| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5159824 | 49 (0.930) | 12 (0.310) | 10/184 | NT | 21.9% | intergenic (+39/+67) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 5159839 | 49 (1.250) | intergenic (+54/+52) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein | |||||
TCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCACCGCCCGCCGCA > NC_002947/5159691‑5159988 | tCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGGGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACGAGACCAGAGGTTTTATCGTTGATTATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAAACAGGTTCGATATCGTt < 1:616024‑M2/150‑2 (MQ=255)tCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTt < 1:1212904‑M2/150‑2 (MQ=255) gagaGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGACTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGGtgt < 1:1189825‑M2/150‑4 (MQ=255) gagTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtag > 2:1212904‑M2/1‑145 (MQ=255) gCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcg > 1:594394‑M2/1‑140 (MQ=255) gCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcg > 2:2259‑M2/1‑140 (MQ=255) gCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcg < 2:518355‑M2/150‑11 (MQ=255) aGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg < 2:869867‑M2/139‑12 (MQ=255) aGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 1:869867‑M2/1‑128 (MQ=255) tGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGGCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaagg < 1:1179607‑M2/150‑29 (MQ=255) gggaGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaagg < 2:973170‑M2/149‑29 (MQ=255) gAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggcc > 1:768033‑M2/1‑120 (MQ=255) caAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtag < 2:636560‑M2/119‑6 (MQ=255) caAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtag > 1:636560‑M2/1‑114 (MQ=255) aGGGCTGTATGCCCGGTTGTGCCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCGGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAgg < 1:947191/150‑1 (MQ=255) gggCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGCTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGTTCGCTATCGTTGTATGAGATGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGc < 2:779594/150‑1 (MQ=39) tGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGTTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCCAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAaca < 1:1226581/150‑1 (MQ=255) tGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTCTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTCCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGa > 2:816481/1‑150 (MQ=255) ccGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtct > 1:409095/1‑150 (MQ=255) ggTTGTGGCACCCCCTGTCCGGTGGTTTTGTCGGGGTCGATTGGCACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTAGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtctct < 2:638954/150‑1 (MQ=37) ggTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTAGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtctct < 1:1223344/150‑1 (MQ=255) ttGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCa < 1:518355/150‑1 (MQ=255) accaccAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggc < 2:48513‑M2/118‑30 (MQ=255) accaccAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggc > 1:48513‑M2/1‑89 (MQ=255) ccaccaGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTCTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTCCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCcggc < 1:816481/150‑1 (MQ=255) caGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggc > 1:7161‑M2/1‑84 (MQ=255) caGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggc < 2:7161‑M2/113‑30 (MQ=255) gACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAgg < 2:1179607/150‑1 (MQ=255) gACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAgg < 1:973170/150‑1 (MQ=255) gTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATc < 1:1412681/150‑1 (MQ=255) tCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGCTGACCGAACGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCcgc < 2:1405136/150‑1 (MQ=38) cGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCcgcg > 2:644948/1‑150 (MQ=255) ggggTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGATTCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCgcgc > 1:685462/1‑150 (MQ=255) gTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAg > 1:1368333/1‑100 (MQ=255) gTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAg < 2:1368333/100‑1 (MQ=255) gATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGCAAACCTCCACCCCGcccttcc > 2:305246/1‑145 (MQ=38) ttGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCaa > 1:1004375/1‑99 (MQ=255) ttGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCaa < 2:1004375/99‑1 (MQ=255) tggACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCgg > 2:950667/3‑150 (MQ=255) acCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccg < 2:27509‑M2/84‑32 (MQ=255) acCTGCGCGGCATTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAAGTTCTCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccg > 1:27509‑M2/1‑53 (MQ=255) ccTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAATTCGCTCATACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCGGCAAAAAGGCGGGCAGAGGCAACACAGATCTCTAAGTCCCGGCGGTAGGTTGACATCCACCGCGCCTCTTCTGCATAcc > 1:1297479/1‑150 (MQ=255) cTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg < 1:915434‑M2/62‑12 (MQ=255) cTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 2:915434‑M2/1‑51 (MQ=255) cTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtctct < 1:655000/103‑1 (MQ=255) cTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtctct > 2:655000/1‑103 (MQ=255) gcgGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATAGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTg > 1:968803/1‑150 (MQ=255) ggCCTTTTCGCGGGTAACCCCGCGCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGAc < 1:305246/150‑1 (MQ=255) ggCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGAc < 1:1139146/150‑1 (MQ=255) ccTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCCAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGAccc < 1:644948/150‑1 (MQ=255) ccTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCCCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGAccc > 2:1414103/1‑150 (MQ=255) ttttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTt < 1:637387‑M2/42‑2 (MQ=255) ttttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTt > 2:637387‑M2/1‑41 (MQ=255) ttttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCATCACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATAc > 2:452644/1‑138 (MQ=255) ttttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCATCACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATAc < 1:452644/138‑1 (MQ=255) ttttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAg < 2:1295901/108‑1 (MQ=255) ttttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAg > 1:1295901/1‑108 (MQ=255) ttttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCt > 2:1001659/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTc < 1:1001659/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCATACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGTAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTc < 2:685462/150‑1 (MQ=255) ggTAAAGCTCCTCCAACAGATGTTGGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTc < 2:1297479/150‑1 (MQ=38) ggTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcact < 2:875341‑M2/150‑118 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAg > 1:441681/1‑69 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAg < 2:441681/69‑1 (MQ=255) ccccGCTCCTACGATGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgca < 2:968803/149‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccggcacaggtgtcaatcgacccagacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtgg < 2:1257152‑M2/150‑123 (MQ=255) cccGTTCCTACTCAGGTTCGATATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgcag < 2:409095/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGGTCCTgcag > 1:929748/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctg < 2:35319‑M2/150‑125 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcact > 1:289522‑M2/1‑26 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcact < 2:289522‑M2/143‑118 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcc > 2:1219756‑M2/1‑26 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcc < 1:1219756‑M2/121‑96 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCAGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCTCCTCTTCGGCATACCCCTTAACACCTTCCCGTTCCTgcagc > 2:109441/1‑150 (MQ=39) cGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgcagca < 2:85136/150‑1 (MQ=255) gCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccggcacaggtgtcaatcgacccagacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgc > 1:1257152‑M2/1‑24 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactc < 2:729688‑M2/150‑131 (MQ=255) acacAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactctc < 1:1247291‑M2/150‑133 (MQ=255) cacaGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAAtcc > 1:1425109/1‑150 (MQ=255) gCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactctcgacaattcgc > 1:875341‑M2/1‑8 (MQ=255) gCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgca > 2:389076/1‑130 (MQ=255) gCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgca < 1:389076/130‑1 (MQ=255) cTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCCCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCAccgccc > 2:923982/1‑150 (MQ=255) tATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactctcgacaattcgccc > 1:35319‑M2/1‑6 (MQ=255) tATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGAAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCAccgcccg > 2:911566/1‑150 (MQ=255) ttGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCACCGCCCGCCGCa > 1:187192/1‑150 (MQ=255) | TCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCACCGCCCGCCGCA > NC_002947/5159691‑5159988 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |