| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 499197 = | 94 (1.790) | 7 (0.170) | 6/198 | NT | 8.7% | intergenic (+38/‑258) | uhpA/PP_0411 | two‑component system response regulator UhpA/polyamine ABC transporter ATP‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 499284 = | 71 (1.680) | intergenic (+125/‑171) | uhpA/PP_0411 | two‑component system response regulator UhpA/polyamine ABC transporter ATP‑binding protein | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
CATGGAGCACAAGCTGATCTGATTGCGACATACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTCTCAGTACCCCCGATTTTCGGGCGCTTGCGTCTCTTCTACTCTTTTGCCTACGCAGTC > NC_002947/499138‑499433 | aTGGAGCACAAGCTGATCTGATTGCGACATACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGttt > 2:793790/1‑150 (MQ=255) gAGCACAAGCTGATCTGATTGCGACATACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGt < 1:793790/150‑1 (MQ=255) acaAGCTGATCTGATTGCGACATACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGtt > 2:1350575/1‑150 (MQ=255) acaAGCTGATCTGATTGCGACATACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGtt > 2:1282277/1‑150 (MQ=255) acaAGCTGATCTGATTGCGACATACGGGTGCCCGAAACTTGATGGTGCCTATGTGGGAGCGGGCAGTCCTGCTAACGGGCCTGGACTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGtt > 1:387285/1‑150 (MQ=38) aaGCTGATCTGATTGCGACATACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTgg > 1:1041132/1‑150 (MQ=255) aaGCTGATCTGATTGCGACATACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTgg > 1:331319/1‑150 (MQ=255) aaGCTGATCTGATTGCGACATACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTgg > 2:1273569/1‑150 (MQ=255) aaGCTGATCTGATTGCGACATACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTg < 2:57047/149‑1 (MQ=255) aGCTGATCTGATTGCGACATACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGc < 2:786513/150‑1 (MQ=255) ctgatctgatTGCGACATACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTc < 1:567305/150‑1 (MQ=255) tctgatTGCGACATACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCaa > 1:706571/1‑150 (MQ=255) tgatTGCGACATACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAgg < 2:428697/150‑1 (MQ=255) ggatTGCGACATACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGTATATGGCGTTGCGGGCATGCCCGCGAACGGGGCTGGCCTGCGGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAgg < 1:1384401/149‑1 (MQ=38) gatTGCGACATACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTg > 1:70525/1‑135 (MQ=255) ttGCGACATACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCa > 1:858623/1‑150 (MQ=255) gCGACATACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCAtt < 2:858623/150‑1 (MQ=255) gACATACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTcc > 1:2563/1‑150 (MQ=255) aTACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAAt > 1:175476/1‑150 (MQ=255) aTACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAAt > 2:406496/1‑150 (MQ=255) tACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATc < 2:568614/150‑1 (MQ=255) cGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATccc < 1:595512/150‑1 (MQ=255) cGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATccc < 1:1160251/150‑1 (MQ=255) ggatcccGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGc > 1:630577/5‑150 (MQ=255) cGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGTCTCTTCGCGGGCCTGCCCGCTCCCCCAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCGTTCCAATCCCGCCATCCt > 2:593279/1‑150 (MQ=255) cGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCt > 1:756186/1‑150 (MQ=255) gAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCtt < 1:20101/150‑1 (MQ=255) gAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACCGGCCTGGCCTGCTAAGCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGTAATGCCCGCTCCCACAGGATTCGTGGTTGGCTCGCAGGAGCATTCCAATCGCGCCATCCtt > 1:616677/1‑150 (MQ=255) aaaCTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTg < 2:175476/150‑1 (MQ=255) cTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAg > 2:386949/1‑150 (MQ=255) cTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAg < 1:1187369/150‑1 (MQ=255) ttGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAgg < 2:331319/150‑1 (MQ=255) ttGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAgg > 1:1125780/1‑150 (MQ=255) ttGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAgg < 2:1041132/150‑1 (MQ=255) tGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAggg < 1:1282277/150‑1 (MQ=255) gCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGc < 1:724428/150‑1 (MQ=255) cGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGa > 2:1138018/1‑150 (MQ=255) gAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGAt > 2:175878/1‑150 (MQ=255) aaGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATc < 1:1138018/150‑1 (MQ=255) gCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTGTTGTGGGGCACGCTTGTTCCTTCATGTTTCGTGGTTTGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCAACCTTGTAGGGCGATccc > 1:461175/1‑150 (MQ=255) ccTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGtt < 2:538305/103‑1 (MQ=255) ccTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGtt > 1:538305/1‑103 (MQ=255) ccTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCt < 2:485481/150‑1 (MQ=255) tATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTa < 1:763465/137‑1 (MQ=255) tATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATccc > 2:751269/1‑147 (MQ=255) tATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTac > 2:93430/1‑150 (MQ=255) TGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGACCGGGCCTGGCCTGGTGATCTCGATGGCTTAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTacaa > 2:1225881‑M1/1‑150 (MQ=255) TGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTacaa > 2:706571‑M1/1‑150 (MQ=255) taacCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCACGGGACTTACAATCCCGCCGTACTTTTTGAAGGATAGCTACAACaaa < 1:760466‑M1/146‑1 (MQ=255) GGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCCAGGGCATTGCAATCCCGCGATCCTTGTAGGTCGACCCCTTCAACaaa < 1:1231955‑M1/150‑1 (MQ=255) GAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAAt < 1:1330151‑M1/150‑1 (MQ=255) GAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAAt < 1:1312360‑M1/150‑1 (MQ=255) GGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTc > 1:93430‑M1/1‑150 (MQ=255) GGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTg < 1:1090184‑M1/123‑1 (MQ=255) GGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTg > 2:1090184‑M1/1‑123 (MQ=255) GCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGAt < 2:1117440‑M1/131‑1 (MQ=255) GCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGAt > 1:1117440‑M1/1‑131 (MQ=255) GCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCCGGCCTAGCAGCCCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCACCCTTGTAGGGCGCTCCCTCCAAAAAATCTTCCa < 2:344176‑M1/150‑1 (MQ=255) cccgcgaagaggccggctcagccatagagatcagcaggccaggcccgttcgcgggcatgcccgctcccacaGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTa < 1:365512‑M2/48‑1 (MQ=255) cccgcgaagaggccggctcagccatagagatcagcaggccaggcccgttcgcgggcatgcccgctcccacaGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTa > 2:365512‑M2/72‑119 (MQ=255) ccgcgaagaggccggctcagccatagagatcagcaggccaggcccgttcgcgggcatgcccgctcccacaGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTc > 1:714966‑M2/71‑142 (MQ=255) ccgcgaagaggccggctcagccatagagatcagcaggccaggcccgttcgcgggcatgcccgctcccacaGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTc < 2:714966‑M2/72‑1 (MQ=255) ccgcgaagaggccggctcagccatagagatcagcaggccaggcccgttcgcgggcatgcccgctcccacaGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGga < 2:645431‑M2/80‑1 (MQ=255) ccgcgaagaggccggctcagccatagagatcagcaggccaggcccgttcgcgggcatgcccgctcccacaGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGga > 1:645431‑M2/71‑150 (MQ=255) CCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTaggga < 1:281633‑M1/122‑2 (MQ=255) CCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTaggga > 2:281633‑M1/1‑121 (MQ=255) CCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGga < 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gggCCTGGCCTGCTGATCTCTATGTCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCa < 1:954014/150‑1 (MQ=255) ctggcctgCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGc > 1:510668/1‑110 (MQ=255) ctggcctgCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGc < 2:510668/110‑1 (MQ=255) tggcctgCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCAAAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAAGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATtctc > 1:175368/1‑150 (MQ=255) cctgCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTCTCa < 2:316038/150‑1 (MQ=255) gATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTCTCAGTAccc > 2:743784/1‑150 (MQ=255) aTCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTCTCAGTAcccc < 1:175878/150‑1 (MQ=255) tctATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAggg < 1:1035993/95‑1 (MQ=255) tctATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAggg > 2:1035993/1‑95 (MQ=255) tATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTCTCAGTACCCCCGAtt > 1:354227/1‑150 (MQ=255) tATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTAACGCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTCTCAGTACCCCCGAtt > 2:905460/1‑150 (MQ=255) tATGGCTGAGCCGGCCTCCTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTCTCAGTACCCCCGAtt > 1:436995/1‑150 (MQ=255) ggCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTCTCAGTACCCCCGATTTTc < 1:976337/150‑1 (MQ=255) tGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTCTCAGTACCCCCGATTTTCggg < 2:756186/150‑1 (MQ=255) gAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCCTCATTCTAGCGCGGACCTTTCTCGTATTCTTTCATGCGTATGATGGCATTCTCTCAGTACCCCCGATTTTCGGgc < 1:386949/150‑1 (MQ=25) cccgctTCGCGGGTATGGCCGCTCCGAGGGGTTGCCTGGGTGTATCGCAAGTGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACTAATCTTCCATCCGGAAGATGGCATTCTCTCAGTTCCCCCGATTTTCGGGCGCTTGc < 2:616677/146‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTCTCAGTACCCCCGATTTTCGGGCGCTTGCGt > 1:1364118/1‑150 (MQ=255) ctctTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTCTCAGTACCCCCGATTTTCGGGCGCTTGCGt < 2:1330151/150‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTCTCAGTACCCCCGATTTTCGGGCGCTTGCGtc > 2:308297/1‑150 (MQ=255) ttcgcgggcatgcccgctcccacaGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTTTCACTACCCCCGGTGTTGGGGCTCTGGCGgctc > 2:307975‑M2/25‑150 (MQ=255) ttcgcgggcatgcccgctcccacaGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTCTCAGTACCCCCGATTTTCGGGCGCTTCCGgctc < 2:354227‑M2/126‑1 (MQ=255) tgcccgctcccacaGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTCTCAGTACCCCCGATTTTCGGGCGCTTGCGTCTCTTCTACTCtt < 2:1312360‑M2/136‑1 (MQ=255) gcccgctccgacaGGTTTCGTGGTTGGCTGGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACACATCTTCCGTCCGGATGATGGCATTCTCTCAGTACCCCCGATTTTCGGGCGCTTGCGTCTCTTCTACTCttt < 2:360027‑M2/137‑1 (MQ=255) cccgctcccacaGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTCTCAGTACCCCCGATTTTCGGGCGCTTGCGTCTCTTCTACTCtttt < 2:1364118‑M2/138‑1 (MQ=255) cccgctcccacaGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTATCAGTACCCCCGATTTTCGCGCGCTTGCGTCTCTTCTACTCtttt < 1:743784‑M2/138‑1 (MQ=255) cacaGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTCTCAGTACCCCCGATTTTCGGGCGGGTGCGCGTGTTCTACTCTTTTGCCTACGc > 2:233330‑M2/5‑150 (MQ=255) acaGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTCTCAGTACCCCCGATTTTCGGGCGCTTGCGTCTCTTCTACTCTTTTGCCTACGCa > 2:25510‑M2/4‑150 (MQ=255) ggTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTCTCAGTACCTCCGATTTTCGGGCGCTTGCGTCTCTTCTACTCTTTTGCCTACGCAGTc < 2:175368/150‑1 (MQ=255) | CATGGAGCACAAGCTGATCTGATTGCGACATACGGGTGCCCGAAACTTGCCGAAGCCTATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGGGCCTGGCCTGCTGATCTCTATGGCTGAGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTTCGTGGTTGGCTCGCAAGGGCATTCCAATCCCGCCATCCTTGTAGGGCGATCCCTACAACAAATCTTCCATCCGGATGATGGCATTCTCTCAGTACCCCCGATTTTCGGGCGCTTGCGTCTCTTCTACTCTTTTGCCTACGCAGTC > NC_002947/499138‑499433 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |