New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 160985 | 37 (0.700) | 4 (0.080) | 4/232 | NT | 10.0% | coding (51/294 nt) | PP_0151 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 160992 | 37 (0.750) | coding (44/294 nt) | PP_0151 | hypothetical protein |
GCGGGCCTGTGTAAGCAGTTTGCGATCGAATGGTGCGACTGTGACCTGGCTGGTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTACCTCAGGTGCGAGGGCCGAAGCCAACGCACCTGTTGTGCATGGCGCGTATCAGAGTGCCAGGATGG > NC_002947/160883‑161141 | gcgGGCCTGTGTAAGCAGTTTGCGATCGAATGGTGCGACTGTGACCTGGCTGGTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATATCg < 2:1311409/150‑1 (MQ=255) ccTGTGTAAGCAGTTTGCGATCGAATGGTGCGACTGTGACCTGGCTGGTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGa < 2:1233077/150‑1 (MQ=255) ccTGTGTAAGCAGTTTGCGATCGAATGGTGCGACTGTGACCTGGCTGGTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGa < 2:864138/150‑1 (MQ=255) cTGTGTAAGCAGTTTGCGATCGAATGGTGCGACTGTGACCTGGCTGGTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCGTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAg > 1:1369770/1‑150 (MQ=255) tgtgTAAGCAGTTTGCGATCGAATGGTGCGACTGTGACCTGGCTGGTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGc > 1:626787/1‑150 (MQ=255) tgtAAGCAGTTTGCGATCGAATGGTGCGACTGTGACCTGGCTGGTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCtt > 1:328277/1‑150 (MQ=255) aGTTTGCGATCGAATGGTGCGACTGTGACCTGGCTGGAGAGATCCGTGGGTG‑TCTGGAGTTTTGGTGTGTTGGTCTCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGaa < 1:319861/150‑1 (MQ=255) tGCGATCGAATGGTGCGACTGTGACCTGGCTGGTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCt > 2:920918/1‑150 (MQ=255) gcgcTCGCATCGAGCCACTTTCACCTGGCTGGTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTg < 2:1105172/150‑1 (MQ=255) gATCGAATGGTGCGACTGTGACCTGGCTGGTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGaa > 1:367893/1‑106 (MQ=255) gATCGAATGGTGCGACTGTGACCTGGCTGGTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGaa < 2:367893/106‑1 (MQ=255) gATCGAATGGTGCGACTGTGACCTGGCTGGTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGa > 1:638275/1‑150 (MQ=255) ggTGCGACTGTGACCTGGCTGGTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGaa < 2:626787/150‑1 (MQ=255) tgtgACCTGGCTGGTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAg > 1:265292/1‑150 (MQ=255) aCCTGGCTGGTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTa < 1:754064/150‑1 (MQ=255) ccTGGCTGGTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTAc < 2:782557/150‑1 (MQ=255) ctggctggTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGGGGCGGTTAACTCTGGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTAcc > 2:1106974/1‑150 (MQ=255) ctggctggTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTAcc > 1:940017/1‑150 (MQ=255) ctggctggTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTAcc < 2:127131/150‑1 (MQ=255) ctggctggTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTAcc < 2:265292/150‑1 (MQ=255) ctggctggTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTAcc > 1:127131/1‑150 (MQ=255) aCAT‑AGTCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTACCTCAGGTGCGa > 2:1103289/1‑150 (MQ=255) ggTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTACCTCAGGTGCGAGGGCCGaa < 1:1103289/150‑1 (MQ=255) gACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTACCTCAGGTGCGAGGGCCGAAGCCAAc < 1:1045710‑M2/150‑2 (MQ=255) aGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAAt < 2:478137/105‑1 (MQ=255) aGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAAt > 1:478137/1‑105 (MQ=255) gCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGaa < 1:631023/113‑1 (MQ=255) gCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGaa > 2:631023/1‑113 (MQ=255) gCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTACCTCAGGTGCGAGGGCCGAAGCCAAcgcacct < 2:1138798‑M2/150‑8 (MQ=255) tttGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGaaaaa > 2:1095123/1‑100 (MQ=255) tttGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGaaaaa < 1:1095123/100‑1 (MQ=255) tggtATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTAc < 2:930746/108‑1 (MQ=255) tggtATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTAc > 1:930746/1‑108 (MQ=255) tATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTACCTCAGGTGCGAGGGCCGAAGCCAACGCACCTGTTGTGCATGgcgc < 1:920918/150‑1 (MQ=255) tCCATGGCATGGGCGCTGGccatgccatggataccaccacacaaagcctggtcatcaccggctatgtcaccagccag > 2:567790‑M2/1‑19 (MQ=255) tCCATGGCATGGGCGCTGGccatgccatggataccaccacacaaagcctggtcatcaccggctatgtcaccagccag < 1:567790‑M2/77‑59 (MQ=255) tCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTACCTCAGGTGCGAGGGCCGAAGCCAACGCACCTGTTGTGCAt < 2:623858/143‑1 (MQ=255) tCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTACCTCAGGTGCGAGGGCCGAAGCCAACGCACCTGTTGTGCAt > 1:623858/1‑143 (MQ=255) ccATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTACCTCAGGTGCGAGGGCCGAAGCCAACGCACCTGTTGTGCATGGCGCGTa > 1:77445/1‑150 (MQ=255) catggcatggGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTACCTCAGGTGCGAGGGCCGAAGCCAACGCACCTGTTGTGCATGGCGCGTAt > 1:204558/1‑150 (MQ=255) atgggattgGCGCTGGTCATGCCTGCGGGGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTACCTCAGGTGCGAGGGCCGAAGCCAACGCACCTGTTGTGCATGGCGCGTATc > 2:54553/1‑150 (MQ=255) tggcatggGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGTCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTACCTCAGGTGCGttggcttcggccctcgcacctgaggt > 2:156859‑M1/1‑109 (MQ=255) tggcatggGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGTCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTACCTCAGGTGCGttggcttcggccctcgcacctgaggt < 1:156859‑M1/135‑27 (MQ=255) gcatggGCGCTGGccatgccatggataccaccacacaaagcctggtcatcaccggctatgtcac > 2:1097781‑M2/1‑13 (MQ=255) gcatggGCGCTGGccatgccatggataccaccacacaaagcctggtcatcaccggctatgtcac < 1:1097781‑M2/64‑52 (MQ=255) tGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGAGAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTACCTCAGGTGCGAGGGCCGAAGCCAACGCACCTGTTGTGCATGGCGCGTATCAGAGTGCCAGGAt < 2:1045710/150‑1 (MQ=255) gCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTACCTCAGGTGCGAGGGCCGAAGCCAACGCACCTGTTGTGCATGGCGCGTATCAGAGTGCCAGGATgg < 2:77445/150‑1 (MQ=255) | GCGGGCCTGTGTAAGCAGTTTGCGATCGAATGGTGCGACTGTGACCTGGCTGGTGACAT‑AGCCGGTGATGACCAGGCTTTGTGTGGTGGTATCCATGGCATGGGCGCTGGCCATGCCTGCGGCGGCGAACAGCAATGGCAACAGATAACGCATGAGCTTTCTTGAAGGCTGGAAAAATGAACGGCGAAGCCTACCTCAGGTGCGAGGGCCGAAGCCAACGCACCTGTTGTGCATGGCGCGTATCAGAGTGCCAGGATGG > NC_002947/160883‑161141 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |