New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1340973 = | 54 (1.030) | 8 (0.160) | 8/238 | NT | 13.4% | coding (302/870 nt) | PP_1165 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1340994 = | 51 (1.000) | coding (281/870 nt) | PP_1165 | hypothetical protein |
TTATATGCAGGTCCAGGTTCAGGCACCCCTCATGCAGATGCACATCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGCGTACCACTTTCAAGTGCG > NC_002947/1340851‑1341143 | ttATATGCAGGTCCAGGTTCAGGCACCCCTCATGCAGATGCACATCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCAt > 2:217017/1‑150 (MQ=255) ttATATGCAGGTCCAGGTTCAGGCACCCCTCATGCAGATGCACATCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCAt < 1:1008500/150‑1 (MQ=255) ttATATGCAGGTCCAGGTTCAGGCACCCCTCATGCAGATGCACATCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCAt < 2:671007/150‑1 (MQ=255) atatGCAGGTCCAGGTTCAGGCACCCCTCATGCAGATGCACATCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATgg < 1:609275/150‑1 (MQ=255) atGCAGGTCCAGGTTCAGGCACCCCTCATGCAGATGCACATCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGAt > 2:827729/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCCAGGTTCAGGCACGCCTCATGCAGATGCACATCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCCCTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCg > 2:839051/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCCAGGTTCAGGCACCCCTCATGCAGATGCACATCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCAt < 1:833404/144‑1 (MQ=255) gCAGGTCCAGGTTCAGGCACCCCTCATGCAGATGCACATCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCAt > 2:833404/1‑144 (MQ=255) gCAGGTCCAGGTTCAGGCACCCCTCATGCAGATGCACATCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCg > 1:1152713/1‑150 (MQ=255) ggTCCAGGTTCAGGCACCCCTCATGCAGATGCACATCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGt < 2:1152713/150‑1 (MQ=255) tCCAGGTTCAGGCACCCCTCATGCAGATGCACATCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTaa < 1:409584/150‑1 (MQ=255) cAGGTTCAGGCACCCCTCATGCAGATGCACATCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAgg > 1:302774/1‑150 (MQ=255) cAGGTTCAGGCACCCCTCATGCAGATGCACATCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAgg < 1:1059957/150‑1 (MQ=255) cAGGTTCAGGCACCCCTCATGCAGATGCACATCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAgg < 2:562673/150‑1 (MQ=255) cAGGTTCAGGCACCCCTCATGCAGATGCACATCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAgg > 1:633197/1‑150 (MQ=255) ccccTCATGCAGATGCACATCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGt > 1:1196940/1‑150 (MQ=255) ccTCATGCAGATGCACATCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTAt < 1:934195/150‑1 (MQ=255) aGATGCACATCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGcc > 1:1220355/1‑150 (MQ=255) gcgagggtggctttgcccgacccgaggggtggcaggcactggcacccaataccgggcatgacccttacccgatccatggcagTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCAc > 1:166847‑M1/83‑104 (MQ=255) gcgagggtggctttgcccgacccgaggggtggcaggcactggcacccaataccgggcatgacccttacccgatccatggcagTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCAc < 2:166847‑M1/22‑1 (MQ=255) cacaTCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGtgc < 1:827729/150‑1 (MQ=255) acaTCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGtgcc > 2:1215192/1‑150 (MQ=255) gagggtggctttgcccgacccgaggggtggcaggcactggcacccaataccgggcatgacccttacccgatccatggcagTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCa > 2:100946‑M1/81‑107 (MQ=255) gagggtggctttgcccgacccgaggggtggcaggcactggcacccaataccgggcatgacccttacccgagccatggcagTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCa < 1:100946‑M1/27‑1 (MQ=255) aTCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGCCATGCCCGGTAtt < 2:147325/135‑1 (MQ=255) aTCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGCCATGCCCGGTAtt > 1:147325/1‑135 (MQ=255) tCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGtgcctgc < 2:1220355/150‑1 (MQ=255) tCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGtgcctgc > 1:591907/1‑150 (MQ=255) cGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCAccc < 1:392952/150‑1 (MQ=255) cGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCAccc < 2:591907/150‑1 (MQ=255) cccGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCtcgg < 2:1196940/150‑1 (MQ=255) cGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGcc > 1:466110/1‑92 (MQ=255) cGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGcc < 2:466110/92‑1 (MQ=255) cGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCtcgggt > 1:923569/1‑150 (MQ=255) ggTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGtgcctgc > 2:1013049/1‑137 (MQ=255) ggTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGtgcctgc < 1:1013049/137‑1 (MQ=255) gTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCtcgggtcg < 1:540116/150‑1 (MQ=255) cAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCAt < 2:1070371/87‑1 (MQ=255) cAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCAt > 1:1070371/1‑87 (MQ=255) cAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCaa > 1:456235/1‑150 (MQ=255) cacaGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGCTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCAcc < 2:923569/150‑1 (MQ=255) tGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCaa < 2:456235/150‑1 (MQ=255) tAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCa > 1:151028/1‑67 (MQ=255) tAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCa < 2:151028/67‑1 (MQ=255) tAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCg > 1:721040/1‑150 (MQ=255) aGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGAc > 1:1212174/1‑150 (MQ=255) gCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCa > 1:718855/1‑150 (MQ=255) tGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCACTGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGt > 1:1067123/1‑150 (MQ=255) tGTTCACTGTGGTGCGCCATCTGCCAGGCCTGGTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCCTGCTCGACATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGt < 1:1314581/150‑1 (MQ=255) cTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAg < 1:217017/150‑1 (MQ=255) gtgCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCtc < 1:551146/90‑1 (MQ=255) gtgCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCtc > 2:551146/1‑90 (MQ=255) tggcagtgcctggcagcaggcctggcaCTGCCATGGCTCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTc < 1:100946‑M2/80‑1 (MQ=255) tggcagtgcctggcagcaggcctggcaCTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTc > 2:100946‑M2/28‑107 (MQ=255) ccACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCaggcgaggc < 1:1215192/150‑1 (MQ=255) aCCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGcgt > 2:1166203/1‑150 (MQ=255) gtgcctggcagcaggcctggcaCTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGc < 2:166847‑M2/82‑1 (MQ=255) gtgcctggcagcaggcctggcaCTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGc > 1:166847‑M2/23‑104 (MQ=255) cTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGcgtcg > 2:518825/1‑150 (MQ=255) cTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCATCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGcgtcg > 1:47106/1‑150 (MQ=255) tgcctggcagcaggcctggcaCTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCa > 1:208124‑M2/22‑74 (MQ=255) tgcctggcagcaggcctggcaCTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCa < 2:208124‑M2/53‑1 (MQ=255) CCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTgg < 2:746786‑M1/150‑1 (MQ=255) CAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAACGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGTGTCGCGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGc > 1:839051‑M1/1‑150 (MQ=255) ggCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGCGt > 1:495952/1‑150 (MQ=255) caggcctggcaCTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCgg < 2:209706‑M2/90‑1 (MQ=255) caggcctggcaCTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCgg > 1:209706‑M2/12‑101 (MQ=255) gcCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCGCCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCCGTGGGTAGCAGGCCAGGCGTCGTGGCGTACCACttt < 2:633197/150‑1 (MQ=255) ccAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGCGTACCACTTTc > 1:1219090/1‑150 (MQ=255) aCTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCa < 2:56350‑M2/106‑1 (MQ=255) aCTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCa > 1:56350‑M2/2‑107 (MQ=255) aCTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGCGTACCACTTTCAAGTGc > 1:171807‑M2/2‑150 (MQ=255) cTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCACAGCCACCATCGCCAATGCGGTTGGCCCAAGGCCACAGCGGGTAGCAGGCGAGGGGGCGTGGCGTACCACTTTCAAGTGCg < 2:1231656/150‑1 (MQ=255) | TTATATGCAGGTCCAGGTTCAGGCACCCCTCATGCAGATGCACATCCAGCGTGGCCCGGTAAGCAAACGGCACAGCACTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGCGTACCACTTTCAAGTGCG > NC_002947/1340851‑1341143 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |