| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2472145 = | 20 (0.380) | 4 (0.110) | 4/168 | NT | 20.7% | intergenic (+6/+143) | PP_2166/PP_2167 | anti‑anti‑sigma factor/PhoD‑like phosphatase |
| ? | NC_002947 | 2472269 = | 17 (0.480) | intergenic (+130/+19) | PP_2166/PP_2167 | anti‑anti‑sigma factor/PhoD‑like phosphatase | |||||
GCCTGACCGACTTGCCGTCGCAGGACCAGAATGAAGATGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAG > NC_002947/2471997‑2472255 | gCCTGACCGACTTGCCGTCGCAGGACCAGAATGAAGATGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAG < 1:1372568‑M1/150‑1 (MQ=255) aacggctgtggaatggtgccgggctgggacaggtgttttttgatgaacaggggcggccggcgcgggtgtaccagctggatgctggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGc > 1:620161‑M1/142‑150 (MQ=255) gACTTGCCGTCGCAGGACCAGAATGAAGATGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTG > 2:287523‑M1/1‑148 (MQ=255) gACTTGCCGTCGCAGGACCAGAATGAAGATGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTG < 1:287523‑M1/148‑1 (MQ=255) aCTTGCCGTCGCAGGACCAGAATGAAGATGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCG > 2:964267‑M1/1‑150 (MQ=255) gctgtggaatggtgccgggctgggacaggtgttttttgatgaacaggggcggccggcgcgggtgtaccagctggatgctggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGc > 2:113313‑M1/138‑150 (MQ=255) tggaatggtgccgggctgggacaggtgttttttgatgaacaggggcggccggcgcgggtgtaccagctggatgctggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGCctct > 1:582657‑M1/134‑150 (MQ=255) tggtgccgggctgggacaggtgttttttgatgaacaggggcggccggcgcgggtgtaccagctggatgctggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTcgcg > 2:651090‑M1/129‑150 (MQ=255) aGGACCAGAATGAAGATGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGG < 1:968175‑M1/150‑1 (MQ=255) gACCAGAATGAAGATGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGT < 2:549304‑M1/150‑1 (MQ=255) cAGAATGAAGATGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA > 2:1045548‑M1/1‑150 (MQ=255) cAGAATGAAGATGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGG > 2:1151298‑M1/1‑134 (MQ=255) cAGAATGAAGATGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGG < 1:1151298‑M1/134‑1 (MQ=255) gAATGAAGATGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACC > 2:1100177‑M1/1‑150 (MQ=255) tGAAGATGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGC > 1:76665‑M1/1‑150 (MQ=255) aGATGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCC < 2:1218013‑M1/150‑1 (MQ=255) gATGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT > 2:1286158‑M1/1‑150 (MQ=255) tgtgGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTTACCCGCgaagag < 1:385366‑M1/150‑7 (MQ=255) aggtgttttttgatgaacaggggcggccggcgcgggtgtaccagctggatgctggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgaggttcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTac < 2:1308960‑M1/39‑1 (MQ=255) gttttttgatgaacaggggcggccggcgcgggtgtaccagctggatgctggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑Ctgtg < 2:1162354‑M1/8‑1 (MQ=255) gttttttgatgaacaggggcggccggcgcgggtgtaccagctggatgctggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑Ctgtg > 1:1162354‑M1/108‑115 (MQ=255) gtgCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTacgacg < 2:266024/150‑1 (MQ=255) gcgcTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGACGGCCTCTTCACGGGTAAAACACCTCCTACGACgga > 2:585586/1‑149 (MQ=255) aGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGccc > 2:1117428/1‑150 (MQ=255) tGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAacac > 2:649414/1‑150 (MQ=255) gggcggccggcgcgggtgtaccagctggatgctggcgggggtgcggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCgg > 1:323890‑M1/92‑114 (MQ=255) gggcggccggcgcgggtgtaccagctggatgctggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCgg < 2:323890‑M1/23‑1 (MQ=255) ggCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAt < 2:1300643/150‑1 (MQ=255) gcgcACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGGGCTGGATCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCATCCTCTTCTCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgatcgggtggggatagacatt > 2:1170478‑M1/1‑125 (MQ=255) aaGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAt > 1:974933/1‑143 (MQ=255) aaGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAt < 2:974933/143‑1 (MQ=255) aGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCGGCGCGGGTAAACCCGCTCCTACtcctgattgggggtggacacacattggtgttt < 1:964267‑M1/150‑33 (MQ=255) aGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATA > 2:1147466‑M1/1‑80 (MQ=255) aGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATA < 1:1147466‑M1/80‑1 (MQ=255) gggtgtaccagctggatgctggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 1:894216‑M1/36‑1 (MQ=255) gggtgtaccagctggatgctggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc > 2:894216‑M1/79‑114 (MQ=255) gATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCa > 1:201466/1‑150 (MQ=255) gATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATA < 1:808685‑M1/79‑1 (MQ=255) gATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATA > 2:808685‑M1/1‑79 (MQ=255) aTCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCAc < 1:649414/150‑1 (MQ=255) gtgtaccagctggatgctggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGc < 2:1393618‑M1/13‑1 (MQ=255) gtgtaccagctggatgctggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGc > 1:1393618‑M1/77‑89 (MQ=255) gtgtaccagctggatactggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCAcc < 1:283692‑M1/74‑1 (MQ=255) ccTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATATATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCAccc < 2:45283/150‑1 (MQ=255) tCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCAccccc > 2:313912/1‑150 (MQ=255) accagctggatgctggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGCCTCtt > 1:918445‑M1/73‑90 (MQ=255) accagctggatgctggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGCCTCtt < 2:918445‑M1/18‑1 (MQ=255) tGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCaaa > 2:164980/1‑126 (MQ=255) tGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCaaa < 1:164980/126‑1 (MQ=255) gCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAg < 1:585586/150‑1 (MQ=255) cTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGgt < 2:1203351/150‑1 (MQ=255) gAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAtgtgt < 1:320806/130‑1 (MQ=255) gAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAtgtgt > 2:320806/1‑130 (MQ=255) tgctggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGc < 1:229267‑M1/3‑1 (MQ=255) tgctggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGc > 2:229267‑M1/63‑65 (MQ=255) aaTNACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTCGGCAAGTTGCGGGAGCGGAGCTGATCTCTTCCGATCTG‑TTGCGGCGTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTa < 1:957872/150‑1 (MQ=12) aTGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtag < 2:1282071‑M1/150‑51 (MQ=255) gcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGc > 2:283692‑M1/58‑150 (MQ=255) cTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagc > 1:808189‑M1/1‑96 (MQ=255) ccAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgg < 1:1100177‑M1/150‑57 (MQ=255) ccAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgg < 2:808189‑M1/150‑57 (MQ=255) ccAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgg > 1:1117428‑M2/1‑140 (MQ=255) ccAACCGCGAAGCCTTCCACGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATATC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTATgccgaactgggggtggatacccattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgg < 1:1170478‑M1/150‑57 (MQ=255) cAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcggg > 2:76665‑M2/1‑139 (MQ=255) aaCCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTACAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgg < 2:1093053‑M1/148‑57 (MQ=255) aaCCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTACAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgg > 1:1093053‑M1/1‑92 (MQ=255) gAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttaccc < 1:1286158‑M1/150‑65 (MQ=255) gAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttaccc > 2:201466‑M2/1‑132 (MQ=255) cTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacccgcgaa > 1:1045548‑M2/1‑127 (MQ=255) ttCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTATGACGGCCTgcgc < 1:979101/92‑1 (MQ=255) ttCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTATGACGGCCTgcgc > 2:979101/1‑92 (MQ=255) ttCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CT > 2:279966‑M1/1‑46 (MQ=255) ttCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CT < 1:279966‑M1/46‑1 (MQ=255) agagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCg < 2:289902‑M1/94‑1 (MQ=255) agagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCg > 1:289902‑M1/42‑135 (MQ=255) ccATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCAAGAGC‑CGGTGCCGGCCTCTTCCCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGAGGCCAAACACCAAAGCGTGACCACCCCCAATCTGGTgtaggagcgggtttacccgcgaagag > 2:570986‑M2/1‑124 (MQ=255) agtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc > 2:467767‑M1/40‑68 (MQ=255) agtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 1:467767‑M1/29‑1 (MQ=255) tGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccg > 2:1030673‑M1/1‑63 (MQ=255) tGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccg < 1:1030673‑M1/128‑66 (MQ=255) ggagcTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtag > 1:901959‑M2/1‑98 (MQ=255) ggagcTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtag < 2:901959‑M2/102‑5 (MQ=255) aGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgta < 2:441066‑M1/88‑50 (MQ=255) aGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgta > 1:441066‑M1/1‑39 (MQ=255) | GCCTGACCGACTTGCCGTCGCAGGACCAGAATGAAGATGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC‑CTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAG > NC_002947/2471997‑2472255 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |