New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4861173 = | 45 (0.860) | 13 (0.310) | 10/196 | NT | 25.1% | intergenic (‑79/+158) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
? | NC_002947 | 4861264 = | 42 (1.010) | intergenic (‑170/+67) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
GCACGTAGTAGCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCG > NC_002947/4861025‑4861320 | gCACGTAGTAGCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCGGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGC < 1:1079107‑M1/150‑1 (MQ=255) cACGTAGTAGCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCC > 1:874273‑M1/1‑150 (MQ=255) gtagCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCG > 2:524701‑M1/1‑150 (MQ=255) ccgcccagaccatcgagcactaccgccagcgtatcgtcgagttcgagcgccgtgcgctaacccagaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccaGCCTCTTcg < 1:689769‑M1/9‑1 (MQ=255) gCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGG < 2:655017‑M1/150‑1 (MQ=255) cccagaccatcgagcactaccgccagcgtatcgtcgagttcgagcgccgtgcgctaacccagaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccgGCCTCTTCGCgg > 1:988809‑M1/139‑150 (MQ=255) tgtgCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC > 1:474899‑M1/1‑150 (MQ=255) tcgagcactaccgccagcgtatcgtcgagttcgagcgccgtgcgctaacccagaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccgGCCTCTTCGCGGGTAAACCCg < 2:1279458‑M1/21‑1 (MQ=255) cgagcactaccgccagcgtatcgtcgagttcgagcgccgtgcgctaacccagaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccgGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc > 1:569713‑M1/129‑150 (MQ=255) tGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCC > 1:1205450‑M1/1‑150 (MQ=255) cactaccgccagcgtatcgtcgagttcgagcgccgtgcgctaacccagaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccaGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTccc > 2:689769‑M1/125‑150 (MQ=255) taccgccagcgtatcgtcgagttcgagcgccgtgcgctaacccagaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccgGCCTCTTcgc > 2:1052534‑M1/122‑131 (MQ=255) cTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGATCCCACAAggg > 1:772557/1‑150 (MQ=255) 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tgtgCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTAc < 1:74261/68‑1 (MQ=255) tgtgCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgc > 2:1328755‑M2/1‑73 (MQ=255) tgtgCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgc < 1:1328755‑M2/90‑18 (MQ=255) tgtgCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGctc > 1:422978/1‑150 (MQ=255) gtgCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGctct < 2:802783/150‑1 (MQ=255) ccAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTc < 2:422978/150‑1 (MQ=255) cAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCCCCTGCCCTAGGGCGGTGCTGGCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACACGCAACGACGATACCCGGACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCg > 2:72062/1‑150 (MQ=38) cAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTCGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCg > 2:1258875/1‑150 (MQ=255) cAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCg > 1:1098315/1‑150 (MQ=255) cAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCg > 2:1139165/1‑150 (MQ=255) GCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGa < 1:744551‑M1/56‑1 (MQ=255) GCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGa > 2:744551‑M1/1‑56 (MQ=255) | GCACGTAGTAGCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCG > NC_002947/4861025‑4861320 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |