New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1168587 | 62 (1.180) | 3 (0.070) | 3/210 | NT | 5.6% | intergenic (+98/+155) | eda/leuA | KHG/KDPG aldolase/2‑isopropylmalate synthase |
? | NC_002947 | = 1168660 | 49 (1.090) | intergenic (+171/+82) | eda/leuA | KHG/KDPG aldolase/2‑isopropylmalate synthase |
GCGGATCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCATCCCTCATTTC > NC_002947/1168438‑1168736 | gcgGATCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTA > 1:1149778‑M1/1‑150 (MQ=255) gATCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGAc > 2:706587/1‑150 (MQ=255) aTCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGAcc < 1:939083/150‑1 (MQ=255) tCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGAccc > 2:1265114/1‑150 (MQ=255) cGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGATAATTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCg > 2:473545/1‑150 (MQ=255) gAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGc < 2:1288680/150‑1 (MQ=255) tGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCAcc > 2:804990/1‑150 (MQ=255) aGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCt > 1:636609/1‑150 (MQ=255) ctgctgGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTGGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGcaa > 2:922684/1‑149 (MQ=255) tgctgGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGcaca < 1:1019854/150‑1 (MQ=255) tgGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCacacac > 1:153941/1‑150 (MQ=255) gCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGc < 2:32906/114‑1 (MQ=255) gCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGc > 1:32906/1‑114 (MQ=255) gCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCg < 1:780040/133‑1 (MQ=255) gCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCg > 2:780040/1‑133 (MQ=255) ccAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCggggg > 1:1109833/1‑148 (MQ=255) aCTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTg < 1:428982/150‑1 (MQ=255) tGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACg < 2:34286/115‑1 (MQ=255) tGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACg > 1:34286/1‑115 (MQ=255) tGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGa > 1:1119697/1‑150 (MQ=255) tGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGa < 1:706587/150‑1 (MQ=255) aaaaCAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTTTTTTGTGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGaca > 2:732166/1‑150 (MQ=255) aaaaCAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAaacccgctcctactacagcctgtgtccaaaacccggcgtgtgcccaccgcc > 2:563340‑M1/1‑99 (MQ=255) aaaaCAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGgt < 1:22281/142‑1 (MQ=255) aaaaCAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGgt > 2:22281/1‑142 (MQ=255) aCAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGa < 2:1271671/145‑1 (MQ=255) aCAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGa < 2:1271680/145‑1 (MQ=255) aCAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGa > 1:1271680/1‑145 (MQ=255) aCAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGa > 1:1271671/1‑145 (MQ=255) cAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAgg < 2:1261575/150‑1 (MQ=255) tgtgCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCgtag > 2:911482/1‑150 (MQ=255) tgCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCgtagta > 2:1220184/1‑150 (MQ=255) tgCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCgtagta > 2:1042438/1‑150 (MQ=255) tgCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCgtagta > 1:1074660/1‑150 (MQ=255) tgCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCgtagta < 1:765593/150‑1 (MQ=255) gCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGtagtag > 1:1024445/1‑150 (MQ=255) tttACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGa > 2:1243209/1‑150 (MQ=255) tACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAaacccgctcctactacggcctgtgtccaacacccggcgtgtgcccaccgcagatcggtgcgtaggagc < 1:563340‑M1/150‑69 (MQ=255) tACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGc < 2:1119697/150‑1 (MQ=255) cGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCgg < 1:911482/150‑1 (MQ=255) cGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGGAGTAGGAGCgg > 1:1215280/1‑150 (MQ=255) ggCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACCCTCCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCggg < 1:690654/150‑1 (MQ=255) ggCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCgg > 2:124276/1‑120 (MQ=255) ggCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCgg < 1:124276/120‑1 (MQ=255) ggCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCggg < 1:116919/150‑1 (MQ=255) gCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGATGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGt > 1:875790/1‑150 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aGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCggg < 2:105025/131‑1 (MQ=255) | GCGGATCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCATCCCTCATTTC > NC_002947/1168438‑1168736 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |