| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 462721 = | 56 (1.070) | 7 (0.140) | 7/234 | NT | 11.8% | coding (682/795 nt) | davA | 5‑aminopentanamidase |
| ? | NC_002947 | 462754 = | 51 (1.020) | coding (649/795 nt) | davA | 5‑aminopentanamidase | |||||
GCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCACGGTCACCTGGCAGGTAAAGTCGTACGGCGTCATGTTCGCCGTCGGCACCA > NC_002947/462611‑462903 | gCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCgatgat > 1:308966/1‑150 (MQ=255)ccaggtgaccgtgagggcacgggcgcaggaaaaccagtgctacctggtatatgccaactactgcggcgcggaagacgagatcgagtattgcgggcagagcagcatcatcgGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCgatgat > 1:1321170‑M1/111‑150 (MQ=255) aggtgaccgtgagggcacgggcgcaggaaaaccagtgctacctggtatatgccaactactgcggcgcggaagacgagatcgagtattgcgggcagagcagcatcatcccGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGatgatg > 1:485597‑M1/110‑150 (MQ=255) ttACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCACCCGGGCCGATGAtgctg < 2:53586/150‑1 (MQ=255) cgtgagggcacgggcgcaggaaaaccagtgctacctggtatatgccaactactgcggcgcggaagacgagatcgagtattgcgggcagagcagcatcatcgGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCgatga < 2:1340911‑M1/39‑1 (MQ=255) cgtgagggcacgggcgcaggaaaaccagtgctacctggtatatgccaactactgcggcgcggaagacgagatcgagtattgcgggcagagcagcatcatcgGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCgatga > 1:1340911‑M1/102‑140 (MQ=255) cTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGAAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATa > 1:726242/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTc > 2:135050/1‑150 (MQ=255) tGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCg < 2:599733/150‑1 (MQ=255) gcgcAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGAt > 1:123256/1‑150 (MQ=255) tCAGGTAGTGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCcg > 2:957696/1‑150 (MQ=255) gTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGcgcc > 1:859465/1‑150 (MQ=255) tAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGcgccg < 1:29313/150‑1 (MQ=255) aaaCGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCagta < 2:239912/150‑1 (MQ=255) cccTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTgg < 2:123256/150‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCa < 1:665238/150‑1 (MQ=255) tGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTTCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCat < 1:148264/150‑1 (MQ=255) ccccTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATAc > 1:1005071/1‑150 (MQ=255) gcccgatcaccTGCTGATGCTCGAGCTGTGCCAACAACAGGCACTCAGCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTCCCATCCCGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAAGACTCGATCGCGTCTTCCGCTCCGCAGTAGTTGGCATATACCa > 2:201184/8‑150 (MQ=255) ccTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGatgatg < 1:198942/92‑1 (MQ=255) ccTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGatgatg > 2:198942/1‑92 (MQ=255) accCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTa > 1:1023378/1‑146 (MQ=255) accCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTa < 2:1023378/146‑1 (MQ=255) cccGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACt < 1:135050/150‑1 (MQ=255) cGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATAGTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTgg < 2:896488/150‑1 (MQ=255) cGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTgg < 1:1271024/150‑1 (MQ=255) tCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGttt > 2:638395/1‑150 (MQ=255) aTGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGCCCAGCAATCTGCGATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTc < 2:311287/150‑1 (MQ=255) cTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTg > 1:65990/1‑150 (MQ=255) gAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTgcgc < 2:859465/150‑1 (MQ=255) tctGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACCGGTTTTCCTGCGCCCGt < 2:726242/150‑1 (MQ=255) tGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTc < 1:923368/84‑1 (MQ=255) tGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTc > 2:923368/1‑84 (MQ=255) caacaaCTGACACTCATCCAGCGCGGGCGGGCCCAGGAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCCGATCTCCCAAGGGTACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATAGACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCt < 1:957696/150‑1 (MQ=255) aacaacTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCgatgat > 1:1411085/1‑59 (MQ=255) aacaacTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCgatgat < 2:1411085/59‑1 (MQ=255) aacaacTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTc > 2:371549/1‑150 (MQ=255) acaacTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAg < 1:1398643/118‑1 (MQ=255) acaacTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAg > 2:1398643/1‑118 (MQ=255) caacTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCAc < 2:1005071/150‑1 (MQ=255) acTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCGCgg > 2:1010484/1‑150 (MQ=255) tGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCACGGTc > 2:1209748/1‑150 (MQ=255) catcatcggcccggatggcagcttgctggccatggccgggcgGGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCACGGTCACCt > 1:485597‑M2/43‑150 (MQ=255) cTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCa < 1:853663/107‑1 (MQ=255) cTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCa > 2:853663/1‑107 (MQ=255) cTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCACGGTCACCTg < 2:1087085/150‑1 (MQ=255) atcatcggcccggatggcagcttgctggccatggccgggcCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCACGGTCACCTgg > 1:1321170‑M2/41‑150 (MQ=255) tcatcggcccggatggcagcttgctggccatggccgggcCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCACg < 2:1340911‑M2/101‑1 (MQ=255) tcatcggcccggatggcagcttgctggccatggccgggcCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCACg > 1:1340911‑M2/40‑140 (MQ=255) aTCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCa < 2:253994/97‑1 (MQ=255) aTCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCa > 1:253994/1‑97 (MQ=255) ccgcccgGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTa < 2:989323/105‑1 (MQ=255) ccgcccgGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTa > 1:989323/1‑105 (MQ=255) ccgcccgGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCACGGTCACCTGGCAGGt > 1:368467/1‑150 (MQ=255) ccgcccgGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCACGGTCACCTGGCAGGt > 1:1102976/1‑150 (MQ=255) gcccggatggcagcttgctggccatggccgggcCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCACGGTCACCTGGCAGGTaa > 1:1305168‑M2/34‑150 (MQ=255) cccggatggcagcttgctggccatggccgggcCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCACGGTCACCTGGCAGGTaaa < 2:1321170‑M2/118‑1 (MQ=255) ggCCACGGCCCGCAAGCTGCTACCGAGCCCTGTGAGGCTGCTCTGCCGGCAACGCTCGATCTCGTCGTTCGCGCCGGAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTGTTCCTGCCGCCGTGATCGCCCGGTTACCTGACGGCTACAGTc < 2:59111/150‑1 (MQ=255) gatggcagcttgctggccatggccgggcCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCACGGTCACCTGGCAGGTAAAGTCg > 2:1354596‑M2/29‑150 (MQ=255) gCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCACGGTCACCTGGCAGGTAAAGTCGTACGGc < 2:351402/150‑1 (MQ=255) cAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCTCCCGTGCCCTCACGGTCACCTGGCAGGTAAAGTCGTACGGCGt > 1:155921/1‑150 (MQ=255) tGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCACGGTCACCTGGCAGGTAAAGTCGTACGGCGTCATGTTCg > 1:1020196/1‑150 (MQ=255) gCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCACGGTCACCTGGCAGGTa < 1:90399/127‑1 (MQ=255) gCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCACGGTCACCTGGCAGGTa > 2:90399/1‑127 (MQ=255) gggcCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGtt > 2:1077210‑M2/5‑59 (MQ=255) gggcCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGtt < 1:1077210‑M2/55‑1 (MQ=255) ggcCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCACGGTCACCTGGCAGGTAAAGTCGTACGGCGTCATGTTCGCCGTCGGCa < 2:1211567‑M2/147‑1 (MQ=255) cGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCCCGTCTTCCGCGCCGCAGTGGTTTGCAGATAGCGCCGGGCAGTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCACGGTCACCTGGCAGGTAAAGTCGTACGGCGTCATGTTCGCCGTCGGCACCa < 1:25797/150‑1 (MQ=255) | GCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATCGGTCAGGTAGGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAGCTGCCATCCGGGCCGATGATGCTGCTCTGCCCGCAATACTCGATCTCGTCTTCCGCGCCGCAGTAGTTGGCATATACCAGGTAGCACTGGTTTTCCTGCGCCCGTGCCCTCACGGTCACCTGGCAGGTAAAGTCGTACGGCGTCATGTTCGCCGTCGGCACCA > NC_002947/462611‑462903 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |