| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 90359 = | 82 (1.560) | 6 (0.130) | 5/214 | NT | 7.9% | intergenic (+34/+88) | PP_0079/PP_0080 | transcriptional regulator/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 90414 = | 69 (1.510) | intergenic (+89/+33) | PP_0079/PP_0080 | transcriptional regulator/hypothetical protein | |||||
GCGGCGTGGGGCGTTGATCGAGCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAG > NC_002947/90265‑90560 | ggatggtggacatgctggagctggacttgcaccggagcgagcacctgaacttcgtggtcgagattttggggccgctttgcggcccatcgcgacaCAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGc < 1:973029‑M1/56‑1 (MQ=255)gcggcgTGGGGCGTTGATCGAGCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGc < 2:845813/150‑1 (MQ=255)gatggtggacatgctggagctggacttgcaccggagcgagcacctgaacttcgtggtctagattgccggggctgctgcgcagcccatcgcgacgCAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGc > 1:717449‑M1/95‑150 (MQ=255) ggcgTGGGGCGTTGATCGAGCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGt < 1:1044928/150‑1 (MQ=255) gTGGGGCGTTGATCGAGCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTcgc > 1:56973/1‑150 (MQ=255) gggCGTTGATCGAGCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGAt < 2:322496/150‑1 (MQ=255) ggCGTTGATCGAGCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGAGGACTACCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATg < 2:759945/150‑1 (MQ=255) ttGATCGAGCGGTTTGTGGATTGTTTGGAGCATGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCt < 1:1347078/150‑1 (MQ=255) gATCGAGCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTgc < 2:1192647/150‑1 (MQ=255) aTCGAGCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGc > 2:913832/1‑134 (MQ=255) aTCGAGCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGc < 1:913832/134‑1 (MQ=255) cGAGCGGTTTGTGGACTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCgca < 2:992191/150‑1 (MQ=255) gAGCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTgctgcg > 1:984964/1‑146 (MQ=255) tttGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGccc > 1:1135710/1‑150 (MQ=255) tgtgGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCg < 1:651023/150‑1 (MQ=255) gtgGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGTGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCgg > 1:435389/1‑150 (MQ=255) gtgGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGACCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCgg < 1:99651/150‑1 (MQ=255) gATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCaa > 2:449723/1‑150 (MQ=255) gATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCaa < 2:850333/150‑1 (MQ=255) ttggttggAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATc < 2:1135710/150‑1 (MQ=255) ggttggAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTa < 2:504349/150‑1 (MQ=255) gttggAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAg > 2:271171/1‑150 (MQ=255) ttggAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGACCACCAATTCGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGa < 1:882952/150‑1 (MQ=38) ggAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGAcc > 2:134159/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCa > 1:859869/1‑150 (MQ=255) gCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGCCACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑Cg > 1:604702/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTc > 1:590443/1‑150 (MQ=255) gcAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAg < 1:1025516/150‑1 (MQ=255) aGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGGGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCGCCGGCAATCTCGAGGA‑AGAAGTTCTGGt > 2:584473/1‑150 (MQ=38) aGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAg > 2:1398851/1‑143 (MQ=255) aGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAg < 1:1398851/143‑1 (MQ=255) aGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGt < 1:1338478/150‑1 (MQ=255) gCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTgc > 1:494685/1‑112 (MQ=255) gCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTgc < 2:494685/112‑1 (MQ=255) ccTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTgc > 1:473735/1‑150 (MQ=255) tttGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGATCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTgctc > 1:1229103/1‑150 (MQ=255) tttGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGa < 2:853046/101‑1 (MQ=255) tttGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGa > 1:853046/1‑101 (MQ=255) tttGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTgctc > 1:66189/1‑150 (MQ=255) tttGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTgctc > 2:251692/1‑150 (MQ=255) gggCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCaa < 1:134159/150‑1 (MQ=255) gggCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCaa < 1:271171/150‑1 (MQ=255) gggACGCTTTGCGTCCCATCGGAACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTTTGCAGCAGCCCCGGCTATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCaa < 2:81538/150‑1 (MQ=255) ccGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGtc > 2:715964/1‑150 (MQ=255) cGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTcgc < 1:823083/83‑1 (MQ=255) cGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTcgc > 2:823083/1‑83 (MQ=255) cGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGtcc < 2:435389/150‑1 (MQ=255) cGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGtcc > 2:1200189/1‑150 (MQ=255) gCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGtcca > 2:1325695/1‑150 (MQ=255) ccTTGGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGTAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGtcca < 1:1319834/149‑1 (MQ=255) cTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTgc < 1:86200/130‑1 (MQ=255) cTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTgc > 2:86200/1‑130 (MQ=255) cTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGtccag < 2:66189/150‑1 (MQ=255) tttGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCaa < 2:898315/143‑1 (MQ=255) tttGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCaa > 1:898315/1‑143 (MQ=255) tttGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGtccagc > 1:1124365/1‑150 (MQ=255) ggCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGt < 1:1171330/134‑1 (MQ=255) ggCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTGCAGGTGCTCGCTCCGGt > 2:1171330/1‑134 (MQ=255) ccATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCAt < 2:495758/150‑1 (MQ=255) aTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGt < 1:676109/150‑1 (MQ=255) gcgACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAg > 2:1018600/1‑112 (MQ=255) gcgACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAg < 1:1018600/112‑1 (MQ=255) cgACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTAGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTccac < 2:699847/150‑1 (MQ=255) gACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCC‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCaa < 1:481266/128‑1 (MQ=255) gACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCaa < 1:482572/128‑1 (MQ=255) gACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCaa > 2:482572/1‑128 (MQ=255) gACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCaa > 2:481266/1‑128 (MQ=255) gACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGtc < 1:1000304/131‑1 (MQ=255) gACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGtc > 2:1000304/1‑131 (MQ=255) gcaaggccgctcccacatgggccggcgtgtgcagtgccactgtgggagcggccttgTGTCGCGATGGGCCGCAAAGCGGCCCC‑AAAATCTCGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATcc < 1:973029‑M2/94‑1 (MQ=255) gcaaggccgctcccacatgggccggcgtgtgcagtgccactgtgggagcggccttgCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATc > 1:717449‑M2/57‑150 (MQ=255) AAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCATCAAAGTTTATGT‑CTCGCTCCGGTGCAATTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATccc < 2:37248‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCGGTCGCACAGTGGCGCCGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGGGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGc > 2:257266‑M1/1‑150 (MQ=255) CCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCACCCTCATCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCt > 1:37248‑M1/1‑150 (MQ=255) 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acatgggccggcgtgtgcagtgccactgtgggagcggccttgCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAg < 1:201375‑M2/51‑1 (MQ=255) acatgggccggcgtgtgcagtgccactgtgggagcggccttgCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAg > 2:201375‑M2/43‑93 (MQ=255) acatgggccggcgtgtgcagtgccactgtgggagcggccttgCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCt > 1:1295513‑M2/43‑150 (MQ=255) ACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTTCGATCCt < 1:768113‑M1/150‑1 (MQ=255) CAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTg > 1:1200189‑M1/1‑150 (MQ=255) tGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGAc > 1:684366/1‑150 (MQ=255) aCTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAgc < 2:590443/150‑1 (MQ=255) aCTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGAGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAgc < 2:56973/150‑1 (MQ=255) acGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGt > 1:484936/1‑80 (MQ=255) acGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGt < 2:484936/80‑1 (MQ=255) ccGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACgg < 1:102562/150‑1 (MQ=255) cATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCCGCATCTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACCAGCGCCGCCTCGGCTctgc < 2:1124365/150‑1 (MQ=39) cATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTcagc > 2:309021/1‑150 (MQ=255) actgtgggagcggccttgCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTcagc > 1:437479‑M2/19‑150 (MQ=255) tgggagcggccttgCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGATCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTcagccagc < 1:449723‑M2/136‑1 (MQ=255) gggagcggccttgCGTCGCGATGGGCTGAGCCGCAGCCGCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCagccagcc < 2:473735‑M2/137‑1 (MQ=255) gcggccttgCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAgg < 2:860805‑M2/141‑1 (MQ=255) gcggccttgCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAgg < 2:437479‑M2/141‑1 (MQ=255) cggccttgCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGc < 2:1229103‑M2/142‑1 (MQ=255) ttgCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAg > 1:781971‑M2/4‑150 (MQ=255) | GCGGCGTGGGGCGTTGATCGAGCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCA‑CGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAG > NC_002947/90265‑90560 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |