New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1923519 = | 68 (1.290) | 4 (0.080) | 4/240 | NT | 5.9% | coding (563/795 nt) | PP_1723 | 2‑aminoethylphosphonate ABC transporter permease |
? | NC_002947 | 1923543 = | 62 (1.210) | coding (539/795 nt) | PP_1723 | 2‑aminoethylphosphonate ABC transporter permease |
GAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGATGGCCCTGTACATGAACGGCAGGGCGATGGTGAA > NC_002947/1923371‑1923652 | gAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCgg < 1:531737/150‑1 (MQ=255) catggtcggcacaccgtggatcctgatcggctgctacttcaccatcgccctgccgttcatgtacagggccatcaccaacaacctgcaggccatcaacctgcgcgacctgatggacgccgcgcagctgctcggcgccagcacctggcaggc < 2:1033765‑M1/3‑1 (MQ=255) catggtcggcacaccgtggatcctgatcggctgctacttcaccatcgccctgccggtcatgtacagggccatcaccaacaacctgcaggccatcaacctgcgcgacctgatggacgccgcgcagctgctcggcgccagcacctggcaggc < 2:15705‑M1/3‑1 (MQ=255) aatggtcggcacaccgtggatcctgatcggctgctacttcaccatcgccctgccgttcatgtacagggccatcaccaacaacctgcaggccatcaacctgcgcgacctgatggacgccgcgcagctgctcggcgccagcacctggcaggc > 2:217146‑M1/148‑150 (MQ=255) gCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGcac > 2:334415/1‑150 (MQ=255) gCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGACGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGcac > 2:702297/1‑150 (MQ=255) gctgctGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGcaccac > 2:142091/1‑150 (MQ=255) tgTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCTGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACcagca < 1:1386076/150‑1 (MQ=255) cgcATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCg < 2:282080/150‑1 (MQ=255) tgttgtTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCt > 1:844578/1‑150 (MQ=255) ttgttCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGc < 2:32488/150‑1 (MQ=255) gttCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCa < 1:334415/150‑1 (MQ=255) gttCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCa > 2:1407728/1‑150 (MQ=255) ttCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAg > 2:125051/1‑150 (MQ=255) acCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGgcg > 1:965914/1‑150 (MQ=255) acCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCAACCAT‑CAGGCCCTCGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGgcg > 2:43653/1‑150 (MQ=255) tGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGAGCCg > 2:671723/1‑150 (MQ=255) gCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGa < 1:483664/150‑1 (MQ=255) tctcGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCt > 1:808692/1‑150 (MQ=255) gggTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGACCTGCCACCATCCAAGATC‑GGAAGAGCACACGTATGACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGACGAGCGTCTGCGCGGCGt > 1:1033765/1‑150 (MQ=255) gTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGACGCCGCGCAGCTGCtcggcgcca < 1:1407728/150‑4 (MQ=255) ccGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCagc > 1:1427582/1‑148 (MQ=255) cGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTccacca < 1:758918/150‑1 (MQ=255) gACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAg > 2:478875/1‑150 (MQ=255) cagcagGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGGACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTc > 1:1358537/1‑150 (MQ=255) cagcagGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTc > 2:1206635/1‑150 (MQ=255) aaaCACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGAt < 1:478875/150‑1 (MQ=255) aaCACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATg < 1:671723/150‑1 (MQ=255) acacGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATgg > 1:840967/1‑150 (MQ=255) cacGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACcagca > 1:71249/1‑83 (MQ=255) cacGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACcagca < 2:71249/83‑1 (MQ=255) gAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATg < 2:158009/145‑1 (MQ=255) gAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATg > 1:158009/1‑145 (MQ=255) ttCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCAAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAg < 1:702297/150‑1 (MQ=255) ccGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAg < 2:654914/131‑1 (MQ=255) ccGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAg > 1:654914/1‑131 (MQ=255) gAACAGGAACGAGAACGACAGCAACACTGCCACCAT‑TTGGGCGTGGCGACGCTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGTCTGCAGgttgtt < 2:666551/150‑1 (MQ=255) atcaacctgcgcgacctgatggacgccgcgcagctgctcggcgccagcacctggcaGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCa < 1:195432‑M1/29‑1 (MQ=255) atcaacctgcgcgacctgatggacgccgcgcagctgctcggcgccagcacctggcaGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCa > 2:195432‑M1/57‑85 (MQ=255) aaCAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGttgttg < 2:840967/150‑1 (MQ=255) cAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGt < 1:125051/150‑1 (MQ=255) gaacgagaacgaCAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGAt > 2:965042/1‑150 (MQ=255) aacgagaacgaCAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGATg < 1:142091/150‑1 (MQ=255) aacgagaacgaCAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGATg < 2:844578/150‑1 (MQ=255) acgagaacgaCAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGAt > 2:99141/1‑148 (MQ=255) acgagaacgaCAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGAt < 1:99141/148‑1 (MQ=255) acgaCAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGgttgtt < 2:806002/136‑1 (MQ=255) acgaCAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGgttgtt > 1:806002/1‑136 (MQ=255) cgaCAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGttgttg > 1:886970/1‑136 (MQ=255) cgaCAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGttgttg < 2:886970/136‑1 (MQ=255) aCAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGATGGCCCTGTACa < 2:549776/150‑1 (MQ=255) cagcagCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGATGGCCCTGTACAt < 2:808692/150‑1 (MQ=255) agcagcACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGATGGCCCTGTACATg > 2:1343957/1‑150 (MQ=255) agcagcACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGATGGCCCTGTACATg > 1:1373742/1‑150 (MQ=255) agcaCTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGATGGCCCTGTACATGAAc < 2:1427582/150‑1 (MQ=255) gCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGATGGCCCTGTACATGAACGGCAgg < 1:417856/150‑1 (MQ=255) ccaccaT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGATGGCCCTGTACATGAACGGCAggg > 1:15705/1‑150 (MQ=255) ccaccaT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGATGGCCCTGTACATGAACGGCAggg > 2:1243281/1‑150 (MQ=255) ccaccaT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGATGGCCCTGTACATGAACGGCAggg < 2:965914/150‑1 (MQ=255) ccaT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGATGGCCCTGTACATGAACGGCAGGGCGa < 2:235597/150‑1 (MQ=255) caT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGATGGCCGTGTACATGAACGGCAGGGCGAt > 2:587265/1‑150 (MQ=255) t‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCCAGGCCTGGGTGATGGCCCTGTACATGAACGGCAAGGCGATgg > 1:727739/1‑150 (MQ=255) aGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCCGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGATGGCCCTg > 2:1059108/1‑126 (MQ=255) aGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGATGGCCCTg < 1:1059108/126‑1 (MQ=255) ggcgccagcacctggcaGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTg < 1:1407132‑M1/26‑1 (MQ=255) ggcgccagcacctggcaGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTg > 2:1407132‑M1/18‑43 (MQ=255) ggCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCt < 1:343482/66‑1 (MQ=255) ggCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCt > 2:343482/1‑66 (MQ=255) gCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGttgttg > 1:64416/1‑112 (MQ=255) gCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGttgttg < 2:64416/112‑1 (MQ=255) gCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGATGGCCCTGTACATGAACGGCAGGGCGATGGTGaa < 1:965042/150‑1 (MQ=255) gCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGATGGCCCTGTACATGAACGGCAGGGCGATGGTGaa > 2:204861/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTgg < 1:159966/110‑1 (MQ=255) cTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTgg > 2:159966/1‑110 (MQ=255) gcAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAg < 1:598269/82‑1 (MQ=255) gcAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAg > 2:598269/1‑82 (MQ=255) | GAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAT‑CAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGCGCCGAGCAGCTGCGCGGCGTCCATCAGGTCGCGCAGGTTGATGGCCTGCAGGTTGTTGGTGATGGCCCTGTACATGAACGGCAGGGCGATGGTGAA > NC_002947/1923371‑1923652 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |