New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5611532 | 72 (1.370) | 8 (0.160) | 7/240 | NT | 10.3% | coding (475/1176 nt) | PP_4931 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 5611554 | 69 (1.350) | coding (497/1176 nt) | PP_4931 | hypothetical protein |
GGCAACCTCACAAGCTTCTTCGCCAGCAAGGCCGTGCGCGGCCGGGTCGACCAGGTCAAGGGTGACCAGTTGCCACCGGCACTGCAGGACCGCGCGTTCAAGGGCAAGGTGTACCGCCTGGCGGAACTGGTGGTCGATGTCCCGAGCCTGCT‑GGCCAACCTGGCCGAGCTGGCCGGCGAGTCCTTGCTGGCAGGTGAACGCATCGAACCCTTGCGTGAAGGTAATGCGTTGGTCGGCCTGCGCGTGGACGACCGGGAAATCCGTGCCCAACGCATCGTATTGAGCGCCGGAGCCGGCA > NC_002947/5611385‑5611682 | ggCAACCTCACAAGCTTCTTCGCCAGCAAGGCCGTGCGCGGCCGGGTCGACCAGGTCAAGGGTGACCAGTTGCCACCGGCACTGCAGGACCGCGCGTTCAAGGGCAAGGTGTACCGCCTGGCGGAACTGGTGGTCGATGTCCCGAGCctg > 2:90416/1‑150 (MQ=255) ggCAACCTCACAAGCTTCTTCGCCAGCAAGGCCGTGCGCGGCCGGGTCGACCAGGTCAAGGGTGACCAGTTGCCACCGGCACTGCAGGACCGCGCGTTCAAGGGCAAGGTGTACCGCCTGGCGGAACTGGTGGTCGATGTCCCGAGCctg > 1:1086690/1‑150 (MQ=255) aaCCTCACAAGCTTCTTCGCCAGCAAGGCCGTGCGCGGCCGGGTCGACCAGGTCAAGGGTGACCAGTTGCCACCGGCACTGCAGGACCGCGCGTTCAAGGGCAAGGTGTACCGCCTGGCGGAACTGGTGGTCGATGTCCCGAGCctgct‑g < 1:265770/150‑1 (MQ=255) aCCTCACAAGCTTCTTCGCCAGCAAGGCCGTGCGCGGCCGGGTCGACCAGGTCAAGGGTGACCAGTTGCCACCGGCACTGCAGGACCGCGCGTTCAAGGGCAAGGTGTACCGCCTGGCGGAACTGGTGGTCGATGTCCCGAGCCTGCT‑gg < 1:670696/150‑1 (MQ=255) ccTCACAAGCTTCTTCGCCAGCAAGGCCGTGCGCGGCCGGGTCGACCAGGTCAAGGGTGACCAGTTGCCACCGGCACTGCAGGACCGCGCGTTCAAGGGCAAGGTGTACCGCCTGGCGGAACTGGTGGTCGATGTCCCGAGCCTGCT‑GGc > 2:292600/1‑150 (MQ=255) cTCACAAGCTTCTTCGCCAGCAAGGCCGTGCGCGGCCGGGTCGACCAGGTCAAGGGTGACCAGTTGCCACCGGCACTGCAGGACCGCGCGTTCAAGGGCAAGGTGTACCGCCTGGCGGAACTGGTGGTCGATGTCCCGAGCCTGCT‑GGcc > 1:1147767/1‑150 (MQ=255) tCACAAGCTTCTTCGCCAGCAAGGCCGTGCGCGGCCGGGTCGACCAGGTCAAGGGTGACCAGTTGCCACCGGCACTGCAGGACCGCGCGTTCAAGGGCAAGGTGTACCGCCTGGCGGAACTGGTGGTCGATGTCCCGAGCCTGCT‑GGCCa > 1:622069/1‑150 (MQ=255) aGCTTCTTCGCCAGCAAGGCCGTGCGCGGCCGGGTCGACCAGGTCAAGGGTGACCAGTTGCCACCGGCACTGCAGGACCGCGCGTTCAAGGGCAAGGTGTACCGCCTGGCGGAACTGGTGGTCGATGTCCCGAGCCTGCT‑GGCCAACCTg < 2:622069/150‑1 (MQ=255) ttcttcGCCAGCAAGGCCGTGCGCGGCCGGGTCGACCAGGTCAAGGGTGACCAGTTGCCACCGGCACTGCAGGACCGCGCGTTCAAGGGCAAGGTGTACCGCCTGGCGGAACTGGTGGTCGATGTCCCGAGCCTGCT‑gg > 1:717963/1‑139 (MQ=255) ttcttcGCCAGCAAGGCCGTGCGCGGCCGGGTCGACCAGGTCAAGGGTGACCAGTTGCCACCGGCACTGCAGGACCGCGCGTTCAAGGGCAAGGTGTACCGCCTGGCGGAACTGGTGGTCGATGTCCCGAGCCTGCT‑gg < 2:717963/139‑1 (MQ=255) ttcttcGCCAGCAAGGCCGTGCGCGGCCGGGTCGACCAGGTCAAGGGTGACCAGTTGCCACCGGCACTGCAGGACCGCGCGTTCAAGGGCAAGGTGTACCGCCTGGCGGAACTGGTGGTCGATGTCCCGAGCCTGCT‑GGCCAACCTGGcc < 1:90416/150‑1 (MQ=255) cttcGCCAGCAAGGCCGTGCGCGGCCGGGTCGACCAGGTCAAGGGTGACCAGTTGCCACCGGCACTGCAGGACCGCGCGTTCAAGGGCAAGGTGTACCGCCTGGCGGAACTGGTGGTCGATGTCCCGAGCCTGCT‑GGCCAACCTGGCCGa < 2:1086690/150‑1 (MQ=255) ttcGCCAGCAAGGCCGTGCGCGGCCGGGTCGACCAGGTCAAGGGTGACCAGTTGCCACCGGCACTGCAGGACCGCGCGTTCAAGGGCAAGGTGTACCGCCTGGCGGAACTGGTGGTCGATGTCCCGAGCCTGCT‑GGCCAACCTGGCCGAg > 1:141212/1‑150 (MQ=255) cGCCAGCAAGGCCGTGCGCGGCCGGGTCGACCAGGTCAAGGGTGACCAGTTTCCACCGGCACTGCAGGACCGCGCGTTCAAGGGCAAGGTGTACCGCCTGGCGGAACTGGTGGTCGATGTCCCGAGCCtgctggccaggttggccagcag < 1:1069590‑M1/150‑23 (MQ=255) cGCCAGCAAGGCCGTGCGCGGCCGGGTCGACCAGGTCAAGGGTGACCAGTTGCCACCGGCACTGCAGGACCGCGCGTTCAAGGGCAAGGTGTACCGCCTGGCGGAACTGGTGGTCGATGTCCCGAGCCagctcggccaggttggccagca < 2:340895‑M1/150‑23 (MQ=255) ccAGCAAGGCCGTGCGCGGCCGGTTCGCCCAGGTCAAGGGTGACCAGTTGCCACCGGCACTGCAGGACCGCGCGTTCAAGGGCAAGGTGTACCGCCTGGGGGAACTGGTGGTCGATGTCCCGAGCCagctcggccaggttggccagcagg < 1:106707‑M1/150‑25 (MQ=255) aGGCCGTGCGCGGCCGGGTCGACCAGGTCAAGGGTGACCAGTTGCCACCGGCACTGCAGGACCGCGCGTTCAAGGGCAAGGTGTACCGCCTGGCGGAACTGGTGGTCGATGTCCCGAGCCTGCT‑GGCCAACCTGGCCGAGCTGGCCGGCg > 1:1069411/1‑150 (MQ=255) cGTGCGCGGCCGGGTCGACCAGGTCAAGGGTGACCAGTTGCCACCGGCACTGCAGGACCGCGCGTTCAAGGGCAAGGTGTACCGCCTGGCGGAACTGGTGGTCGATGTCCCGAGCCAGCTCGGCCAGGTTGGCC‑AGCAggctcgggacat > 1:131689‑M2/1‑138 (MQ=255) 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tggtggTCGATGTCCCGAGCCTGCT‑GGCCAACCTGGCCGAGCTGGCCGGCGAGTCCTTGCTGGCAGGTGAACGCATCGAACCCTTGCGTGAAGGTAATGCGTTGGTCGGCCTGCGCGTGGACGACCGGGAAATCCGTGCCCAACGCATCg > 2:40694/1‑150 (MQ=255) gtggtCGATGTCCCGAGCCTGCT‑GGCCAACCTGGCCGAGCTGGCCGGCGAGTCCTTGCTGGCAGGTGAACGCATCGAACCCTTGCGTGAAGGTAATGCGTTGGTCGGCCTGCGCGTGGACGACCGGGAAATCCGTGCCCAACGCATCGTa > 1:1390028/1‑150 (MQ=255) ggtCGATGTCCCGAGCCTGCT‑GGCCAACCTGGCCGAGCTGGCCGGCGAGTCCTTGCTGGCAGGTGAACGCATCGAACCCTTGCGTGAAGGTAATGCGTTGGTCGGCCTGCGCGTGGACGACCGGGAAATCCGTGCCCAACGCATCGTAtt < 1:446563/150‑1 (MQ=255) gtCGATGTCCCGAGCCTGCT‑GGCCAACCTGGCCGAGCTGGCCGGCGAGTCCTTGCTGGCAGGTGAACGCATCGAACCCTTGCGTGAAGGTAATGCGTTGGTCGGCCTGCGCGTGGACGACCgg < 2:84476/123‑1 (MQ=255) gtCGATGTCCCGAGCCTGCT‑GGCCAACCTGGCCGAGCTGGCCGGCGAGTCCTTGCTGGCAGGTGAACGCATCGAACCCTTGCGTGAAGGTAATGCGTTGGTCGGCCTGCGCGTGGACGACCgg > 1:84476/1‑123 (MQ=255) gtCGATGTCCCGAGCCTGCT‑GGCCAACCTGGCCGAGCTGGCCGGCGAGTACTTGCTGGCAGGTGAACGCATCGAACCCTTGCGTGAAGGTAATGCGTTGGTCGGCCTGCGCGTGGACGACCGGGAAATCCGTGCCCAACGCATCGTATTg > 2:871348/1‑150 (MQ=255) cagttccGAGCCTGCT‑GGCCAACCTGGCCGAGCTGGCCGGCGAGTCCTTGCTGGCAGGTGAACGCATCGAACCCTTGCGTGAAGGTAATGCGTTGGTCGGCCTGCGCGTGGACGACCGGGAAATCCGTGCCCAACGCATCGTATTGAgcg > 2:1251017/6‑150 (MQ=255) aTGTCCCGAGCCtgctggccaacctggccgagctggctcgggacatcgaccaccagttccgccaggcggtacaccttgcccttgaacgcgcggtcctgcagtgccggtggcaactggtcacccttgacctggtcgacccggccgcgcacg > 1:131689‑M1/1‑12 (MQ=255) gTCCCGAGCCTGCT‑GGCCAACCTGGCCGAGCTGGCCGGCGAGTCCTTGCTGGCAGGTGAACGCATCGAACCCTTGCGTGAAGGTAATGCGTTGGTCGGCCTGCGCGTGGACGACCGGGAAATCCGTGCCTAACGCATAGTATTGAGCGcc < 2:141212/150‑1 (MQ=255) ccGAGCCTGCT‑GGCCAACCTGGCCGAGCTggctcgggacatcgaccaccagttccgccaggcggtacaccttgcccttgaacgcgcggtcctgca > 2:10462‑M2/1‑29 (MQ=255) ccGAGCCTGCT‑GGCCAACCTGGCCGAGCTggctcgggacatcgaccaccagttccgccaggcggtacaccttgcccttgaacgcgcggtcctgca < 1:10462‑M2/95‑67 (MQ=255) ccGAGCCTGCT‑GGCCAACCTGGCCGAGCTggctcgggacatcgaccaccagttccgccaggcggtacaccttgccc < 1:1115968‑M2/76‑48 (MQ=255) ccGAGCCTGCT‑GGCCAACCTGGCCGAGCTggctcgggacatcgaccaccagttccgccaggcggtacaccttgccc > 2:1115968‑M2/1‑29 (MQ=255) ccGAGCCTGCT‑GGCCAACCTGGCCGAGCTGGCCGGCGAGTCCTTGCTGGCAGGTGAACGCATCGAACCCTTGCGTGAAGGTAATGCGTTGGTCGGCCTGCGCGTGGACGACCGGGAAATCCGTGCCCAACGCATCGTATTGAGCGCCGGa > 1:576384/1‑150 (MQ=255) ccTGCT‑GGCCAACCTGGCCGAGCTggctcgggacatcgaccaccagttcccccaggcggtacaccttgcccttgaacgcgcggtcctgcagtgccggtggcaactggtcacccttgacctgggcgaaccggccgcgcacggccttgctgg < 1:106707‑M2/150‑127 (MQ=255) ctgct‑gGCCAACCTGGCC‑AGCAggctcgggacatcgaccaccagttccgccaggcggtacaccttgcccttgaacgcgcggtcctgcagtgccggtggaaactggtcacccttgacctggtcgacccggccgcgcacggccttgctggcg < 1:1069590‑M2/150‑129 (MQ=255) | GGCAACCTCACAAGCTTCTTCGCCAGCAAGGCCGTGCGCGGCCGGGTCGACCAGGTCAAGGGTGACCAGTTGCCACCGGCACTGCAGGACCGCGCGTTCAAGGGCAAGGTGTACCGCCTGGCGGAACTGGTGGTCGATGTCCCGAGCCTGCT‑GGCCAACCTGGCCGAGCTGGCCGGCGAGTCCTTGCTGGCAGGTGAACGCATCGAACCCTTGCGTGAAGGTAATGCGTTGGTCGGCCTGCGCGTGGACGACCGGGAAATCCGTGCCCAACGCATCGTATTGAGCGCCGGAGCCGGCA > NC_002947/5611385‑5611682 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |