New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 1455740 | 58 (1.100) | 5 (0.100) | 5/232 | NT | 8.5% | coding (1267/1455 nt) | PP_1273 | multidrug MFS transporter outer membrane protein |
? | NC_002947 | = 1455758 | 53 (1.070) | coding (1285/1455 nt) | PP_1273 | multidrug MFS transporter outer membrane protein |
AGGAAGCCGCGCTGAACTATCGCAAGGTGGTGCTGGGGGCCTGGCATGAAATTGACGATGTGCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGCCAGTATGTGGAAGGGGCGGTGGACTTTCTCAATGTGCTGACGGTGCAAGGTGCGCTGCTGGCCAGCGAGGAGCAATGGATCGACAGCTCGGCCGCGGTGTCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGG > NC_002947/1455594‑1455889 | agGAAGCCGCGCTGAACTATCGCAAGGTGGTGCTGGGGGCCTGGCATGAAATTGACGATGTGCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAgc > 1:1408619/1‑150 (MQ=255) agGAAGCCGCGCTGAACTATCGCAAGGTGGTGCTGGGGGCCTGGCATGAAATTGACGATGTGCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAgc > 2:61682/1‑150 (MQ=255) aGCCGCGCTGAACTATCGCAAGGTGGTGCTGGGGGCCTGGCATGAAATTGACGATGTGCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGCCa < 1:859544/150‑1 (MQ=255) tcttaaCTATCGCAAGGTGGTGCTGGGGGCCTGGCATGAAATTGACGATGTGCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGCCAGTAtgt < 1:240681/146‑1 (MQ=255) gcTGAACTATCGCAAGGTGGTGGTGGGGGCCTGGCATGAAATTGACGATGTGCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCCAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGCCAGTAtgt < 2:447770/150‑1 (MQ=255) cTGAACTATCGCAAGGTGGTGCTGGGGGCCTGGCATGAAATTGACGATGTGCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGCCAGTAtgtg > 1:860797/1‑150 (MQ=255) aCTATCGCAAGGTGGTGCTGGGGGCCTGGCATGAAATTGACGATGTGCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGCCAGTATGTGGAAg < 2:1267434/150‑1 (MQ=255) aCTATCGCAAGGTGGTGCTGGGGGCCTGGCATGAAATTGACGATGTGCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGCCAGTATGTGGAAg > 2:1346983/1‑150 (MQ=255) cTATCGCAAGGTGGTGCTGGGGGCCTGGCATGAAATTGACGATGTGCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGCCAGTATGTGGAAGg < 1:1425861‑M2/150‑2 (MQ=255) tATCGCAAGGTGGTGCTGGGGGCCTGGCATGAAATTGACGATGTGCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGCCAGTATGTGGAAGgg > 2:1344884‑M2/1‑148 (MQ=255) tCGCAAGGTGGTGCTGGGGGCCTGGCATGAAATTGACGATGTGCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCcttccacatactggcgctgggc > 2:1264776‑M1/1‑128 (MQ=255) tCGCAAGGTGGTGCTGGGGGCCTGGCATGAAATTGACGATGTGCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGGCAGTAGGTGGAAGgggc < 2:1143734‑M2/150‑5 (MQ=255) cAAGGTGGTGCTGGGGGCCTGGCATGAAATTGACGATGTGCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGGCGAGGCCTTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGCCAGTCTGTGGAAGgggcggt > 1:996988‑M2/1‑143 (MQ=255) cAAGGTGGTGCTGGGGGCCTGGCATGAAATTGACGATGTGCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGCCAGTATGTGGAAGgggcggt > 2:28107‑M2/1‑143 (MQ=255) cAAGGTGGTGCTGGGGGCCTGGCATGAAATTGACGATGTGCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGCCAGTATGTGGAAGgggcggt < 2:618705‑M2/150‑8 (MQ=255) aaGGTGGTGCTGGGGGCCTGGCATGAAATTGACGATGTGCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCcttccacatactggcgctgggcggtt < 1:1264776‑M1/150‑27 (MQ=255) aaGGTGGTGCTGGGGGCCTGGCATGAAATTGACGATGTGCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGCCAGTATGTGGAAGGGGCGGTg > 2:922694/1‑150 (MQ=255) tggtgCTGGGGGCCTGGCATGAAATTGACGATGTGCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGCCAGTATGTGGAAGGGGCGGTGGACt < 2:1304708/150‑1 (MQ=255) 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gtgCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGCCAGTATGTGGAAGGGGCGGTGGACTTTCTCAATGTGCTGACGGTGCAAGGTGCgctg > 1:8106/1‑150 (MQ=255) tgCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGCCAGTATGTGGAAGGGGCGGTGGACTTTCTCAATGTGCTGACGGTGCAAGGTGCgctgc < 2:269324/150‑1 (MQ=255) tgCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGCCAGTATGTGGAAGGGGCGGTGGACTTTCTCAATGTGCTGACGGTGCAAGGTGCgctgc < 2:269386/150‑1 (MQ=255) tACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGCCAGTATGTGGAAGGGGCGGTGGACGTTCTCAATGTGCTGACGGTGCAAGGTGCGCTGCTgg > 1:785846/1‑150 (MQ=255) cTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGCCAGTATGTGGAAGGGGCGGTGGACTTTCTCAATGTGCTGACGGTGCAAGGTGCGCTGCTGGCCAGc > 2:401361/1‑150 (MQ=255) 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aCCGCCCAGCGCCAGTATGTGGAAGGGGCGGTGGACTTTCTCAATGTGCTGACGGTGCAAGGTGCGCTGCTGGCCAGCGAGGAGCAATGGATCGACAGCTCGGCCGCGGTGTCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGa < 1:922694/150‑1 (MQ=255) ccGCCCAGCGCCAGTATGTGGAAGGGGCGGTGGACTTTCTCAATGTGCTGACGGTGCAAGGTGCGCTGCTGGCCAGCGAGGAGCAATGGATCGACAGCTCGGCCGCGGTGTCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAg < 1:1351913/150‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAGTATGTGGAAGGGGCGGTGGACTTTCTCAATGTGCTGACGGTGCAAGGTGCGCTGCTGGCCAGCGAGGAGCAATGGATCGACAGCTCGGCCGCGGTGTCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAgg > 1:1076828/1‑150 (MQ=255) gCCCcttccacctactgccgctgggcggtttccagggcgattcggttttgccgcacggcctcggcaaggtgatcacggcgcaactgactggcgttgtacaggcgtagcacatcgtcaatttcatgccaggcccccagcaccaccttgcga < 2:1143734‑M1/150‑147 (MQ=255) gCCCAGCGCCAGTATGTGGAAGgggcggtttccagggcgattcggttttgccgcacggcctcggcaaggtgatcacggcgcaactgactggcgttgtacaggcgtagcacatcgtcaatttcatgccaggcccccagcaccaccttgcga > 2:1264776‑M2/1‑22 (MQ=255) gCCCAGCGCCAGTATGTGGAAGGGGCGGTGGACTTTCTCAATGTGCTGACGGTGCAAGGTGCGCTGCTGGCCAGCGAGGAGCaa > 2:452066/1‑84 (MQ=255) gCCCAGCGCCAGTATGTGGAAGGGGCGGTGGACTTTCTCAATGTGCTGACGGTGCAAGGTGCGCTGCTGGCCAGCGAGGAGCaa < 1:452066/84‑1 (MQ=255) cccttccacatactggcgctgggcggtttccagggcgattcggttttgccgcacggcctcggcaaggtgatcacggcgcaactgactggcgttgtacaggcgtagcacatcgtcaatttcatgccaggcccccagcaccaccttgcgata > 2:1344884‑M1/1‑2 (MQ=255) ccAGCGCCAGTATGTGGAAGGGGCGGTGGACTTTCTCAATGTGCTGACGGTGCAAGGTGCGCTGCTGGCCAGCGAGGAGCAATGGATCGACAGCTCGGCCGCGGTGTCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTg > 1:1244943/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCCAGTATGTGGAAGGGGCGGTGGACTTTCTCAATGTGCTGACGGTGCAAGGTGCGCGGCTGGCCAGCGAGGAGCAATGGATCGACAGCTCGGCCGCGGTGTCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTg < 2:403682/150‑1 (MQ=255) ccttccacatactggcgctgggcggtttccagggcgattcggttttgccgcacggcctcggcaaggtgatcacggcgcaactgactggcgttgtacaggcgtagcacatcgtcaatttcatgccaggcccccagcaccaccttgcgatag < 1:1425861‑M1/150‑150 (MQ=255) | AGGAAGCCGCGCTGAACTATCGCAAGGTGGTGCTGGGGGCCTGGCATGAAATTGACGATGTGCTACGCCTGTACAACGCCAGTCAGTTGCGCCGTGATCACCTTGCCGAGGCCGTGCGGCAAAACCGAATCGCCCTGGAAACCGCCCAGCGCCAGTATGTGGAAGGGGCGGTGGACTTTCTCAATGTGCTGACGGTGCAAGGTGCGCTGCTGGCCAGCGAGGAGCAATGGATCGACAGCTCGGCCGCGGTGTCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGG > NC_002947/1455594‑1455889 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |