New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4239756 = | 64 (1.220) | 4 (0.080) | 4/238 | NT | 5.7% | coding (578/900 nt) | PP_3717 | LuxR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 4239815 = | 70 (1.380) | coding (519/900 nt) | PP_3717 | LuxR family transcriptional regulator |
ATCATGTGCGCCACTTCCCGTTCGCGGTCGGTCAGCACCTGGCAGCCGAAGCTGTCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTCGACGATGTAGTAGCTGTCTTCACTGCAACCTGTACCCAGGTAATAGGCC > NC_002947/4239609‑4239905 | ttctaccacctgcaggaaatcgcccccgacaacttcttcgacagcgactactacaaggcctattacctgggtacaggttgcagtgaagacagctactacatcgtcgacatcagcgcaggccgcaagctgtcgctgagcctgttccagGGc < 1:1221325‑M1/3‑1 (MQ=255) tCATGTGCGCCACTTCCCGTTCGCGGTCGGTCAGCACCTGGCAGCCGAAGCTGTCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCt > 2:142861/1‑150 (MQ=255) tgCGCCACTTCCCGTTCGCGGTCGGTCAGCACCTGGCAGCCGAAGCTGTCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAgc > 2:1353366/1‑150 (MQ=255) cgcCACTTCCCGTTCGCGGTCGGTCAGCACCTGGCAGCCGAAGCTGTCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAgcgc < 1:814757/150‑1 (MQ=255) ccACTTCCCGTTCGCGGTCGGTCAGCACCTGGCAGCCGAAGCTGTCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGcgcac > 1:483954/1‑150 (MQ=255) ccACTTCCCGTTCGCGGTCGGTCAGCACCTGGCAGCCGAAGCTGTCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGcgcac > 2:35113/1‑150 (MQ=255) aCTTCCCGTTCGCGGTCGGTCAGCACCTGGCAGCCGAAGCTGTCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGcgcacgc > 1:990909/1‑150 (MQ=255) cccGTTCGCGGTCGGTCAGCACCTGGCAGCCGAAGCTGTCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACa > 2:365683/1‑150 (MQ=255) cccGTTCGCGGTCGGTCAGCACCTGGCAGCCGAAGCTGTCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTACAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGAACGCACCa > 1:1364949/1‑150 (MQ=255) ccGTTCGCGGTCGGTCAGCACCTGGCAGCCGAAGCTGTCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAg < 1:1283052/150‑1 (MQ=255) ccGTTCGCGGTCGGTCAGCACCTGGCAGCCGAAGCTGTCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAg > 2:75136/1‑150 (MQ=255) ccGTTCGCGGTCGGTCAGCACCTGGCAGCCGAAGCTGTCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAg > 1:242007/1‑150 (MQ=255) atcgcccccgacaacttcttcgacagcgactactacaaggcctattacctgggtacaggttgcagtgaagacagctactacatcgtcgacatcagcgcaggccgcaagctgtcgctgagcctgttccagGGCTCCAGCGCACGCAACAgg < 2:1137931‑M1/21‑1 (MQ=255) cgcgGTCGGTCAGCACCTGGCAGCCGAAGCTGTCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGa < 1:1353366/150‑1 (MQ=255) gtcggtcAGCACCTGGCAGCCGAAGCTGTCGAAGGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTg > 2:145573/1‑150 (MQ=255) cTGGCAGCCGAAGCTGTCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAg < 1:1192198/150‑1 (MQ=255) cAGCCGAAGCTGTCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGgcgc < 1:142861/150‑1 (MQ=255) gCCGAAGCTGTCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGt > 1:793190/1‑150 (MQ=255) aaGCTGTCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCg < 2:1096952/150‑1 (MQ=255) actacaaggcctattacctgggtacaggttgcagtgaagacagctactacatcgtcgacatcagcgcaggccgcaagctgtcgctgagcctgttccagGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGc > 1:1137931‑M1/99‑150 (MQ=255) gCTGTCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCt > 1:781473/1‑150 (MQ=255) gTCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCa > 2:285323/1‑150 (MQ=255) tCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGt < 2:757141/115‑1 (MQ=255) tCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGt > 1:757141/1‑115 (MQ=255) cGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGACCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTg < 1:75136/150‑1 (MQ=255) tgcAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGc < 1:982746/116‑1 (MQ=255) tgcAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGc > 2:982746/1‑116 (MQ=255) tgcAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAAAAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAgg > 1:189628/1‑150 (MQ=255) gcAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGc < 1:285323/150‑1 (MQ=255) gCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAg > 1:1278440/1‑150 (MQ=255) cgcgCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACa > 2:503257/1‑150 (MQ=255) cgcTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTTCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGc < 1:1107564/150‑1 (MQ=255) cTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCtt > 1:1081644/1‑150 (MQ=255) tCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAgg > 1:535563/1‑87 (MQ=255) tCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAgg < 2:535563/87‑1 (MQ=255) gTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAgg > 1:552749/1‑132 (MQ=255) gTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAgg < 2:552749/132‑1 (MQ=255) ttGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGc > 1:274328/1‑150 (MQ=255) gacagctactacatcgtcgacatcagcgcaggccgcaagctgtcgctgagcctgttccagGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAgg > 2:389146‑M1/61‑129 (MQ=255) gacagctactacatcgtcgacatcagcgcaggccgcaagctgtcgctgagcctgttccagGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAgg < 1:389146‑M1/69‑1 (MQ=255) gATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCt < 2:680846/150‑1 (MQ=255) tGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCCGCCCTGGAACAgg > 1:1311387/1‑127 (MQ=255) tGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAgg < 2:1311387/127‑1 (MQ=255) tGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTgc > 1:937633/1‑150 (MQ=255) aGCGCGCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCt > 2:713636/1‑150 (MQ=255) aGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCt > 2:842328/1‑150 (MQ=255) cgcCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGa < 2:483954/150‑1 (MQ=255) gcCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGa > 1:401472/1‑129 (MQ=255) gcCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGa < 2:401472/129‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTgcgc < 2:633387/143‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTgcgc > 1:633387/1‑143 (MQ=255) gTTCCAGGTGGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTcga < 2:468113/150‑1 (MQ=255) ttCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTcgac < 2:62236/150‑1 (MQ=255) aGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTCGACGATg > 1:843400/1‑150 (MQ=255) gTTGTGGCGGGCATAACGCCCGAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCCACAGGTGGACTTGCCCGGCGTGCAGGTGCGTGCCGCTGCAGCTCGGGAATAGGTTCTACGACACCTTTCGGTGGGGGCTGATGTCGAAGATgta < 2:316986/150‑1 (MQ=255) ttGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTCGACGATgtag < 1:503257/150‑1 (MQ=255) ttGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTCGACGATgtag < 2:452658/150‑1 (MQ=255) tgtCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTCGACGATGtagtag < 2:990909/150‑1 (MQ=255) tCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTCGACGATGTAGTAGCt > 1:419676/1‑150 (MQ=255) gggCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGccc > 2:1333304/1‑92 (MQ=255) gggCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGccc < 1:1333304/92‑1 (MQ=255) cATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTCGACGATGTAGTAGCTGTCtt < 1:227924/150‑1 (MQ=255) tAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTCGACGATGTAGTAGCTGTCTTCa > 2:743109/1‑150 (MQ=255) tAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTCGACGATGTAGTAGCTGTCTTCa < 1:870491/150‑1 (MQ=255) ccccAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTCGACGATGTAGTAGCTGTCTTCACTGCa < 1:502575/150‑1 (MQ=255) ccccAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTCGACGATGTAGTAGCTGTCTTCACTGCa < 2:419676/150‑1 (MQ=255) agcagTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTCGACGATGtagtag > 1:1283205/1‑132 (MQ=255) agcagTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTCGACGATGtagtag < 2:1283205/132‑1 (MQ=255) agcagTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTCGACGATGTAGTAGCTGTCTTCACTGCAACCt < 2:781473/150‑1 (MQ=255) agTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTCGACGATGTAGTAGCTGTCTTCACTGCAACCTGTa < 2:242007/150‑1 (MQ=255) GGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTCGACGATgtagta < 2:73609‑M1/113‑1 (MQ=255) GGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTCGACGATgtagta > 1:73609‑M1/1‑113 (MQ=255) GGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTCGACGATGTAGTAGCTGTCTTCACTGCAACCTGTACCCAGGTAATAGGcc < 1:47759‑M1/150‑1 (MQ=255) | ATCATGTGCGCCACTTCCCGTTCGCGGTCGGTCAGCACCTGGCAGCCGAAGCTGTCGAACGCTGCCTGCAGGCTGCCGCGCTCGGTTGATGCAGCGCCCGGTTCCAGGTTGTGTCGGGCATAACGCCCCAGCAGTTCGCGCACCATCGGCTCCAGCGCACGCAACAGGTCGACCTGCCCGGCGTTCAGGCGCGTGCCGCTGCAGCCCTGGAACAGGCTCAGCGACAGCTTGCGGCCTGCGCTGATGTCGACGATGTAGTAGCTGTCTTCACTGCAACCTGTACCCAGGTAATAGGCC > NC_002947/4239609‑4239905 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |