| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3989550 = | 50 (0.950) | 3 (0.060) | 3/232 | NT | 5.7% | coding (2024/2085 nt) | oplA | 5‑oxoprolinase A |
| ? | NC_002947 | 3989597 = | 52 (1.050) | coding (2071/2085 nt) | oplA | 5‑oxoprolinase A | |||||
CACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCGGGCGGTTCGTACAATAACAAGA > NC_002947/3989404‑3989694 | agagggcagcattgaaaaaaggaactgcaggcaagctactcaagcagctcttgttattgtacgaaccgcccggcagcgcaaaactgccgggcggttatcaggcccatgatcggcgcgcgccgaccgcaagatcaacccccgcgtgtCAcc > 1:1024983‑M1/147‑150 (MQ=255) aCCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCAccc < 1:1073047/150‑1 (MQ=255) gggcagaatggaaaaaaggaactgcaggcaagctactcaagcagctcttgttattgtacgaaccgcccggcagcgcaacactgccgggcggttatcaggcccatgatcggcgcgcgccgaccgcaagatcaacccccgcgtgtCACCCgg > 2:148943‑M1/144‑150 (MQ=255) gcgcAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGCTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGc < 1:444412/150‑1 (MQ=255) aaTCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGc > 1:890924/1‑150 (MQ=255) aTCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGGCGGTGAATAGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACGACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCa < 2:1155294/150‑1 (MQ=255) tccgtccgCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCAGCCGGGTGGCAg < 2:1121681/150‑1 (MQ=255) tccgCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTc < 2:712919/150‑1 (MQ=255) gCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGcc > 1:771639/1‑150 (MQ=255) ccGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTg > 1:48564/1‑150 (MQ=255) ccGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCt > 1:566687/1‑150 (MQ=255) ccGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGGTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCCGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCt > 1:1179685/1‑150 (MQ=255) cGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTa > 2:802107/1‑150 (MQ=255) ggTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCgg < 2:1299753/150‑1 (MQ=255) tGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGt < 2:890924/150‑1 (MQ=255) cagctcttgttattgtacgaaccgcccggcagcgcaaaactgccgggcggttatcaggcccatgatcggcgcgcgccgaccgcaagatcaacccccgcgtgtCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGa > 1:1353588‑M1/103‑150 (MQ=255) aTGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGac < 2:48564/150‑1 (MQ=255) ggCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGa < 2:905994/124‑1 (MQ=255) ggCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGa > 1:905994/1‑124 (MQ=255) cAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACAcgc < 1:802107/150‑1 (MQ=255) ccacttttCAACGTCAACCACTTGCTGCATGAGCAGACCGTGCATGGCCCCGGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGa < 2:233952/144‑1 (MQ=255) cGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGa > 2:855897/1‑149 (MQ=255) cGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGa < 1:855897/149‑1 (MQ=255) cGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGAt > 1:870439/1‑150 (MQ=255) tgtTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCtt < 2:452506/150‑1 (MQ=255) ttCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGt < 1:949017/128‑1 (MQ=255) ttCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGt > 2:949017/1‑128 (MQ=255) ttCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGCGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGc < 1:87276/150‑1 (MQ=255) aCGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTAc > 1:1227975/1‑119 (MQ=255) aCGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTAc < 2:1227975/119‑1 (MQ=255) aCGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTc > 2:639952/1‑150 (MQ=255) aaCCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGGTTGATCTTGCGGTCgcct > 1:1074624/1‑147 (MQ=255) ccTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGcc > 2:1166447/1‑150 (MQ=255) tGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGCGGGGGGTTGATCTTGCGGTCGcctcgcgctt < 2:1074624/150‑3 (MQ=255) cTGGGCCGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATgg > 2:88563/1‑150 (MQ=255) aGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGa < 2:870439/150‑1 (MQ=255) ccGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATaa < 2:771639/150‑1 (MQ=255) cTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGtt < 2:566687/150‑1 (MQ=255) tgtgATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTg < 1:639952/150‑1 (MQ=255) cGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGc > 2:845748/1‑150 (MQ=255) ggAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCgg > 1:15706/1‑150 (MQ=255) gACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCGGGCgg > 2:1377547/1‑150 (MQ=255) agatcaacccccgcgtgtCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCgg > 2:60311‑M1/19‑62 (MQ=255) agatcaacccccgcgtgtCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCgg < 1:60311‑M1/44‑1 (MQ=255) caccaATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑ggg < 1:38504/73‑1 (MQ=255) caccaATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑ggg > 2:38504/1‑73 (MQ=255) accaATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTg > 2:653561/1‑83 (MQ=255) accaATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTg < 1:653561/83‑1 (MQ=255) accaATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCGGGCGGTTCGTa < 1:117524/150‑1 (MQ=255) accaATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCGGGCGGTTCGTa > 2:302207/1‑150 (MQ=255) caATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCGGGCGGTTCGTACa > 1:1158982/1‑150 (MQ=255) aaTATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCGGGCGGTTCGTACaa > 1:704965/1‑150 (MQ=255) aaTATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCGGGCGGTTCGTACaa > 1:384086/1‑150 (MQ=255) atatTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCGGGCGGTTCGTACAAt < 2:15706/150‑1 (MQ=255) tCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTgcgc < 2:202911/124‑1 (MQ=255) tCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTgcgc > 1:202911/1‑124 (MQ=255) ccTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCGGGCGGTTCGTACAATAACAaga < 2:384086/150‑1 (MQ=255) cTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGgc > 1:92556/1‑79 (MQ=255) cTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGgc < 2:92556/79‑1 (MQ=255) cTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCa > 1:1199365/1‑113 (MQ=255) cTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCa < 2:1199365/113‑1 (MQ=255) tGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATg > 2:1267954/1‑92 (MQ=255) tGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATg < 1:1267954/92‑1 (MQ=255) | CACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCAATATTGTCCTGCCACCCGGCTGGCAGGCTCGCCTGGAGCCTTCGGCCACCTACCGGGTGACACGC‑GGGGGTTGATCTTGCGGTCGGCGCGCGCCGATCATGGGCCTGATAACCGCCCGGCAGTTTTGCGCTGCCGGGCGGTTCGTACAATAACAAGA > NC_002947/3989404‑3989694 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |