAGGTAAACAggt < 1:621246/150‑1 (MQ=255) cGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGTTTGAGTGTGGTGCCGTAGGTAAACAggtg > 1:795537/1‑150 (MQ=255) gCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGTTTGAGTGTGGTGCCGTAGGTAAACAGGTGGTCGGTTTg > 1:64172/1‑150 (MQ=255) aaGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGTTTGAGTGTGGTGCCGTAGGTAAACAGGTGGTCGGTTTGGc < 2:988889/145‑1 (MQ=255) aaGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGTTTGAGTGTGGTGCCGTAGGTAAACAGGTGGTCGGTTTGGc > 1:988889/1‑145 (MQ=255) gCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGTTTGAGTGTGGTGCCGTAGGTAAACAGGTGGTCGGTTTGGCCAATGCTg > 1:682978/1‑150 (MQ=255) ccTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGTTTGAGTGTGGTGCCGTAGGTAAACAGGTGGTCGGTTTGGCCAATGCTGa < 1:1217869/150‑1 (MQ=255) cTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGTGGGAGTGTGGTGCCGTAGGTAAACAGGTGATCGGTTTGGCCAATGCTGaa > 1:312321/1‑150 (MQ=255) gCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGTTTGAGTGTGGTGCCGTAGGTAAACAGGTGGTCGGTTTGGCCAATGCTGAAgg > 1:546140/1‑150 (MQ=255) cccGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGACGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGTTTGAGTGTGGTGCCGTAGGTAAACAGGTGGTCGGTTTGGCCAATGCTGAAGGc < 2:115818/150‑1 (MQ=255) ggcgcgcgcGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAATTGCCTGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTGTCTCCTGTTTGAGTGTGGTGCCGTAGGTAAACAGGTGGTCGGTTTGGCCAATGCTGAAGGCCtt < 2:690652‑M2/141‑1 (MQ=255) gTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGTTTGAGTGTGGTGCCGTAGGTAAACAGGTGGTCGGTTTGGCCAATGCTGAAGGCCtt < 2:422325/150‑1 (MQ=255) cACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGTTTGAGTGTGGTGCCGTAGGTAAACAGGTGGTCGGTTTGGCCAATGCTGAAGGCCTTGt < 2:795537/150‑1 (MQ=255) gcgcGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGTTTGAGTGTGGTGCCGTAGGTAAACAGGTGGTCGGTTTGGCCAATGCTGAAGGCCTTGTCCa > 2:463815‑M2/5‑150 (MQ=255) cgcGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGTTTGAGTGTGGTGCCGTAGGTAAACAGGTGGTCGGTTTGGCCAATGCTGAAGGCCTTGTCCaa < 1:204190‑M2/147‑1 (MQ=255) cGCCGTCCTGTCCGATGGCGGTACAGGTACCGCCGATGTGCAGGCAAGGCCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGTGTGAGTGTGGTGCCGTAGGTAAACAGGTGGTCGGTTTGGCAAATGCTGAAGGCCTTGTCCAAtt < 1:911787‑M2/149‑1 (MQ=255) | GTGAATTTGGGCTCCATGCGGGTGTAGTCGTAGCGCGCGCCGGGCATGAAGGTCCAGTTGTTCCAGCGGATTTCATCCTGCGCGAACAGGCTGTAGGTATT‑‑CACGGTCGGGTCCGGGAAGTCGCTGACCAAGGCCTGCCCGTCACGCGCGCTGTCCTGTCCGATGGCTGTACAGGTACCACCGATGTTCAGGCAAGTGCCGGTGCCGCTACGTGAACCCGTGACTTTCTCCTGTTTGAGTGTGGTGCCGTAGGTAAACAGGTGGTCGGTTTGGCCAATGCTGAAGGCCTTGTCCAATT > NC_002947/1146384‑1146681 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |