Predicted mutation | |||||||
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MC JC | NC_002947 | 1,385,534 | Δ69 bp | 100% | coding (861‑929/1266 nt) | oprD ← | basic amino acid specific porin OprD |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | NC_002947 | 1385534 | 1385602 | 69 | 76 [0] | [0] 76 | oprD | basic amino acid specific porin OprD |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_002947 | = 1385533 | 0 (0.000) | 69 (1.390) | 53/232 | NT | 100% | coding (930/1266 nt) | oprD | basic amino acid specific porin OprD |
? | NC_002947 | 1385603 = | 0 (0.000) | coding (860/1266 nt) | oprD | basic amino acid specific porin OprD |
TTCAGGTCGTAGCGAGCCTGCCAGGATTTCTCGTCTTCGGCGTTGAAGTCGGAGCGGGCCACGGAGTTGGCCAGGAAGATGGTGCCGCCACCGTCGATACCATAACCATAGTCGCCGTCGCCGGTGACTTTCTGGTAGGCCAGGGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAGGCGCCCGACAGGCTGAACGCGCGGTTGTCCAGCTTGTCGCCATCGAAGGCGCGGTACTCGGCAGAGCCTTCGCTCTTGGTGTCATAGATGTTGAAGTCGAACACCAGGCCTTGATTGTCG > NC_002947/1385459‑1385749 | acgttggcgtcggaaccgcgtacataacgggtcatgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAg < 1:1103326‑M2/6‑1 (MQ=255) gttggcgtcggaaccgcgtacataacgggtcatgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGgt > 1:307711‑M2/143‑150 (MQ=255) gcgtcggaaccgcgtacataacgggtcatgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGa > 2:1325578‑M2/139‑150 (MQ=255) gtcggaaccgcgtacataacgggtcatgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAgc > 2:68361‑M2/137‑150 (MQ=255) gaaccgcgtacataacgggtcatgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCg > 1:273391‑M2/133‑150 (MQ=255) ccgcgtacataacgggtcatgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGAtg > 1:1346137‑M2/130‑150 (MQ=255) cgcgtacataacgggtcatgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGaa < 2:800529‑M2/5‑1 (MQ=255) cgcgtacataacgggtcatgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGaa > 1:800529‑M2/129‑133 (MQ=255) gcgtacataccgggtcatgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGAtgtt < 1:935971‑M2/23‑1 (MQ=255) gcgtacataacgggtcatgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGAtgtt < 2:924230‑M2/23‑1 (MQ=255) gcgtacataacgggtcatgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGAtgtt > 2:1236342‑M2/128‑150 (MQ=255) acataacgggtcatgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAg > 1:1002665‑M2/124‑150 (MQ=255) acataacgggtcatgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAg > 2:941084‑M2/124‑150 (MQ=255) cataacgggtcatgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAgg < 2:1144254‑M2/28‑1 (MQ=255) cataacgggtcatgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcgtcggcgttgaagtcggtgcgggccatggagttggccaggGGGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAgg > 1:1288332‑M2/123‑150 (MQ=255) ataacgggtcatgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAGgc > 2:521189‑M2/122‑150 (MQ=255) aacgggtcatgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAGgcgc > 1:242912‑M2/120‑150 (MQ=255) tcatgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAGGCGCCCGACa < 1:521189‑M2/37‑1 (MQ=255) atgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAGGCGCCCGACAgg > 1:592564‑M2/112‑150 (MQ=255) atgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAGGCGCCCGACAgg > 2:267563‑M2/112‑150 (MQ=255) tgaaggtcaggcctggaattccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAGGCGCCCGACAGGc < 1:83599‑M2/40‑1 (MQ=255) tgaaggtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAGGCGCCCGACAGGc < 2:1205157‑M2/40‑1 (MQ=255) gtcaggcctggaatgccgtattcggcgaagttcaggtcgtagcgagcctgccaggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAGGCGCCCGACAGGCtgatc < 1:765268‑M2/45‑3 (MQ=255) 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aggatttctcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAGGCGCCCGACAGGCTGAACGCGCGGTTGTCCAGCTTGTCGCCATCGAAGGCGCGGTACTCGGCAGAGCCtt > 1:894959‑M2/54‑150 (MQ=255) gattcatcgccttaggcgttgaagacggagcgtgccacggagtttgctaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAGGCGCCCGACAGGCTGAACGCGCGGTTGTCCAGCTTGTCGCCATCGAAGGCGCGGTACTCGGCAGAGCCTTCg < 2:307711‑M2/99‑1 (MQ=255) tcgcctcttcggcgttgatttcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAGGCGCCCGACAGGCTGAACGCGCGGTTGTCCAGCTTGTCGCCATCGAAGGCGCGGTACTCGGCAGAGCCTTCGctct > 2:1307490‑M2/48‑150 (MQ=255) tcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAGGCGCCCGACAGGCTGAACGCGCGGTTGTCCAGCTTGTCGCCATCGAAGGCGCGGTACTCGGCAGAGCCTTCGCTCTTg < 1:511983‑M2/105‑1 (MQ=255) tcgtcttcggcgttgaagtcggagcgggccacggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAGGCGCCCGACAGGCTGAACGCGCGGTTGTCCAGCTTGTCGCCATCGAAGGCGCGGTACTCGGCAGAGCCTTCGCTCTTg < 2:882347‑M2/105‑1 (MQ=255) 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ggagttggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAGGCGCCCGACAGGCTGAGCGCGCGGTTGTCCAGCTTGTCGCCATCGAAGGCGCGGTACTCGGCAGAGCCTTCGCTCTTGGTGTCATAGATGTTGAAGTCGAACACCAGGcc > 1:1417394‑M2/14‑150 (MQ=255) ggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAGGCGCCCGACAGGCTGAACGCGCGGTTGTCCAGCTTGTCGCCATCGAAGGCGCGGTACTCGGCAGAGCCTTCGCTCTTGGTGTCATAGATGTTGAAGTCGAACACCAGGCCTTGAtt > 2:706569‑M2/8‑150 (MQ=255) ggccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAGGCGCCCGACAGGCTGAACGCGCGGTTGTCCAGCTTGTCGCCATCGAAGGCGCGGTACTCGGCAGAGCCTTCGCTCTTGGTGTCATAGATGTTGAAGTCGAACACCAGGCCTTGAtt < 2:848950‑M2/143‑1 (MQ=255) gccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAGGCGCCCGACAGGCTGAACGCGCGGTTGTCCAGCTTGTCGCCATCGAAGGCGCGGTACTCGGCAGAGCCTTCGCTCTTGGTGTCATAGATGTTGAAGTCGAACACCAGGCCTTGATTg > 2:1193186‑M2/7‑150 (MQ=255) ccaggGTGAAGGTGTGAGCGCCGATGTTGTAGGCGCCCGACAGGCTGAACGCGCGGTTGTCCAGCTTGTCGCCATCGAAGGCGCGGTACTCGGCAGAGCCTTCGCTCTTGGTGTCATAGATGTTGAAGTCGAACACCAGGCCTTGATTGt < 1:267563‑M2/145‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |