| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4861197 | 51 (0.970) | 15 (0.360) | 9/196 | NT | 26.7% | intergenic (‑103/+134) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
| ? | NC_002947 | = 4861238 | 42 (1.010) | intergenic (‑144/+93) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA | |||||
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
TGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTT > NC_002947/4861048‑4861346 | tGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCC > 1:1205450‑M1/1‑150 (MQ=255) cactaccgccagcgtatcgtcgagttcgagcgccgtgcgctaacccagaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccaGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTccc > 2:689769‑M1/125‑150 (MQ=255) actaccgccagcgtatcgtcgagttcgagcgccgtgcgctaacccagaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccgGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCca < 1:708807‑M1/27‑1 (MQ=255) aTCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCta > 1:1299067‑M1/1‑148 (MQ=255) cTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGATCCCACAAggg > 1:772557/1‑150 (MQ=255) tCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGc > 1:631760/1‑150 (MQ=255) tCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGc < 1:220580/150‑1 (MQ=255) cACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTca < 2:725749/150‑1 (MQ=255) gTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGcc < 1:524701/150‑1 (MQ=255) ttCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGccc < 2:631760/150‑1 (MQ=255) tcgagttcgagcgccgtgcgctaacccagaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccgGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGccc < 2:829871‑M1/45‑1 (MQ=255) cgagcgccgtgcgctaacccagaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccgGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCg > 2:483665‑M1/99‑150 (MQ=255) tACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCgg < 2:979507/150‑1 (MQ=255) aCGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCTCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGt > 2:292224/1‑150 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGa > 1:934898/1‑150 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGa < 1:514229/150‑1 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGa < 1:1002462/150‑1 (MQ=255) tttCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCGCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCACACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGt > 2:19261/1‑150 (MQ=255) 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cagaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccgGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGc > 2:677482‑M1/80‑150 (MQ=255) agaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccgGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGgagag > 2:708807‑M1/79‑148 (MQ=255) agaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccgGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCg > 2:836394‑M1/79‑150 (MQ=255) gaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccgGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCgg > 1:1003749‑M1/78‑150 (MQ=255) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggt < 2:1279786‑M1/150‑51 (MQ=255) tcttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacc < 2:320709‑M2/150‑15 (MQ=255) tcttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTACCACAAGGGCGCCACATGCCCCAGGGCGCTGATGTACCTGTAggcgcgggtttacc < 2:38306‑M2/150‑15 (MQ=255) tctcTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgc > 2:1205450‑M2/1‑133 (MQ=255) tctcTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgc > 1:1318138‑M2/1‑133 (MQ=255) ctctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcg < 2:1135769‑M2/150‑19 (MQ=255) ctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCAAGGTCTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCACCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttaccagcgaa < 1:1330799‑M1/150‑62 (MQ=255) tGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaaga > 2:1298382‑M2/1‑128 (MQ=255) gcaaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagag > 1:404358‑M2/1‑127 (MQ=255) aagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgg < 2:443742‑M2/131‑8 (MQ=255) agcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGTGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGCGTCAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg < 1:38306/150‑1 (MQ=255) gcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGCGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg < 1:1366777/150‑1 (MQ=255) caaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCATGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGc > 1:802783/1‑150 (MQ=255) aaaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGca > 1:445009/1‑150 (MQ=255) gagcTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCaa < 2:1423190/149‑1 (MQ=255) cTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAacga > 1:146656/1‑150 (MQ=255) 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< 1:468636‑M1/150‑135 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgccgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaaga < 2:1028553‑M1/150‑137 (MQ=255) GGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCa > 2:106863‑M1/1‑150 (MQ=255) tAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagaca < 2:534937‑M1/150‑139 (MQ=255) TAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTATTTCGTCTGGATCTGTCAgc > 2:59673‑M1/1‑150 (MQ=255) aaCCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaa < 1:1298382‑M1/150‑141 (MQ=255) 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ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacac < 2:1208703‑M2/92‑45 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacagtcaacagacacct > 2:305627‑M2/1‑48 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacagtcaacagacacct < 1:305627‑M2/94‑47 (MQ=255) CCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc < 1:1253277‑M1/150‑1 (MQ=255) CTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTgg > 1:535567‑M1/1‑150 (MQ=255) tCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacac < 2:498637‑M2/88‑45 (MQ=255) ctacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttatccgcgaagaagctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgcttggcaagagaaggcgagttccatgac > 1:1130174‑M1/1‑1 (MQ=255) ctacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatcccatgac > 1:1102775‑M1/1‑1 (MQ=255) ctacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatcccatgac > 2:964721‑M1/1‑1 (MQ=255) CCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTAc > 1:646047‑M1/1‑55 (MQ=255) CCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACTGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTggg < 2:1116849‑M1/148‑1 (MQ=255) CCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCgg > 2:335812‑M1/1‑97 (MQ=255) CCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTggg > 1:1116849‑M1/1‑148 (MQ=255) CCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGtt < 2:288628‑M1/150‑1 (MQ=255) | TGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTT > NC_002947/4861048‑4861346 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |