| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4442308 = | 77 (1.460) | 7 (0.140) | 6/236 | NT | 9.0% | coding (267/1293 nt) | nicP‑II | porin‑like protein |
| ? | NC_002947 | 4442332 = | 67 (1.330) | coding (243/1293 nt) | nicP‑II | porin‑like protein | |||||
TCGGTTTGCGACACCTTGAACTTGATCGCCGCACCCAGGCGGCTGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGGCGCCCTTGATATCGGCATAGTCGCGGCTGAAGAAGTAATTGCGCGCCTGCAGCGTGGCG > NC_002947/4442159‑4442455 | aggccggtttcatcgaaggtgcccgcgccacgctgcaggcgcgcaattacttcttcagccgcgactatgccgatatcaagggcgccagcacccagtcgcgcacccaggaatgggcgcaggggtttatcctcaatgccagctccgtttata < 2:442072‑M1/1‑1 (MQ=255)aggccggtttcatcgaaggtgcccgcgccacgctgcacgcgcgcaattacttcttcagccgcgactatgccgatatcaagggcgccagcacccagtcgcgcacccaggaatgggcgcaggggtttatcctcaatgccagctccggttata < 1:197077‑M1/1‑1 (MQ=255) gccggtttcatcgaaggtgcccgcgccacgctgcaggcgcgcaattacttcttcagccgcgactatgccgatatcaagggcgccagcacccagtcgcgcacccaggaatgggcgcaggggtttatcctcaatgccagctccggttatAcc < 2:430236‑M1/3‑1 (MQ=255) ttGCGACACCTTGAACTTGATCGCCGCACCCAGGCGGCTGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAACCCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCAc < 1:1015289/150‑1 (MQ=255) cGACACCTTGAACTTGATCGCCGCACCCAGGCGGCTGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCCGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGcc > 1:1390615/1‑150 (MQ=255) cTTGAACTTGATCGCCGCACCCAGGCGGCTGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCCCACCCACGCCAAGGGt > 2:369105/1‑150 (MQ=255) ttGAACTTGATCGCCGCACCCAGGCGGCTGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTg > 2:997820/1‑150 (MQ=255) ttGAACTTGATCGCCGCACCCAGGCGGCTGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTg > 1:594646/1‑150 (MQ=255) ttGAACTTGATCGCCGCACCCAGGCGGCTGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGCACGGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGTCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTg > 1:1027174/1‑150 (MQ=255) ttGATCGCCGCACCCAGGCGGCTGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCCCACCCACGCCAAGGGTGCCCTgg > 2:939789/1‑150 (MQ=255) ttGATCGCCGCACCCAGGCGGCTGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCAc > 2:876525/1‑134 (MQ=255) ttGATCGCCGCACCCAGGCGGCTGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCAc < 1:876525/134‑1 (MQ=255) ttGATCGCCGCACCCAGGCGGCTGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTgg > 2:560285/1‑150 (MQ=255) ttGATCGCCGCACCCAGGCGGCTGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTgg < 1:389640/150‑1 (MQ=255) cccgcgccacgctgcaggcgcgcaattacttcttcagccgcgactatgccgatatcaagggcgccagcacccagtcgcgcacccaggaatgggcgcaggggtttatcctcaatgccagctccggttatACCCACGCCAAGGGTGCCCTgg > 1:613029‑M1/129‑150 (MQ=255) gccgcACCCAGGCGGCTGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATaa > 1:442072/1‑150 (MQ=255) ccgcACCCAGGCGGCTGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAAc < 2:940349/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGCTGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCt < 2:1376703/150‑1 (MQ=255) gcggcTGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGc > 1:1222161/1‑150 (MQ=255) gcTGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCAtt > 1:344547/1‑150 (MQ=255) tGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTGCGGGCTGCTGTCGACATTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCGTTgg > 1:1383929/1‑149 (MQ=255) tGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGa > 1:1368443/1‑150 (MQ=255) tGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGa < 2:1222161/150‑1 (MQ=255) tATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATTTTCCGCGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAgg > 2:1194368/1‑150 (MQ=255) gTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAg > 1:396337/1‑111 (MQ=255) gTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAg < 2:396337/111‑1 (MQ=255) gccgACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGa < 1:961457/142‑1 (MQ=255) gccgACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGa > 2:961457/1‑142 (MQ=255) ccgACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCACGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCt < 2:1027174/150‑1 (MQ=255) tttGCGGCTGTCCAGGCCGGGCAGCAACCCGGACCGGACATGTTCCTGGCTCCTGTCAAACTTGAAACGCAGCAGTCCTCTAGCATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTgcgc < 2:594646/149‑1 (MQ=255) ttGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGcc > 2:854840/1‑150 (MQ=255) cGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGa < 1:284497/129‑1 (MQ=255) cGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGa > 2:284497/1‑129 (MQ=255) cGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGCCGACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGCGGATAACCGGAGCTGGCATTGGGGATAAACCCCTGCGCCCAtt > 1:804574/1‑150 (MQ=255) cGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGATTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACACACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCAtt > 1:1328722/1‑150 (MQ=255) cGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGCCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGAAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTAGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCAtt > 2:197077/1‑150 (MQ=255) cGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGACATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCAtt > 2:1032073/1‑150 (MQ=255) gCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGa < 1:862714/128‑1 (MQ=255) gCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGa > 2:862714/1‑128 (MQ=255) cTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGATGCGGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTcc > 1:329630/1‑150 (MQ=255) tCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTgg > 2:730847/1‑150 (MQ=255) tCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTgg < 2:50500/150‑1 (MQ=255) ccgatatcaagggcgccagcacccagtcgcgcacccaggaatgggcgcaggggtttatcctcaatgccagctccggttatACCCACGCCAAGGGTGCCCTgg > 2:922620‑M1/81‑102 (MQ=255) ccgatatcaagggcgccagcacccagtcgcgcacccaggaatgggcgcaggggtttatcctcaatgccagctccggttatACCCACGCCAAGGGTGCCCTgg < 1:922620‑M1/22‑1 (MQ=255) cAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGt > 1:200027/1‑150 (MQ=255) cAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGt > 1:430236/1‑150 (MQ=255) cAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACACACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGt > 2:1114308/1‑150 (MQ=255) ggCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCCACCGGCCGGTAAAATCCAGACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTgc > 1:884443/1‑150 (MQ=255) tGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTggg < 1:314321/96‑1 (MQ=255) tGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTggg > 2:314321/1‑96 (MQ=255) tGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGa < 2:343510/106‑1 (MQ=255) tGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGa > 1:343510/1‑106 (MQ=255) cagcaACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTg > 2:10031/1‑150 (MQ=255) cccGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCt > 2:810251/1‑150 (MQ=255) ccGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTg > 2:554530/1‑150 (MQ=255) ggACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGgc < 2:1368443/150‑1 (MQ=255) acccagtcgcgcacccaggaatgggcgcaggggtttatcctcaatgccagctccggttatACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAAcc > 2:665421‑M1/61‑90 (MQ=255) acccagtcgcgcacccaggaatgggcgcaggggtttatcctcaatgccagctccggttatACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAAcc < 1:665421‑M1/30‑1 (MQ=255) ccagtcgcgcacccaggaatgggcgcaggggtttatcctcaatgccagctccggttatACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGtat < 1:1187396‑M1/26‑1 (MQ=255) ccagtcgcgcacccaggaatgggcgcaggggtttatcctcaatgccagctccggttatACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGtat > 2:1187396‑M1/59‑84 (MQ=255) cGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGGCGccc > 2:1092800/1‑150 (MQ=255) gCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTgg > 2:265370/1‑75 (MQ=255) gCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTgg < 1:265370/75‑1 (MQ=255) cATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGGCGCCCTTGa < 1:560285/150‑1 (MQ=255) ttCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCGTTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGGCGCCCTTGATATc > 1:840515/1‑150 (MQ=255) ttCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATACACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGGCGCCCTTGATATc > 1:1193654/1‑150 (MQ=255) ccGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGGCGCCCTTGATATCgg < 1:730847/150‑1 (MQ=255) gctgctGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGGCGCCCTTGATATCGGCATa > 2:641007/1‑150 (MQ=255) ctgTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGGCGCCCTTGATATCGGCATAGTcg > 1:1220856/1‑150 (MQ=255) tgTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCTCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGGCGCCCTTGATATCGGCATAGTcgc < 1:1238807/150‑1 (MQ=255) 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cagcagGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGGCGCCCTTGATATCGGCATAGTCGCGGCTGAAGAAGTAAtt < 1:939789/150‑1 (MQ=255) agcagGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGGCGCCCTTGATATCGGCATAGTCGCGGCTGAAGAAGTAATTg > 2:808655/1‑150 (MQ=255) cGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTgg < 2:944306/95‑1 (MQ=255) cGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTgg > 1:944306/1‑95 (MQ=255) cGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGGCGCCCTTGATATCGGCATAGTCGCGGCTGAAGAAGTAATTGCGCGCCt < 1:369105/150‑1 (MQ=255) tAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGGCGCCCTTGATATCGGCATAGTCGCGGCTGAAGAAGTAATTGCGCGCCTGCa > 1:947717/1‑150 (MQ=255) cATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGGCGCCCTTGATATCGGCATAGTCGCGGCTGAAGAAGTAATTGCGCGCCTGCAGCg < 2:1390615/150‑1 (MQ=255) aTCCACGCCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGGCGCCCTTGATATCGGCATAGTCGCGGCTGAAGAAGTAATTGCGCGCCTGCAGCGt < 2:1220856/150‑1 (MQ=255) aTCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGGCGCCCTTGATATCGGCATAGTCGCgg < 2:852412/121‑1 (MQ=255) aTCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGGCGCCCTTGATATCGGCATAGTCGCgg > 1:852412/1‑121 (MQ=255) aTCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGGCGCCCTTGATATCGGCATAGGCGCGGCTGAAGAAGTAATTGCGCGCCTGCAGCGt > 2:363483/1‑150 (MQ=255) ccACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGcc < 2:1142937/65‑1 (MQ=255) ccACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGcc > 1:1142937/1‑65 (MQ=255) acacCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGGCGCCCTTGATATCGGCATAGTCGCGGCTGAAGAAGTAATTGCGCGCCTGCAGCGTGgcg > 2:1392894/1‑150 (MQ=255) | TCGGTTTGCGACACCTTGAACTTGATCGCCGCACCCAGGCGGCTGTATTCGTCCGCCGACTTGCCGCTGTCCAGGCTGGGCAGCAACCCGGACCGGGCATGTTCCGGGCTGCTGTCGAGCTTGAAACCCAGCAGGCCGGTAACATCCACACCCACGCCAAGGGTGCCCTGGGTATAACCGGAGCTGGCATTGAGGATAAACCCCTGCGCCCATTCCTGGGTGCGCGACTGGGTGCTGGCGCCCTTGATATCGGCATAGTCGCGGCTGAAGAAGTAATTGCGCGCCTGCAGCGTGGCG > NC_002947/4442159‑4442455 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |