New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2660074 = | 50 (0.950) | 5 (0.100) | 4/228 | NT | 9.7% | coding (305/1536 nt) | PP_2331 | membrane protein |
? | NC_002947 | 2660112 = | 47 (0.970) | coding (267/1536 nt) | PP_2331 | membrane protein |
GCGCCATCAGGGCTTCAGCGGCGATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACC > NC_002947/2659925‑2660205 | gcgcCATCAGGGCTTCAGCGGCGATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGAc < 1:718724/150‑1 (MQ=255) gcCATCAGGGCTTCAGCGGCGATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGt > 1:498145/1‑150 (MQ=255) gacctgtggaacatcgacgccaaggtcgagttcgtggccagcagcaaggacccggtcaaggtgcagatgttcgtgccaccgctgaaccgcgactacgtcagcctcaacgagagcttcatctccaacaactacggggtcagcatcaacCGt < 1:484227‑M1/3‑1 (MQ=255) acctgtggaacatcgacgccaaggtcgagttcgtggccagcagcaaggacccggtcaaggtgcagatgttcgtgccaccgctgaaccgcgactacgtcaacgtcaacgagagcttcatctccaacaactacggggtcagcatcaacCGTg < 1:313123‑M1/4‑1 (MQ=255) tgCTTCAGCGGCGATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCa < 1:516258/149‑1 (MQ=255) gCTTCAGCGGCGATCTTCTCGCGGCCTTCGCCGGCCAGGCTGCCACGGAAGGTCGTGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTCCCACTGGCCCGACGTGCCCACCAg > 2:484227/1‑150 (MQ=255) cggcgATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCt < 2:498145/150‑1 (MQ=255) gcgATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTg < 2:362136/150‑1 (MQ=255) gATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCg > 1:353801/1‑150 (MQ=255) gttcgtggccagcagcaaggacccggtcaaggtgcagatgttcgtgccaccgctgaaccgcgactacgtcagcctcaacgagagcttcatctccaacaactacggggtcagcatcaacCGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTc > 1:988166‑M1/119‑150 (MQ=255) ggggCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCg > 2:267560/1‑125 (MQ=255) ggggCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCg < 1:267560/125‑1 (MQ=255) gggCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGTTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCg < 2:290666/150‑1 (MQ=255) ttCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGATGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACg > 1:528459/1‑150 (MQ=255) ccAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATgt > 2:507055/1‑149 (MQ=255) cAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCt > 2:175594/1‑150 (MQ=255) cAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCt > 1:718714/1‑150 (MQ=255) ggCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGa < 1:175594/150‑1 (MQ=255) tGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGAccc > 2:107158/1‑150 (MQ=255) cACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGt < 2:626930/150‑1 (MQ=255) gAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAgtt > 1:1373134/1‑150 (MQ=255) gTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCCGTACCAGGCTGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCCAAACGCGAACGGTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGttgttg < 1:748496/150‑1 (MQ=255) gTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGttgttg < 1:1382530/150‑1 (MQ=255) ggCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGgaga < 2:703667/150‑1 (MQ=255) cTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGa > 2:1093997/1‑150 (MQ=255) aCCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGctc > 2:134981/1‑150 (MQ=255) ttctCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGga > 2:910082/1‑131 (MQ=255) ttctCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGga < 1:910082/131‑1 (MQ=255) gTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGga > 2:273321/1‑126 (MQ=255) gTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGga < 1:273321/126‑1 (MQ=255) ccgcgactacgtcagcctcaacgagagcttcatctccaacaactacggggtcagcatcaacCGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTc < 1:1158643‑M1/32‑1 (MQ=255) ccgcgactacgtcagcctcaacgagagcttcatctccaacaactacggggtcagcatcaacCGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTc > 2:1158643‑M1/62‑93 (MQ=255) gcgactacgtcagcctcaacgagagcttcatctccaacaactacggggtcagcatcaacCGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGt > 1:430123‑M1/60‑90 (MQ=255) gcgactacgtcagcctcaacgagagcttcatctccaacaactacggggtcagcatcaacCGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGt < 2:430123‑M1/31‑1 (MQ=255) gcgggaGCGTTTGGTCCGTCCCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACTGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTCGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTa < 2:197809/145‑1 (MQ=255) tGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGgaga > 1:1131988/1‑123 (MQ=255) tGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGgaga < 2:1131988/123‑1 (MQ=255) tCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTgg > 1:705656/1‑108 (MQ=255) tCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTgg < 2:705656/108‑1 (MQ=255) tCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGga > 2:1207465/1‑109 (MQ=255) tCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGga < 1:1207465/109‑1 (MQ=255) tACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTgg < 2:718714/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAgttgt > 2:1135727/1‑98 (MQ=255) cAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAgttgt < 1:1135727/98‑1 (MQ=255) cAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAg < 2:1004904/109‑1 (MQ=255) cAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAg > 1:1004904/1‑109 (MQ=255) agtagAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCt < 2:353801/150‑1 (MQ=255) agagGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATg < 2:1384096/95‑1 (MQ=255) agagGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATg > 1:1384096/1‑95 (MQ=255) agagGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCa > 2:478637/1‑150 (MQ=255) gagGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACAt > 2:1333135/1‑144 (MQ=255) gagGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACAt < 1:1333135/144‑1 (MQ=255) ggTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAg < 1:973254/105‑1 (MQ=255) ggTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAg > 2:973254/1‑105 (MQ=255) tGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGAcc < 1:134981/150‑1 (MQ=255) gTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCtctc > 2:135173/1‑93 (MQ=255) gTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCtctc < 1:135173/93‑1 (MQ=255) cACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTcg < 2:1229319/107‑1 (MQ=255) cACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTcg > 1:1229319/1‑107 (MQ=255) | GCGCCATCAGGGCTTCAGCGGCGATCTTCTCGGGGCCTTCGACGGCCAGGCTGTCACGGAAGGTCGGGCCTTTGACCTTGGTCTTCTCGTTGCTGTAGCGCTTGGTCAGTACCAGGCGGTAGTAGAGGGTCTGGTTGCCACTGGCGCGACGTGCCGACCAGGTAACCTTGCGGTTGCCGTCGGCACGGTTGATGCTGACCCCGTAGTTGTTGGAGATGAAGCTCTCGTTGAGGCTGACGTAGTCGCGGTTCAGCGGTGGCACGAACATCTGCACCTTGACC > NC_002947/2659925‑2660205 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |