| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5159824 | 49 (0.930) | 12 (0.310) | 10/184 | NT | 21.9% | intergenic (+39/+67) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 5159839 | 49 (1.250) | intergenic (+54/+52) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
AAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCT > NC_002947/5159678‑5159973 | aaGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAg < 2:935960/150‑1 (MQ=255) gggCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgata > 1:35319‑M1/1‑144 (MQ=255) gagcaaaTTGTCGAGAGTGTCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGtt < 2:605417/145‑1 (MQ=255) ggCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTc < 1:1011927/150‑1 (MQ=255) gCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagc > 1:875341‑M1/1‑142 (MQ=255) gTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCCCTacagc > 2:1223344/1‑146 (MQ=255) tCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGGGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACGAGACCAGAGGTTTTATCGTTGATTATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAAACAGGTTCGATATCGTt < 1:616024‑M2/150‑2 (MQ=255) tCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTt < 1:1212904‑M2/150‑2 (MQ=255) gagaGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgt < 1:1247291‑M1/150‑19 (MQ=255) gagaGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGACTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGGtgt < 1:1189825‑M2/150‑4 (MQ=255) gagTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtag < 2:729688‑M1/150‑21 (MQ=255) gagTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtag > 2:1212904‑M2/1‑145 (MQ=255) gCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcg > 2:2259‑M2/1‑140 (MQ=255) gCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcg > 1:594394‑M2/1‑140 (MQ=255) gCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcg < 2:518355‑M2/150‑11 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgg < 2:35319‑M1/150‑27 (MQ=255) ccACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCTGGGTCGATTGACACCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggt < 2:1257152‑M1/150‑29 (MQ=255) aGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacc < 2:875341‑M1/150‑34 (MQ=255) aGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgg < 2:289522‑M1/143‑27 (MQ=255) aGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgg > 1:289522‑M1/1‑117 (MQ=255) aGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg < 2:869867‑M2/139‑12 (MQ=255) aGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 1:869867‑M2/1‑128 (MQ=255) tGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGGCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaagg < 1:1179607‑M2/150‑29 (MQ=255) ggAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGc < 1:1138990/115‑1 (MQ=255) ggAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGc > 2:1138990/1‑115 (MQ=255) gAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggcc > 1:768033‑M2/1‑120 (MQ=255) caAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtag < 2:636560‑M2/119‑6 (MQ=255) caAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtag > 1:636560‑M2/1‑114 (MQ=255) aGGGCTGTATGCCCGGTTGTGCCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCGGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAgg < 1:947191/150‑1 (MQ=255) gggCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGCTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGTTCGCTATCGTTGTATGAGATGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGc < 2:779594/150‑1 (MQ=39) ggCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgg > 2:1219756‑M1/1‑95 (MQ=255) tGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGTTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCCAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAaca < 1:1226581/150‑1 (MQ=255) tGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTCTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTCCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGa > 2:816481/1‑150 (MQ=255) ccGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtct > 1:409095/1‑150 (MQ=255) ggTTGTGGCACCCCCTGTCCGGTGGTTTTGTCGGGGTCGATTGGCACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTAGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtctct < 2:638954/150‑1 (MQ=37) ggTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTAGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtctct < 1:1223344/150‑1 (MQ=255) ttGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCa < 1:518355/150‑1 (MQ=255) accaccAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggc < 2:48513‑M2/118‑30 (MQ=255) caGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggc > 1:7161‑M2/1‑84 (MQ=255) caGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggc < 2:7161‑M2/113‑30 (MQ=255) gACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAgg < 2:1179607/150‑1 (MQ=255) gACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAgg < 1:973170/150‑1 (MQ=255) gTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATc < 1:1412681/150‑1 (MQ=255) tCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGCTGACCGAACGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCcgc < 2:1405136/150‑1 (MQ=38) cGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCcgcg > 2:644948/1‑150 (MQ=255) gTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAg < 2:1368333/100‑1 (MQ=255) gTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAg > 1:1368333/1‑100 (MQ=255) gATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGCAAACCTCCACCCCGcccttcc > 2:305246/1‑145 (MQ=38) ttGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCaa > 1:1004375/1‑99 (MQ=255) ttGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCaa < 2:1004375/99‑1 (MQ=255) tggACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCgg > 2:950667/3‑150 (MQ=255) acCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccg < 2:27509‑M2/84‑32 (MQ=255) acCTGCG‑CGGCATTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAAGTTCTCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccg > 1:27509‑M2/1‑53 (MQ=255) ccTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAATTCGCTCATACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCGGCAAAAAGGCGGGCAGAGGCAACACAGATCTCTAAGTCCCGGCGGTAGGTTGACATCCACCGCGCCTCTTCTGCATAcc > 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< 1:1139146/150‑1 (MQ=255) gCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggt < 2:48513‑M1/118‑90 (MQ=255) gCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggt > 1:48513‑M1/1‑29 (MQ=255) gCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctg > 1:7161‑M1/1‑29 (MQ=255) ccTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCCAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGAccc < 1:644948/150‑1 (MQ=255) ccTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacccgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccc < 2:973170‑M1/150‑123 (MQ=255) ccTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCCCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGAccc > 2:1414103/1‑150 (MQ=255) 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ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcact < 2:289522‑M2/143‑118 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcact > 1:289522‑M2/1‑26 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcc < 1:1219756‑M2/121‑96 (MQ=255) cGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgc > 2:2259‑M1/1‑10 (MQ=255) cGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgc > 1:594394‑M1/1‑10 (MQ=255) gCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccggcacaggtgtcaatcgacccagacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgc > 1:1257152‑M2/1‑24 (MQ=255) cTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactc > 2:1212904‑M1/1‑5 (MQ=255) cTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttg < 2:636560‑M1/119‑115 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactc < 2:729688‑M2/150‑131 (MQ=255) acaccgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaagtccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactctc < 1:1189825‑M1/150‑148 (MQ=255) acacAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactctc < 1:1247291‑M2/150‑133 (MQ=255) aacgatatcgaacctgtttaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaataatcaacgataaaacctctggtctcgtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgccccagcaactcactgtggctgccactctcga < 1:616024‑M1/150‑150 (MQ=255) aacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactctcga < 1:1212904‑M1/150‑150 (MQ=255) aacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaa < 1:637387‑M1/42‑42 (MQ=255) | AAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCG‑CGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCT > NC_002947/5159678‑5159973 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |