| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1899274 | 56 (1.070) | 9 (0.200) | 6/216 | NT | 15.9% | intergenic (+302/‑218) | PP_t18/PP_1703 | tRNA‑Asp/assimilatory nitrate reductase/sulfite reductase |
| ? | NC_002947 | = 1899304 | 46 (1.000) | intergenic (+332/‑188) | PP_t18/PP_1703 | tRNA‑Asp/assimilatory nitrate reductase/sulfite reductase | |||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
CCCGTCCTCGATCACCGGCATCTCCTGGGACATGGGAGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCG > NC_002947/1899125‑1899419 | cccGTCCTCGATCACCGGCATCTCCTGGGACATGGGAGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCCTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGG < 1:82396‑M1/150‑1 (MQ=255) gccccggcatgctgatgcaagcggggcaacacggcgcctttgtcgtgaagtggtgagggctgtcgacgttgacagcccgggatgaggtagatcagcaatttatgggccagctataccggccctttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGGt < 1:1001149‑M1/16‑1 (MQ=255) ccccggcatgctgatgcaagcggggcaacacggcgcctttgtcgtgaagtggtgagggctgtcgacgttgacagcccgggatgaggtagatcagcaatttatgggccagctataccggccctttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAGGTa < 1:308284‑M1/17‑1 (MQ=255) tgatgcaagcggggcaacacggcgcctttgtcgtgaagtggtgagggctgtcgacgttgacagcccgggatgaggtagatcagcaatttatgggccagctataccggccctttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGccc < 2:286496‑M1/28‑1 (MQ=255) cGGCATCTCCTGGGACATGGGAGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTc > 2:43270/1‑150 (MQ=255) cGGCATCTCCTGGGACATGGGAGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTAACCTAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTc < 1:866240/150‑1 (MQ=255) tgcaagcggggcaacacggcgcctttgtcgtgaagtggtgagggctgtcgacgttgacagcccgggatgaggtagatcagcaatttatgggccagctataccggcctcttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCa < 2:1153826‑M1/31‑1 (MQ=255) aTCTCCTGGGACATGGGAGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGc > 2:490721/1‑150 (MQ=255) cggggcaacacggcgcctttgtcgtgaagtggtgagggctgtcgacgttgacagcccgggatgaggtagatcagcaatttatgggccagctataccggcctcttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCtt > 2:1160777‑M1/114‑150 (MQ=255) ggggcaacacggcgcctttgtcgtgaagtggtgagggctgtcgacgttgacagcccgggatgaggtagatcagcaatttatgggccagctataccggccctttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTg > 1:286496‑M1/113‑150 (MQ=255) ggACATGGGAGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAg < 2:1363373/140‑1 (MQ=255) ggACATGGGAGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAg > 1:1363373/1‑140 (MQ=255) gggAGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgatatcgcaaggcctgagggcggcgcagcacct < 2:1232875‑M1/150‑34 (MQ=255) ggcgcctttgtcgtgaagtggtgagggctgtcgacgttgacagcccgggatgaggtagatcagcaatttatgggccagctataccggccctttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAgg > 2:121934‑M1/103‑117 (MQ=255) gAGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCcctgt > 1:490721‑M2/1‑145 (MQ=255) cgcctttgtcgtgaagtggtgagggctgtcgacgttgacagcccgggatgaggcagatcagcaatttatgggccagctataccggccctttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCtgt > 2:406547‑M1/101‑150 (MQ=255) gggCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgatatcgcaaggcctgagggcggcgcagtacctgtgg < 1:391123‑M1/150‑38 (MQ=255) gggCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgatatcgcaaggcctgagggcggcgcagtacctgtgg < 1:1197924‑M1/150‑38 (MQ=255) cgcctttgtcgtgaagtggtgagggctgtcgacgttgacagcccgggatgaggtagatcagcaatttatgggccagctataccggcccttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCtgtg > 1:187775‑M1/100‑150 (MQ=255) cctttgtcgtgaagtggtgagggctgtcgacgttgacagcccgggatgaggtagatcagcaatttatgggccagctataccggccctttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTgg > 2:1119965‑M1/99‑150 (MQ=255) cctttgtcgtgaagtggtgagggctgtcgacgttgacagcccgggatgaggtagatcagcaatttatgggccagctataccggccctttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTgg > 2:308284‑M1/99‑150 (MQ=255) ctttgtcgtgaagtggtgagggctgtcgacgttgacagcccgggatgaggtagatcagcaatttatgggccagctataccggccctttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTggg > 2:1421273‑M1/98‑150 (MQ=255) tttgtcgtgaagtggtgagggctgtcgacgttgacagcccgggatgaggtagatcagcaatttatgggccagctataccggcctcttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGa > 2:505496‑M1/97‑150 (MQ=255) tttgtcgtgaagtggtgagggctgtcgacgttgacagcccgggatgaggtagatcagcaatttatgggccagctataccggccctttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGa > 2:855685‑M1/97‑150 (MQ=255) tGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCcctgtgggagcgg > 2:1257618‑M2/1‑137 (MQ=255) tgaagtggtgagggctgtcgacgttgacagcccgggatgaggtagatcagcaatttatgggccagctataccggccctttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTgg < 1:106841‑M1/52‑1 (MQ=255) tgaagtggtgagggctgtcgacgttgacagcccgggatgaggtagatcagcaatttatgggccagctataccggccctttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTgg > 2:106841‑M1/90‑141 (MQ=255) tGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGc > 2:150691/1‑150 (MQ=255) tGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGc < 2:958911/150‑1 (MQ=255) tGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGc < 2:1099405/150‑1 (MQ=255) cTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG < 1:1245984‑M1/99‑1 (MQ=255) cTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG > 2:1245984‑M1/1‑99 (MQ=255) tGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCcctgtg < 2:1216909‑M2/134‑7 (MQ=255) tGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCcctgtg > 1:1216909‑M2/1‑128 (MQ=255) gatctcAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGACA‑TGAATGGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAgg < 1:1143163/145‑1 (MQ=38) ccccAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGgatatcgcaaggcctgagggcggcgcagtacctgtgg < 2:130988‑M1/126‑38 (MQ=255) ccccAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGgatatcgcaaggcctgagggcggcgcagtacctgtgg > 1:130988‑M1/1‑89 (MQ=255) ccccAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgatatcgcaaggcctgagggcggcgcagtacctgtggga > 1:1335035‑M1/1‑89 (MQ=255) cccAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGcc > 1:781260/1‑150 (MQ=255) ccAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGTTATCcctgtgggagcg > 2:680413‑M2/1‑117 (MQ=255) ccAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCCTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGgatatcgcaaggcctgagggcggcgcagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggcct < 1:1114015‑M1/150‑64 (MQ=255) cAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCcctgt > 2:1349430‑M2/1‑116 (MQ=255) cAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCg < 1:808435/149‑1 (MQ=255) cAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCAACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCcctgt < 1:1349430‑M2/121‑6 (MQ=255) aGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCCT‑GCCGCGTAGCCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGt < 2:1403982/150‑1 (MQ=255) gCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGta > 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tGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTg > 1:1353443/1‑150 (MQ=255) gAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaaa > 2:818213/1‑122 (MQ=255) gAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaaa < 1:818213/122‑1 (MQ=255) gTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGa < 1:493317/150‑1 (MQ=255) gTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCAGGTATCGCTGGCCCATAAATTGCCGa < 2:1157334/150‑1 (MQ=255) cACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTAc > 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gcgGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGc > 1:213913/1‑47 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGgatatcgcaaggcctgagggcggcgcagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggcctgcacaggttacgcaccatgcggtggcaacctcatgctcccaggcgctttgctggggcaatttccagcatgagca > 2:1257618‑M1/1‑13 (MQ=255) cGCTCCCACAGGgataacgcaaggcctgagggcggcgcagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggcctgcacaggttacgcaccatgcggtggcaacctcatgctcccaggcgctttgctgg > 2:680413‑M1/1‑12 (MQ=255) cGCTCCCACAGGgataacgcaaggcctgagggcggcgcagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggcctgcacaggttacgcaccatgcggtggcaacctcatgctcccaggcgctttgctgg < 1:680413‑M1/129‑118 (MQ=255) tCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggcctgcacaggttacgcaccatgcggtggcaacctcatgctcccaggcgctttgctgggg < 2:1335035‑M2/128‑90 (MQ=255) tCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggcctgcacaggttacgcaccatgcggtggcaacctcatgctcccaggcgctttgctgggg > 1:1335035‑M2/1‑39 (MQ=255) TCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCGACGTTGACAgcccg > 1:1147881‑M1/1‑132 (MQ=255) TCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCGACGTTGACAgcccg < 2:1147881‑M1/133‑2 (MQ=255) TCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACaaa < 1:1019109‑M1/150‑1 (MQ=255) CCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAg > 2:955013‑M1/1‑150 (MQ=255) ccACAGGgatatcgcaaggcctgagggcggcgcagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggcctgcacaggttacgcaccatgcggtggcaacctcatgctcccag < 1:254176‑M1/112‑106 (MQ=255) ccACAGGgatatcgcaaggcctgagggcggcgcagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggcctgcacaggttacgcaccatgcggtggcaacctcatgctcccag > 2:254176‑M1/1‑7 (MQ=255) ccACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggcctgcacaggttacgcaccatgcggtggcaacctcatgctcccaggcgctttgctggggcaatttccagcatgagcactgccc < 1:391123‑M2/150‑114 (MQ=255) ccACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggcctgcacaggttacgcaccatgcggtggcaacctcatgctcccaggcgctttgctggggcaatttccagcatgagcactgccc < 1:1197924‑M2/150‑114 (MQ=255) ccACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCcctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaggcctgcacaggttacgcaccatgcggtggcaacctcatgctcccaggcgctttgctgggg > 1:130988‑M2/1‑37 (MQ=255) ccACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCcctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaggcctgcacaggttacgcaccatgcggtggcaacctcatgctcccaggcgctttgctgggg < 2:130988‑M2/126‑90 (MQ=255) CCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAgg < 1:412811‑M1/150‑1 (MQ=255) CCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAgg < 1:57793‑M1/150‑1 (MQ=255) cacaGGgatatcgcaaggcctgagggcggcgcagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggcctgcacaggttacgcaccatgcggtggcaacctcatgctcccaggcgctttgctggggcaatttcca < 2:1216909‑M1/134‑129 (MQ=255) cacaGGgatatcgcaaggcctgagggcggcgcagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggcctgcacaggttacgcaccatgcggtggcaacctcatgctcccaggcgctttgctggggcaatttcca > 1:1216909‑M1/1‑6 (MQ=255) acaGGgatatcgcaaggcctgagggcggcgcagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggcctgcacaggttacgcaccatgcggtggcaacctcatgctcccaggcgctttgctggggcaatttccagcatgagcactgccctc > 1:490721‑M1/1‑5 (MQ=255) acaGGgatatcgcaaggcctgagggcggcgcagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggcctgcacaggttacgcaccatgcggtggcaacctcatgctcccaggcgctttgctg > 2:1349430‑M1/1‑5 (MQ=255) AGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAAc > 2:1246335‑M1/1‑115 (MQ=255) AGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAAc < 1:1246335‑M1/115‑1 (MQ=255) | CCCGTCCTCGATCACCGGCATCTCCTGGGACATGGGAGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCAT‑GGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCG > NC_002947/1899125‑1899419 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |