New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3688734 = | 57 (1.080) | 4 (0.080) | 4/234 | NT | 6.8% | coding (808/1107 nt) | PP_3253 | carboxylate‑amine ligase |
? | NC_002947 | 3688800 = | 56 (1.120) | coding (874/1107 nt) | PP_3253 | carboxylate‑amine ligase |
CCGGCCTTCGCGGCGCTATCCGACAGTGGAGTTGCGCATCTGCGATGGCTGCCCGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCAAGGCTGGCTCGCCCAACTGCAGGCCCAGATACCCATAGACAGCGC > NC_002947/3688586‑3688879 | attgctgatcggcatgggtaccatggcgcagcacgtgcagggcgtgctggcaggcgcgctcggcgtccgcgctgtctatgggtatctgggcctgcagttgggcgagccagccttgcgccgtgaccggctgctgctcgtgacaacctatGa < 2:838386‑M1/2‑1 (MQ=255) gcggatcggcatgggtaccatggcgcagcacgtgcagggcgtgctggcaggcgcgctcggcgtccgcgctgtctatgggtatctgggcctgcagttgggcgagccagccttgcgccgtgaccggctgctgctcgtgacaacctatGAAtt < 1:1423277‑M1/5‑1 (MQ=255) cTTCGCGGCGCTATCCGACAGTGGAGTTGCGCATCTGCGATGGCTGCCCGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTgc > 1:493514/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGCGCTATCCAGCGCGGGTTTTGCGCATCTGCGATGGCTGCCCGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTgcg < 2:937981/150‑1 (MQ=255) cgcTATCCGACAGTGGAGTTGCGCATCTGCGATGGCTGCCCGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATc < 1:134800/150‑1 (MQ=255) ccGACAGTGGAGTTGCGCATCTGCGATGGCTGCCCGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAg < 2:391100/150‑1 (MQ=255) ccGACAGTGGAGTTGCGCATCTGCGATGGCTGCCCGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAg < 2:426180/150‑1 (MQ=255) ccGACAGTGGAGTTGCGCATCTGCGATGGCTGCCCGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAg > 1:426180/1‑150 (MQ=255) cGACAGTGGAGTTGCGCATCTGCGATGGCTGCCCGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAgg > 2:1114775/1‑150 (MQ=255) gACAGTGGAGTTGCGCATCTGCGATGGCTGCCCGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGga < 1:1120997/150‑1 (MQ=255) aGTGGAGTTGCGCATCTGCGATGGCTGCCCGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAAtt > 2:400898/1‑129 (MQ=255) aGTGGAGTTGCGCATCTGCGATGGCTGCCCGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAAtt < 1:400898/129‑1 (MQ=255) aGTGGAGTTGCGCATCTGCGATGGCTGCCCGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGaa > 1:299289/1‑150 (MQ=255) gTTGCGCATCTGCGATGGCTTCCCGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTg < 1:1036683/150‑1 (MQ=255) gcATCTGCGATGGCTGCCCGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTg > 2:775724/1‑150 (MQ=255) gcagggcgtgctggcaggcgcgctcggcgtccgcgctgtctatgggtatctgggcctgcagttgggcgagccagccttgcgccgtgaccggctgctgctcgtgacaacctatGAAtt > 2:842915‑M1/113‑117 (MQ=255) gcagggcgtgctggcaggcgcgctcggcgtccgcgctgtctatgggtatctgggcctgcagttgggcgagccagccttgcgccgtgaccggctgctgctcgtgacaacctatGAAtt < 1:842915‑M1/5‑1 (MQ=255) tGCGATGGCTGCCCGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATg > 1:509036/1‑150 (MQ=255) gATGGCTGCCCGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATgcgc < 2:509036/150‑1 (MQ=255) ggcaggcgcgctcggcgtccgcgctgtctatgggtatctgggcctgcagttgggcgagccagccttgcgccgtgaccggctgctgctcgtgacaacctatGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATgg < 2:1142084‑M1/50‑1 (MQ=255) tGCCCGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATggg > 2:449767/1‑150 (MQ=255) tGCCCGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATggg > 2:1169667/1‑150 (MQ=255) gCCCGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCATACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGgc < 1:449767/150‑1 (MQ=255) ccGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGgcgc < 1:609051/150‑1 (MQ=255) aaGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATgc < 1:752025/129‑1 (MQ=255) aaGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATgc > 2:752025/1‑129 (MQ=255) aGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACACtt > 1:1325001/1‑150 (MQ=255) tCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAgg < 2:1354249/150‑1 (MQ=255) tgtgCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGtt < 2:354455/150‑1 (MQ=255) ctgtctatgggtatctgggcctgcagttgggcgagccagccttgcgccgtgaccggctgctgctcgtgacaacctatGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGtt > 1:1142084‑M1/78‑150 (MQ=255) tgCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGt > 1:124215/1‑150 (MQ=255) caCTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTg > 2:1373599/1‑97 (MQ=255) caCTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTg < 1:1373599/97‑1 (MQ=255) caCTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCATACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGagcagc < 2:794375/150‑1 (MQ=255) cTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGagcagcag > 2:186725/1‑150 (MQ=255) tGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGagcagcagc > 2:387757/1‑150 (MQ=255) aCCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACgg > 2:636627/1‑150 (MQ=255) cTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCATNCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACgaag > 1:468013/1‑147 (MQ=255) cTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCTATCTCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGgcg > 1:728597/1‑150 (MQ=255) cTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCAc < 2:1164383/129‑1 (MQ=255) cTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCAc > 1:1164383/1‑129 (MQ=255) ggTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGcc < 2:557959/138‑1 (MQ=255) ggTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGcc > 1:557959/1‑138 (MQ=255) gTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCaa < 2:493514/150‑1 (MQ=255) aaCACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCAAggct < 2:299289/150‑1 (MQ=255) agccttgcgccgtgaccggctgctgctcgtgacaacctatGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAg < 1:722379‑M1/70‑1 (MQ=255) agccttgcgccgtgaccggctgctgctcgtgacaacctatGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAg > 2:722379‑M1/41‑110 (MQ=255) aGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCAAGGCTGGCTc < 1:1114775/150‑1 (MQ=255) cATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCCTGCCACATGGGCACCCCACAATGTGTAAAGGTTGTCACTAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCAAGGCTGGCTCGc < 1:387757/150‑1 (MQ=255) aTTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACaa < 1:755234/99‑1 (MQ=255) aTTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACaa > 2:755234/1‑99 (MQ=255) gCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGagcagta > 2:120390/1‑117 (MQ=255) gCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGagcagca < 1:120390/119‑1 (MQ=255) ccTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCAAGGCTGGCTCGCCCAAc > 1:821870/1‑150 (MQ=255) cTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCAAGGCTGGCTCGCCCAACt > 2:947473/1‑150 (MQ=255) tACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTc > 1:1018710/1‑106 (MQ=255) tACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTc > 1:1018817/1‑106 (MQ=255) tACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTc < 2:1018710/106‑1 (MQ=255) tACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTc < 2:1018817/106‑1 (MQ=255) cGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCAAGGCTGGCTCGCCCAACTGCAg < 1:636627/150‑1 (MQ=255) cGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGCTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCAAGGCTGGCTCGCCCAACTGCAg > 2:779314/1‑150 (MQ=255) cATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCAAGGCTGGCTCGCCCAACTGCAGGcc > 2:800190/1‑150 (MQ=255) cATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGACCCGGAGTCCTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCAAGGCTGGCTCGCCCAACTGCAGGcc > 1:249151/1‑150 (MQ=255) ccGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCAAGGCTGGCTCGCCCAACTGCAGGCCCAGATa > 2:615521/1‑150 (MQ=255) ccGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCAAGGCTGGCTCGCCCAACTGCAGGCCCAGATa > 1:725018/1‑150 (MQ=255) cTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCAAGGCTGGCTCGCCCAACTGCAGGCCCAGATAccc < 2:336362/150‑1 (MQ=255) cccTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCAAGGCTGGCTCGCCCAACTGCAGGCCCAGATACCCATa > 2:16624/1‑150 (MQ=255) tccgatctGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCAAGGCTGGCTCGCCCAACTGCAGGCCCAGATACCCATAGACa > 1:305900‑M1/9‑150 (MQ=255) ccGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCTATGCGCCATGGGGGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCAAGGCTGGCTCGCCCAACTGCAGGCCCAGATACCCATAGACAgcgc > 2:1118961/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGgc > 2:1319697/1‑56 (MQ=255) ccGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGgc < 1:1319697/56‑1 (MQ=255) ccGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCAAGGCTGGCTCGCCCAACTGCAGGCCCAGATAccc > 2:350214/1‑139 (MQ=255) ccGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCAAGGCTGGCTCGCCCAACTGCAGGCCCAGATAccc < 1:350214/139‑1 (MQ=255) ccGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCAAGGCTGGCTCGCCCAACTGCAGGCCCAGATACCCATAGACAgcgc > 2:876698/1‑150 (MQ=255) | CCGGCCTTCGCGGCGCTATCCGACAGTGGAGTTGCGCATCTGCGATGGCTGCCCGAATCTGGAAGACGTTCTGTGCATTGCAGCACTGTTTCGCCACCTGGTTGAACACAGCATTGCCTACCGCCATGACCCGCTACCCTGCAGCCGCGAATTGCGCTGGATCGCCCAGGAGAACTACTGGCGTGCCATGCGCCATGGGCGCCACGCACAATTCATAGGTTGTCACGAGCAGCAGCCGGTCACGGCGCAAGGCTGGCTCGCCCAACTGCAGGCCCAGATACCCATAGACAGCGC > NC_002947/3688586‑3688879 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |